在悖謬之島中，存在著各種從未見過的悖謬寶可夢。
不管是森林處，海岸邊，草地上，山地處，洞穴內。
這座島嶼專門為這些寶可夢提供了最合適的生存環境，因與外界隔離，所以極大多數人並不清楚這地方存在。
因為牽涉到了帕底亞地區，如果向外公開，會被戴上偷渡寶可夢的罪名。
悖謬寶可夢，這種寶可夢是近幾年才發現的新品種，它們實際上已經存在了很長一段時間，隻是外表與其他寶可夢極其相似，所以被誤解隻是受環境影響，外貌稍微有些改變。
但不單單是外貌不同，特性，種族值，技能，屬性也通通不同。
它事實上是另一種截然不同的寶可夢，隻是長得像而已。
關於悖謬寶可夢的研究，寶可夢研究員目前並沒有進一步了解，也隻是在一些可疑的雜誌上看見過相似的報告。
而悖謬寶可夢也被分為兩類，古代種寶可夢和未來種寶可夢。
古代種寶可夢的特性統一為古代活性，這一特性能夠在晴天天氣下增強自己的能力。
未來種寶可夢的特性統一為誇克充能，這一特性能夠在電氣場地下增強自己的能力。
悖謬寶可夢大多都集中在了帕底亞地區的帕底亞大坑中，也就是第零區，為何要將這些寶可夢集中在同一地方？
原因很簡單。
主要原因是為了防止它們破壞現代生態係統。這些寶可夢具有原始性和根源性的力量，同時也可能包含進化到極致的未知力量，這些力量如果進入帕底亞地區，可能會對那裏的生態係統造成不可逆的破壞。因此，隻能利用遍布在第零區的屏障來控製這些寶可夢，避免它們離開第零區。
盡管如此，仍有像雄偉牙和鐵轍跡這樣的寶可夢能夠突破屏障。
悖謬之島的管理者自然也明白這一道理，設置屏障不被人察覺的另一部分原因就是不能讓這些寶可夢離開島嶼。
雖然大部分悖謬寶可夢都在第零區和悖謬之島生存，但還有一小部分存在於外界，並且無人知曉。
因此當有人遇見悖謬寶可夢，並使用寶可夢圖鑒查找信息時，寶可夢圖鑒就會自動識別對方是否是悖謬寶可夢，並不會過多告訴寶可夢訓練家太多信息，隻是建議訓練家收服它。
這是為了借訓練家之手控製悖謬寶可夢，防止這些寶可夢過度幹涉環境。
悖謬寶可夢是個危險的存在，自身存在太多謎題。寶可夢聯盟對此封鎖了第零區，不輕易讓人進入，普通人根本沒機會進去，相關人員則是需要辦理一係列手續問題才能進入。
……
嘎啦嘎啦一邊在前方探路一邊揮舞著自己的骨頭，嘎啦嘎啦之所以這樣做是因為這裏的環境跟它熟知的阿羅拉地區環境有些相似，它自認為自己有能耐探路，好在小厭麵前耍酷。
\"嘎啦嘎啦，小心點，別出事了啊！\"小厭在背後提醒道。然而，嘎啦嘎啦似乎並沒有把這警告太當回事兒，隻是隨意地向後擺了擺手，表示自己已經聽到並且明白，然後便頭也不回地繼續在前方小心翼翼地探路。
看著嘎啦嘎啦漸漸遠去的身影，小厭無奈地搖了搖頭，抬手擦去額頭上豆大的汗珠。此時的她不僅感到身體異常疲憊，肚子還咕咕直叫，饑餓感如潮水般一波波襲來。但盡管如此，她清楚當務之急還是得盡快弄清楚這座神秘島嶼的狀況。
就在小厭拖著沉重的腳步緩緩前行時，突然感覺到身旁有什麼東西伸了過來。她定睛一看，原來是一條藤鞭正緊緊纏繞著一顆碩大的果實，朝著自己遞了過來。