在小智獲得彩虹徽章之後，三人離開彩虹市，他們朝著淺紅道館前進。
三人通過地圖的指示繼續向前進發，他們現在所在一個叫迷幻市的城市，這裏的建築和彩虹市有的一拚，到處都是高樓大廈，讓三人都感到茫然無措。
三人剛準備商討接下來先在哪落腳，突然一個時髦、豐盈的大媽一把將小智抱進懷中，嘴中不斷呼喚她兒子小一的名字。
她看到失蹤多久的兒子突然出現在她麵前，顯得異常激動，有種失而複得的艱辛。
小智被這突如其來的阿姨給搞迷糊了，她被阿姨熱情的擁抱快要窒息了，阿姨胸前那兩對寶貝差點讓他無法呼吸。
身旁的小霞、小剛兩人感到困惑不已，這個阿姨是不是認錯人了？
小智在阿姨懷中不斷掙紮，顯得快要窒息了，阿姨感到了懷中的異動，連忙鬆開了手
死裏逃生的小智喘著呼吸，對著阿姨說：“阿姨你認錯人了，我叫小智不叫小一”身後的小霞兩人關心小智，問他是否要緊
小智搖了搖頭，對麵聽到小智說話的阿姨聽聞後麵露悲傷
她向小智道歉：“不好意思，小智，你長的太像我的兒子小一了
阿姨一時太過於激動了，給你添麻煩了，我很抱歉，小智”說完她又抽泣起來，她可憐的兒子小一到底在哪裏啊？
小智三人麵麵相覷，這阿姨也太可憐了吧，兒子丟了，這座城市看來不太安全啊！！！
小智三人連忙安慰阿姨，小智想到作為母親的不容易，他想到媽媽花子也對他是操心不已
他對阿姨道：“阿姨。我沒事，你不要傷心，你請放心，我們幫你一起尋找小一的下落”
原本還在抽泣的阿姨聽到小智這麼說，停止了哭泣：“真的嗎？”她顯得不太相信
小智三人點點頭，看到三人點頭答應，阿姨連忙感激小智他們。
正當他們打算尋找小一時，開著警車的君莎小姐駛過他們麵前
她從車上下來，手上又拿出一張失蹤人口的畫像和訊息，她將這張畫像再次貼在牆上。
隻見牆上已經貼滿了失蹤人員的畫像，上麵都是這段時間失蹤的年輕的少男少女，
阿姨告訴小智等人，她的小一也在其中和其他的孩子一樣突然失蹤。
小智讓阿姨回家等消息，他們會幫她找到小一的，阿姨放心的點點頭便離開了
三人走向正在貼海報的君莎小姐麵前，熱情的協助君莎小姐張貼海報，忙完工作的君莎小姐感謝小智三人的幫助
小智向君莎小姐詢問失蹤人口的進展，一邊的君莎小姐歎了口氣
一說這個她便產生一股無力，這麼久了失蹤人數越來越多，偏偏沒有任何線索，她現在也是一頭霧水，焦躁不安，壓力山大啊！！！
小智三人聽到這起案件的棘手，不由皺了皺眉，不過既然答應阿姨幫她尋找兒子，三人便不會食言。
小智三人懇請君莎小姐能夠讓他們協助調查，君莎小姐看到三人真摯的眼神
想道：“算了，多一份力量，多一分希望，說不定真能找到什麼線索”她點了點頭
見到君莎小姐答應，小智三人鬆了口氣
君莎小姐告誡他們協助她可以，但是可不能給她添亂，三人趕忙點點頭。
君莎小姐帶他們去失蹤前的地點去尋找線索，四人來到當地的寶可夢中心詢問在場的人員
經過多番打聽，從當地的人群中了解到失蹤的人們出現在過精靈中心
在經過向寶可夢中心的護士小姐的問詢，發現寶可夢中心也發生了一起怪事。寶可夢中心很多的寶可夢們都無精打采，失去了活力。
小智三人和君沙小姐對此將這類事件和人口走失事件相關聯，還未仔細搜尋，君沙小姐腰帶上攜帶的感應器發出響動，收到未知的信號。
君沙小姐對此並不吃驚，她已經見怪不怪了。她告訴好奇的小智三人，最近總是有些莫名的電波傳到本市，這信號十分隱蔽，來也匆匆，去也匆匆，讓人摸不著頭腦
君沙小姐沒想到這個信號也出現在了精靈中心，還未等待她深究原因，信號源便突兀的消失不見了