元軍在東關被安南兵連放毒箭，許多將士身受重傷，包好傷口再戰，還是殺不退敵兵。阿八赤、樊楫兩個人保住脫歡先走，隻想闖過東關。沒想到安南兵都專門朝大旗殺來，勢不可擋，任憑阿八赤、樊楫等人奮力衝殺，都無路可走。阿八赤對脫歡說：“王爺顧命要緊，必須馬上裝扮成兵士，不要讓敵軍注意，方便逃生。我們願誓死報國！”脫歡隻得卸下戰袍，帶著親兵，混到軍隊人馬裏，找機會逃走。阿八赤、樊楫兩人先後戰死。脫歡正要衝出重圍，安南兵又追殺上來。幸虧先鋒蘇都爾率領精兵回身奮戰，才將安南兵截住。脫歡窮極智生，不走大道，隻往偏僻小路逃，才保全性命。
到了思明州，敗軍開始陸續趕來。脫歡仔細檢查，十之五六的傷亡，比上次損失還要多加一倍。脫歡非常惱喪，隻好如實上奏。元世祖聽到脫歡兩次大敗，勃然大怒，下詔斥責，命他留守揚州，終身不準覲見。元世祖打算另選良將，改日再出征。
不久，安南派來使者，獻上一座金人雕像，並且以謙卑的言辭謝罪。元廷雖連年用兵，卻多半無功而返。隻有親王相答吾兒以及右丞台布等人，分道進攻緬國，還算得手，收降了西南夷人十二部大軍，直指緬城。緬國就是今天的緬甸，與雲南接壤，當時國王聯絡附近各部落，聲勢浩大。後來被元兵打敗，逃到白古。此後緬國派人求降表示願意納歲貢，元軍才撤軍。周邊的印度、暹羅及南洋群島等部落，也聞風納貢，元朝的威武算遍及西南了。
元世祖雄心不減，又準備儲備糧餉，再征日本與安南。由於經費問題，有個盧世榮自稱善於理財，於是元世祖提他為右丞相。盧世榮濫發錢鈔，專權攬勢，坑害官員和百姓。後來陳天祥上奏彈劾，元世祖才召盧世榮上朝對質，並親自審訊，一一核實他的罪行，然後下令處死。
天下事福無雙至，禍不單行。盧世榮剛剛斬首，皇太子偏又病重。這位皇太子就是真金，生病的原因還要從王著誘殺阿合馬說起，事情發生後真金心中很是不安。到了至元二十二年，忽然有南台禦史上奏請求元世祖禪位。大臣以為元世祖精神矍鑠，必定不會準奏，於是將奏折擱起。當時盧世榮權勢正大，任用阿合馬餘黨，竟假公濟私，奏明太子密謀篡位，大臣擅自匿藏奏章；元世祖非常憤怒，隻因為太子素來盡孝，才勉強容忍，不加詰責。太子聽到這件事後，憂懼成疾，藥皆失效，不久便與世長別了。
元世祖正在悲傷，忽然西北一帶又傳來警報，竟然發生了一樁同族相殘的禍案，並逐漸釀成了分裂。於是元朝接連用兵，紛紛擾擾了好幾十年。實際這叛亂之源早就埋下了。原來，元太祖繼位到元世祖統一神州前後不過七十年，除了亞洲最北部、最南部外，全洲領土幾乎都為元朝所有，就連歐洲的東北部也是元朝的領域，元朝成了一個大帝國，自黃帝以來，是絕無僅有的。當時蒙古各個王族都分有領土，最大的有四國，分別如下：
（一）伊兒汗國。阿母、印度兩河以西，凡西方亞細亞一帶，都歸其管轄，也稱伊蘭王國。旭烈兀的子孫在此地稱王，都城在瑪拉固阿。
（二）欽察汗國。在伊兒汗國北方，東自吉利吉思荒原，西至歐洲馬加境，從禿納河下遊到高加索以北地區，全歸其管領，也稱金黨汗國。拔都的子孫在此地稱王，都城在薩萊。
（三）察合台汗國。在阿母河東麵以及西爾河東南，凡天山附近的西遼故土全歸其管領。察合台的子孫在此地稱王，都城在阿力麻裏。
（四）窩闊台汗國。凡阿爾泰山附近的乃蠻故土全歸其管領。窩闊台的子孫在此地稱王，以也迷裏附近作為根據地。
這四汗王國名義上屬於元朝統治，但一切內政都由他們自己處理。元世祖先建立阿母河行省，監製伊兒和欽察兩個屬國；又設置嶺北行省，監製窩闊台屬國；再設立阿力麻裏及別失八裏兩個元帥府，監製察合台屬國。還有一班皇族宗親，分別鎮守滿洲，因此又設立遼陽行省。元世祖本認為這樣內外約束，上下牽製，能夠長治久安，沒想到凡事都有相對性，這種製度也一樣。窩闊台汗國自從憲宗繼位後，心中一直憤憤不平。等元世祖繼位時，阿裏不哥挑釁，當時太宗的孫子海都成為窩闊台汗國的首領，曾經暗地幫助阿裏不哥，謀反元世祖。阿裏不哥兵敗陣亡，海都卻積蓄兵力，圖謀不軌。