轉眼已經到了十一月，漸入初冬，湯瑪琺的病況也穩定了下來，當我們以為能安靜一段日子的時候，鼇拜卻似乎已經不能再等下去，因為他再重提舊事，找了個由頭把中風的湯瑪琺再次送進大牢，會審了湯瑪琺等人，不久結果下來，鼇拜也借以廢除了新曆法。
康熙知道這事後怒不可遏，當時正在看書的他瞬間就把書本往地上扔去，連帶桌上的筆架、茶杯等東西全掃落在地上，一腔惱怒的說道﹕“這個鼇拜簡直是欺人太甚，湯瑪琺已經這樣，他還是不肯罷休嗎？”
我沒有回答，因為我已經無能為力，也許是有心無力了，反之二阿哥卻勸道﹕“現在發脾氣也沒用，湯瑪琺也不想你們為了他而跟任何人起衝突，現在隻能冷靜應對每一步，我相信老天是有眼的，絕不會讓這樣一個好人就這樣犧牲的。”
曹寅也跟著說道﹕“是啊！曹寅認為二阿哥說的有理。皇上，還記得湯瑪琺說的三慎嗎？”
“三慎？”康熙看了看曹寅，又看著我，我也朝二阿哥和曹寅看了看，也許他們說的是，半晌後才朝康熙點了點頭，低聲說道﹕“現在確實是需要這三個慎。”
康熙想力挽狂瀾，卻又礙於自己還沒有親政，結果他去求助冰月格格和孔公主，想借她們說服太皇太後，結果終於求得太皇太後以湯瑪琺健康為由下了一道懿旨，暫時緩刑。
但是湯瑪琺一天不除掉，鼇拜跟他的朋黨根本不會心安，所以他拉攏了其他滿臣，提議辦一場辯論會，可很快就被太皇太後否決，還斥責眾人，“湯若望已經身患重疾，不便於行，更是有口難辯，爾等欲雪上霜降，於心何忍？”結果就被擱下。
這事再三拖延，終於在康熙四年四月宣布結案，湯瑪琺始終難逃一劫，被判處極刑–淩遲，同案中多人下獄處斬，公文很快就交到了太皇太後手中。
不知是真如二阿哥說老天是有眼的，還是湯瑪琺真的是命不該絕，京城突然發生地震，而且整整連續五天，紫禁城也受到牽連，那些百姓更是傷亡慘重，朝廷忙於安撫百姓，開倉救災，湯瑪琺等人也得以緩刑。
此時，那些站在湯瑪琺那邊的漢族官員紛紛上奏，說這是天意示警，康熙把握機會跟太皇太後談討這件事，太皇太後考慮了一個晚上，她是禮佛之人，地震發生以後日夜都在念佛抄經；二為了大清江山，她希望每個民族都能和平相處，不想跟任何民族為了任何事發生矛盾，能使大清繼續盛世太平；三是跟湯瑪琺交情不淺，也為免他再受苦，結果迅速下了一道懿旨﹕湯若望向為先帝所信任，禮待極隆，爾等欲置之死地，毋乃太過。
太皇太後這道懿旨如同給了湯瑪琺一道免死金牌，懿旨下了，自然有人欣慰有人愁，但太皇太後的懿旨誰敢不從呢？結果湯瑪琺無罪釋放，但同案中其他五位仍被處斬，雖然仍有所犧牲，但能保住湯瑪琺，已是不幸中的大幸。
經此一事，京城又回複了往日的生氣明媚，湯瑪琺回到了南堂靜養，雖回複了欽天監一職，一切看似回複了平靜，但這一件事不過是往後那一幕幕腥風血雨的一場序幕。
經過了這件曆獄事件後，我求得了太皇太後讓我每幾天就出宮到南堂一次，一方麵是照顧湯瑪琺，畢竟佟韶寧的小命是他救回來的，另一方麵是跟南懷仁互相學習。
南懷仁並不熟悉漢文，便與我做了一個交易，我教他看漢文，說漢語，他便教我學習星相曆法，他雖然比湯瑪琺年輕，但也是學識廣博的，從他身上學到不少在現代極少接觸的新鮮趣事。