宮野誌保，一位擁有非凡天才智商的少女。在她還是高中生時，就被招募進入黑衣組織，成為其中一員。她的姐姐宮野明美也曾是組織的成員，但在背叛組織後被殺。為了完成姐姐的遺願，宮野誌保決定脫離組織，過上正常人的生活。
在一次行動中，宮野誌保服下自己研發的神秘藥物——APTX4869，卻意外縮小成了小學生的模樣。她化名為灰原哀，寄宿在毛利偵探事務所。在這裏，她結識了少年偵探柯南。
柯南本名工藤新一，曾是一位聞名遐邇的高中生偵探。他在一次追查黑衣組織時，被灌下了APTX4869，同樣縮小成了小學生的模樣。從此，兩人共同踏上了尋找解藥、對抗組織的冒險之旅。
在與柯南朝夕相處的過程中，宮野誌保感受到了前所未有的溫暖與關愛。柯南的勇敢、智慧和善良讓她逐漸打開了心扉，從而產生了微妙的情感變化。然而，宮野誌保深知，作為組織的叛徒，自己的處境十分危險，她必須時刻保持警惕。
某日，宮野誌保收到了一封匿名信。信中稱，知道她叛逃組織的真相，要求她在指定時間和地點見麵，否則將向組織告發她。麵對這樣的威脅，宮野誌保決定獨自赴約，以保護身邊的人。
約定的地點在一處廢棄倉庫。宮野誌保準時到達，卻發現那裏空無一人。她正感到疑惑時，一個熟悉的聲音從背後響起。
“宮野誌保，你終於來了。”
宮野誌保轉身一看，竟是柯南。她驚訝地問道：“柯南，你怎麼會在這裏？”
柯南笑了笑，解釋道：“這封信是我寫的，因為我擔心你的安全。我想，如果有什麼危險，我可以隨時保護你。”
宮野誌保心中湧起一陣暖流，她看著柯南，眼神中充滿了感激和感動。然而，她也明白，柯南的出現可能會讓他們陷入更大的危機。
“柯南，謝謝你，但我不能拖累你。”宮野誌保堅定地說，“我會處理好自己的事情，請你相信我。”
柯南點了點頭，他知道宮野誌保的性格，便不再堅持。他默默地站在宮野誌保身後，陪她一起等待那個神秘人物的出現。
在這個緊張的時刻，兩人的心卻從未如此靠近。他們共同麵對著未知的挑戰，心中堅定著彼此的信任和依靠。而這份情感，也將成為他們繼續前行的力量。
在廢棄倉庫中等待了一段時間後，宮野誌保和柯南終於看到了一個神秘的身影。那個人穿著黑色風衣，頭戴黑色帽子，臉上還戴著墨鏡，讓人無法看清他的容貌。
“你找我有什麼事？”宮野誌保鎮定地問道。
神秘人物冷笑一聲，說道：“宮野誌保，你竟然還有膽量出現在這裏。”
宮野誌保心中一沉，她知道這個人肯定與組織有關。她深吸一口氣，試圖保持冷靜。
“你是組織的人？”宮野誌保試探性地問道。
神秘人物沒有直接回答，而是說道：“宮野誌保，你知道背叛組織的下場嗎？”
宮野誌保堅定地回答：“我知道，但我已經做好了準備。如果你有什麼目的，就直說吧。”
神秘人物拍了拍手，讚賞地看著宮野誌保，“很好，不愧是宮野家的女兒。我喜歡和勇敢的人打交道。”
說完，神秘人物摘下墨鏡，露出了他的真麵目。柯南和宮野誌保都大吃一驚，因為他們認出了這個人——貝爾摩德。
貝爾摩德，組織裏的重要成員之一，擅長易容和變聲。她一直是柯南和灰原哀最危險的敵人之一。
“你們一定很驚訝吧？”貝爾摩德微笑著說，“不過，請放心，我今天不是來抓捕你們的。”