然而，與之形成鮮明對比的是，曾經備受矚目的墨丘利衛星此刻卻顯得黯然失色。由於長期缺乏必要的維護工作，它目前僅能以低功率模式勉強運行。其實際威力與最初設計時所預期的相差甚遠，甚至可以說幾乎無法發揮出應有的作用，隻能被用作清理聚集起來的步兵堆的作用。
盟軍迅速將天氣控製儀投入到對厄普西隆的戰鬥中。位於中南美洲的心靈信標以及其他處於天氣控製儀打擊範圍之內的厄普西隆重要設施紛紛遭到了閃電風暴襲擊。那一道道劃破長空的耀眼閃電猶如天神之怒，帶著毀滅一切的力量傾瀉而下，給厄普西隆造成了巨大的損失。
一段時間後，悖論遠征軍最近發現厄普西隆的狀況有所變化，非洲的天蠍組織開始收縮起了防線不再和盟軍爭奪非洲的豐厚資源，看來他們放棄了和盟軍的戰事。而心靈軍團和總部守衛在非洲地區的活動明顯增多，看來他們準備在這裏開展大規模的軍事行動。
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而不久之後，盟軍便收到了一個由美軍部隊發出的求救信號這些美軍現在位於美國海外領地波多黎各的首府聖胡安。早在第三次世界大戰中，波多黎各就被拉丁同盟的部隊攻占了，而在尤裏崛起後，心靈軍團又控製了當地的拉丁同盟部隊並借此徹底占領了波多黎各。
現在，這些在聖胡安聚集的美軍幸存者已是陷入絕境之中。如果放任不管的話， 他們要麼會被心靈控製變成傀儡，要麼會被心靈軍團和拉丁同盟的部隊消滅。悖論遠征軍中，美軍部隊的規模並不是很大，而美國本土的反抗軍在一次失敗的行動之後也鮮有條件離開本土加入悖論遠征軍的行列。為了擴充盟軍自身的實力，團結一切力量，太平洋陣線的指揮官決定去營救他們。
聖胡安市有一座橋，這是當地美軍撤離的唯一途徑。根據偵察，盟軍還在這座城市中發現了一座廢棄的基地。駐守聖胡安的指揮官決定先派遣兩支突擊隊滲透入市區內收回廢棄的基地，然後借此聯係大部隊進行支援，一同協助美軍幸存者安全撤退。
波多黎各，聖胡安。詹姆斯警長呼出一口煙，將雪茄在煙灰缸中掐滅。起身拿起那頂警長帽戴在頭上，將胸前的警徽再擦拭了一遍。“情況終於有改變了麼？”詹姆斯警長早已絕望的心中在悖論遠征軍到來後燃起了希望。
“全體集合！”詹姆斯警長對著手下的士兵們喊道，“悖論遠征軍的友軍已經抵達，我們要配合他們的行動，確保這次撤離計劃能夠順利進行！”他已經很久沒有這麼激動過了。
聖胡安南部近海，兩隊太平洋陣線的隊伍偷偷潛入了這裏。“總部需要我們奪取這裏的航站大樓，那裏是控製離開這裏唯一一條大橋的建築。”
簡單交代完初期任務後，太平洋陣線部隊開始了行動。反轉士和突擊隊員們潛入了厄普西隆的控製區內。
厄普西隆的部隊徹底心控了此地的拉丁同盟部隊。在克什米爾核爆後，世界上編製最完整的拉丁同盟部隊已經成了厄普西隆的傀儡軍團。
兩隊滲透小隊首先前往了西南角的戰俘營，那裏被囚禁著一隊被厄普西隆俘虜的鎮暴部隊。
反轉士的反轉力場為盟軍的推進了新的方式。反轉力場消除磁暴線圈的傷害，突擊隊員們可以頂著已經無害化的電流在磁爆線圈上安裝炸彈，炸掉線圈後繼續前進。
“感謝上帝，我們終於得救了。”獲救的鎮暴部隊重新戴上裝備
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