寶可夢聯盟馬上就要開幕了，小智在收服了巨大大岩蛇後就在真新鎮裏修整，做最後的特訓，在這兩個月時間當中，小智的所有的寶可夢都行動起來了，每隻寶可夢都得到了飛速的進步，為了能夠在這最後關頭快速提升寶可夢的實力，他通過金錢購買了大量的能量方塊，幫助它們飛速成長。
寶可夢它們也非常努力，小智在原野區很多收服的寶可夢們都已經進化了。在收服之前，這些寶可夢的等級都很高，都有20級的實力，順便補充一句，這個世界不跟遊戲世界的寶可夢一樣，收服後精靈的等級便會重置，而在這個世界寶可夢收服的等級是多少，目前顯示的等級便是多少。
現在特訓的成果十分明顯，所有寶可夢都有很大的提升，同時又在亞米查山上收服了一隻等級高達35級的巨大大岩蛇，它也將會成為小智聯盟大會上的一大助力。
現在小智的寶可夢等級如下，皮卡丘37級、大岩蛇35級、噴火龍35級、妙蛙草、卡咪龜33級，距離進化已經很接近了，比比鳥32級，大針蜂、巴大蝴31級，暴鯉龍28級、臭臭泥27級、巨鉗蟹27級，大鉗蟹在上次達到26級便進化了。
原野區的鐵甲犀牛、口呆花等等都已經進化了，鐵甲暴龍、大食花、阿伯蛇、穿山王、隆隆石等等都達到了進化的等級26級，這些寶可夢都多虧了小智的能量方塊，才得以提前進化。
現在小智手上的隊伍中大多都已26級，隻剩下一些臨散幾隻未達到，在重新向大家梳理一遍小智目前的四大梯隊
第一梯隊：皮卡丘、鐵甲暴龍、卡咪龜、巴大蝴、大岩蛇、大食花
第二梯隊：噴火龍、肯泰羅首領、大針蜂、巨鉗蟹、臭臭泥、呆河馬
第三梯隊：妙娃草、尼多力諾、比比鳥、鬼斯、袋龍、可達鴨
第四梯隊：暴鯉龍、隆隆石、烈雀、阿伯怪、穿山王、蛋蛋
陣容重新調整了一番，隻等聯盟大會開賽就讓它們都能夠上場參賽，目前除了這24隻，還有吸盤魔偶、波克比、兩隻肯泰羅、不服管教的化石翼龍和嘟嘟利，共計30隻寶可夢。這些就是小智旅行了半年的全部家當了。
小智三人來到大木博士家中，準備和大木博士告別，聯盟大會還有一星期的時間就要開始了，他將趕緊趕到那邊去才行，和大木博士交流完，他們收拾行李和媽媽-花子告別了
大木博士和媽媽花子都出現在屋門前，看著他們又繼續出征，兩人希望下次和小智再見麵便是聯盟大會的決賽場上了，花子也歡迎小霞他們再來玩，尤其是小霞。
三人再度出發，朝著石英高原的比賽場地前進，小剛手拿著地圖帶著小霞、小智兩人穿過快有人高的草叢，隻要穿過這裏，很快就能到達石英高原了
三人在前麵走著，突然發現了一個黑影，疑惑帶著警惕得望著前方，那道身影突然從這小智三人衝來，那是一位穿著武士服的少年，他和小智一樣都是要前往石英大會，小智知道這個倒黴蛋-哉藏，他想要和小智決鬥，原因是他的寶可夢徽章全部丟了，沒有寶可夢徽章便失去了參加石英大會的參賽資格。