在柯南和怪盜基德的共同努力下，他們揭露了一個名為“暗影組織”的邪惡勢力。這個組織企圖利用“藍色奇跡”水晶的神奇力量來實現他們的野心。為了守護世界和平，柯南和他的朋友們決定聯手對抗暗影組織。
在調查過程中，柯南發現毛利蘭、灰原哀和鈴木園子也都因為不同的原因，被卷入了這場危機。為了讓朋友們遠離危險，柯南決定獨自深入敵陣，調查暗影組織的秘密。
在暗影組織的總部，柯南發現了一個神秘的實驗室。在那裏，組織成員正利用“藍色奇跡”水晶研製一種具有超強能量的武器。如果讓這種武器落入邪惡之手，後果將不堪設想。
在實驗室裏，柯南意外地重逢了闊別已久的女友毛利蘭。原來，毛利蘭為了尋找失蹤的柯南，也被暗影組織捉住了。兩人激動地擁抱在一起，發誓無論遇到什麼困難，都要共同麵對。
在毛利蘭的幫助下，柯南成功找到了關閉實驗室的機關。然而，正當他們準備逃離時，暗影組織的首領突然出現，擋住了他們的去路。
首領冷笑著告訴柯南和毛利蘭，他們已經激活了水晶的力量，現在世界正處於毀滅的邊緣。隻有獻祭擁有純淨之心的人，才能讓水晶的力量恢複平衡，拯救這個世界。
首領將毛利蘭綁在祭壇上，準備將她獻祭給水晶。柯南拚命抵抗，卻無法阻止首領的行動。在危急關頭，柯南能否找到辦法拯救毛利蘭，阻止暗影組織的陰謀？
在危急關頭，柯南突然想起了鈴木園子曾經提到過的一個傳說。傳說中，隻要集齊三塊神奇的寶石，就能釋放出足以對抗任何邪惡力量的能量。
柯南靈機一動，迅速從口袋中掏出了此前收集到的兩塊寶石——“紅色的熾焰”和“綠色的希望”。再加上“藍色奇跡”水晶，三塊寶石終於團聚。
柯南將三塊寶石放在祭壇上，默默地祈禱。刹那間，寶石發出了刺眼的光芒，一股強大的能量席卷了整個實驗室。暗影組織的首領和其他成員都被這股力量震飛，無法再靠近柯南和毛利蘭。
祭壇上的毛利蘭感受到了水晶中釋放出的溫暖力量，她的心中充滿了勇氣。她堅定地告訴柯南，無論遇到什麼困難，他們都不會放棄，一定會守護這個世界。
隨著光芒逐漸消散，水晶的力量恢複了平衡。暗影組織的陰謀被挫敗，世界再次回歸和平。柯南和毛利蘭緊緊地擁抱在一起，為他們的重聚和勝利而欣喜。
在之後的日子裏，柯南、毛利蘭、灰原哀、鈴木園子和怪盜基德繼續守護著他們所珍視的一切。在麵對各種挑戰時，他們的友誼和愛情成為最堅實的支柱，支撐他們不斷前行。
在這個漫長的夏天，柯南和他的朋友們共同譜寫了一段難忘的傳奇。這段傳奇將成為他們青春歲月裏永恒的回憶，永遠閃耀著！？