小智獲得了勝利者杯的獎杯後就踏上了返家的旅程，在此之前小智也交換了手持的神奇寶貝，現在小智身上的六隻分別是皮卡丘、電擊怪、尼多蘭、乘龍、比雕、卡比獸
此刻他們已經到達了凸橙島，在這座島上小智他們認識了強哥，並且還得知了這個島到處都是頑皮彈，而強哥是被聘請來的地鼠訓練家，在這座島知道了聯絡船隻有在頑皮彈事件解決後才能到來之後，小智他們也開始幫助強哥，當然，火箭隊他們中途又來搗亂了，不過在強哥和小智三人的幫助下他們自然隻能是去體會‘好討厭的感覺’，旁晚，頑皮彈們終於全都移動到了凸橙島後方的草原，這座島上的那些人也回來了，隨後，小智他們告別了強哥，順利的搭上了真新鎮的聯絡船
“是真新鎮誒，我們終於回來了”，第二日，下了聯絡船後小智一行人站在高處看著遠方的城鎮的說道，“皮卡~”，皮卡丘也高興的叫道
“是啊，我記得這是我們從新出發後第一個見到的地方，是波波和比比鳥的森裏啊”，小霞也看著周圍說道
“真的耶，這裏好多波波和比比鳥啊，我要觀察下來”，小建又拿出了一個畫板，“嘰可布哩~”，波可比也感覺到一股懷念的味道
“大木研究所就在那裏啊，可以見到大木博士了，我好期待啊”，小建很快的就將波波他們畫了下來然後看著小智他們望著的城鎮說道，“我得把這些要請他看的報告先準備一下，要選哪一本呢，又不能請他全部看”，小建隨後又坐在地上，拿出一摞筆記本翻著
“我覺得你還是到我家後再選吧”，小智看著小建說道
“就是啊，還是快回去吧”，小霞也說道
“對啊，真是抱歉”，小建有些不好意思的說，隨後就和小智他們一起向小智的家裏走去了
“波~波~！”，“比~比~！”，就在小智他們回家的路上，森林裏傳來了波波和比比鳥的尖叫聲，聽到這道聲音，小智他們暫緩了回家的路程，決定去看一下到底是怎麼回事，畢竟現在離家已經很近了嘛
小智他們來到叫聲傳出的位置就看到兩隻大嘴雀帶著數隻烈雀襲擊波波和比比鳥他們，而在此之前波波他們好像並不知道，所以被打了一個措手不及，但是他們反應過來之後四隻特別突出的比比鳥也率領著自己的族群與大嘴雀他們鬥了起來，那四隻特別的比比鳥都去對付對麵的大嘴雀了，一隻大嘴雀由兩隻比比鳥盯防，其他的烈雀是由剩下的比比鳥和波波對抗，時間一久，比比鳥他們這邊占了上風，然後大嘴雀他們隻得落荒而逃
“真是的，那些大嘴雀還沒放棄啊”，小智看著那些逃走的大嘴雀說道
“怎麼回事？”，小建有點不明情況
“是這樣的，好像那些大嘴雀時不時的就來襲擊這裏，當初是我的噴火龍和比雕將它們打到了，但是因為當時的我狀態不怎麼好，沒有直接收服他麼解除後患，所以後來我把比雕傳送回去的時候和它說了有時間的話可以教導這裏的比比鳥他們讓他們的實力提高，所以之前被壓製的比比鳥他們現在才可以反擊了吧”，小智解釋道
“是呢，你當時狀態確實不怎麼好，好像自從你石英聯盟決賽之後狀態就一直不怎麼好啊”，小霞也是托腮說
“是啊，當時真是抱歉了，害你們擔心了”，小智也有點不好意思的說道
“沒什麼，你現在沒事就好了”，小霞很通情理，“皮卡！”，皮卡丘也是笑著回應小智
“砰”，小智他們談話的時候小智的一個寶貝球裏的神奇寶貝出來，那正是比雕，比雕出來後就和這些它的同類們問好
那些波波和比比鳥看到小智的比雕出現之後也紛紛圍了上去，看起來關係非常不錯，過了一會，出來了一隻比比鳥，如果仔細看，可以看得出來是當初給小智比雕MEGA石頭的那隻比比鳥
小智現在收起了波導之力，所以沒有聽懂比比鳥到底在講什麼，但是如果仔細去感受的話，還是可以知道這隻比比鳥的話中的一部分的
那隻比比鳥的就是在解釋當初為什麼會給小智的比雕MEGA石頭，這是因為這裏的MEGA石隻有比雕能用，而待在這座森林的波波和比比鳥並不願戰鬥，而且天賦不高，最多隻能達到比比鳥實力所能到達的頂點，而且不知為什麼從小智和他的比雕身上感受到了一股親切的力量（當時和原小智的比雕重疊了，他們的boss），所以才會給了小智那個MEGA石（總覺得之前給讓小智的PM獲得MEGA石總有點倉促，連個理由都沒有，之後我會盡量在之前為什麼得到這些東西加給理由）
比雕和比比鳥波波他們談了一些，然後比雕又教給了他們一些戰鬥技巧，小智看著時間不多，就讓比雕現在這裏待一會，覺得時間到了自己再回來，反正離得不遠嘛
“我回來了”，小智來到自己的家裏後喊道
“歡迎回來”，隻是裏麵傳出來的不是小智的媽媽花子的聲音，而是小剛的聲音
“啊，小剛？”，小智他們進屋後，小霞就看見小剛正在穿著圍裙幹活
“小智、小霞啊，好久不見了”，小剛回答小霞，“波可比好嗎，乖啊”，小剛又對波可比說道，“嘰可布哩~”
“說什麼乖啊，你為什麼會在這個地方”，小霞繼續問道
“你就是小建啊”，小剛沒有回答小霞的問題，而是對小建打招呼
“小剛，能再見到你我很高興哦”，小智也和小剛打招呼