在遙遠的未來。人類在荒廢的大地上建設了移動要塞都市“種植園”，十三都市。
一顆閃亮的星星劃過天空，13都市內部燈火通明，是“大人”們生活的地方。
在一個實驗室內部，“弗蘭克斯”之父--維爾納弗蘭克！他看著培養倉內的孩子，露出來欣怡的微笑。
這個孩子就是我們的主角--雷鳴，他在係統的精神空間看著外麵。
看著培養艙內的雷鳴博士笑了起來，說到:“哈哈哈，我終於成功了。你就是我和她的結合，完美，十分完美！哈哈哈。”
“放心，我會好好培養你的。”他隔著玻璃對雷鳴說。
他看著培養內的孩子，想起了以前…
在[對叫龍專用兵器FRANXX試作機啟動實驗第十三次]中，卡麗娜自願參與試驗，但在實驗中喪生，並認為這是詛咒。
在卡麗娜喪生多年後，他依然研究開發著FRANXX，並尋找著自己的心的寄托，被七賢人同意前往找尋叫龍的女王，並被要求無論如何都要拿到其DNA。
與叫龍的公主見麵後並未馬上被殺害，由於身上有叫龍同胞的氣味，被叫龍的公主認為死的代價對維爾納太過於便宜，因而當場咬斷了維爾納的左臂。
但維爾納已深深的戀上了叫龍的公主，被對方要求傳話，不許再傷害其同胞(叫龍)，認為自己或許已不能被稱之為[人類]。
擔著一切都是值得的，他利用自己獲得的叫龍公主DNA創造了兩個孩子，一個是隻用人類基因與叫龍基因結合的孩子，另一個就是雷鳴，他是由少量人類基因和叫龍基因與遠古基因的結合，遠古基因是人類在以前的化石中發現的，但人們以為沒有什麼用，認為隻是以前人類的骨頭罷了。
但博士卻認為沒有這麼簡單，於是在研首評究“弗蘭克斯”的時候也會研究一下化石，終於發現了化石體內的的細胞還活著十分活躍，於是就發現了遠古基因，有人嚐試把化石裏麵的基因移植到身上，結果無一例外都是死亡。
經過無數的實驗以及對博士更深層次的研究，他們發現了這個化石裏麵的細胞的基因是由無數的小基因所組成的！博士將它稱之為“神”之基因。
係統的精神空間內。
雷鳴詢問著大賢者，現在是什麼情況？
“答:主人你現在在維爾納弗蘭克博士的實驗室內。”
“那你現在有什麼可以使用的程序嗎？”
“答:目前的狀況隻有新手大禮包，係統商城和抽獎可以使用，其餘功能將達到一定年齡會自動解鎖。”
雷鳴看著係統麵板上的灰色圖標，這玩意兒對大千者說道:“領取新手大禮包！”
“叮~領取完成，恭喜主人獲得猩紅創痕（口罩)、魔彈猩紅創痕(衣服)、閃金衝鋒，盈淚之劍，霜之碎片，正義裁決者，抽獎次數×3、積分10000。”
“抽獎。”
一個巨大的老虎機出現在了雷鳴的麵前，按動三連抽按鈕，老虎機的屏幕開始快速旋轉！
當屏幕停下的時候！
“叮~三連抽獲得了【六眼】，矢量操作，界限突破！”
【六眼】:擁有特殊能力的眼睛。360度遠距離視覺，背後也能看到，隔著很遠也能看到。可以對軌跡進行直接追蹤/預測。
矢量操作:能夠操控能量方向，隻要經過皮膚碰觸，就可以自由操縱動能、熱能、電能等所有能量的方向，可以反射一切物理攻擊。
界限突破:可以突破身體的限製枷鎖讓自身的力量達到另一種層次的高度。
雷鳴看著上麵的介紹，將抽到的能力融合後便進入了自我沉睡的狀態。