在這樣的條件下，明軍縱然擊敗了李國英，迫使清軍退守重慶，也隻能株守雅州（現雅安）和嘉定（現樂山）地區。沒有足夠的錢糧支撐，根本就難以進一步拓展地盤。
事實上，朱永興派明軍入川，采取的是和當年蜀王劉文秀差不多的戰略。先據一糧餉稍足之地，也就是雅州，然後緩步經營，待糧餉充足、大軍聚集後，或北收成都、順慶（今南充地區），或東下重慶與夔東十三家會合，從而打開西南局麵。
蜀王劉文秀奉詔回滇後，留下了部將威寧伯高承恩繼續鎮守並經營雅州地區，成績是明顯的。史書有載：是時高承恩駐雅，兵馬聚集，幾無有司之政。田糧專上穀米豆草，不用民間錢糧，雖夫役征繁，而井裏飽暖，民忘其勞焉。
後來清兵入川，川中明將內訌，自相攻伐，高承恩被殺，其部將郝承裔率軍降清，依舊鎮守雅州。這段時期雅州受到的破壞並不是很大，又有相當多的成都人避難於此，土地荒蕪的情況並不是很嚴重。所以，川中糧食皆仰食於雅州、土司及大渡河所越雋衛。
正因為如此，明軍才選擇了雅州作為川中根據，一方麵可以就地籌措一些，一方麵由建昌（今四川西昌市）、黎州（在今四川漢源縣北）向雅州運輸。這樣的話，後勤壓力才能降到最低。
另外，雅州東鄰成都、西連甘孜、南界涼山、北接阿壩，素有“川西咽喉”、“西藏門戶”之稱，地理位置十分重要。而且，雅州藏茶曆史悠久，唐、宋以來，朝廷先後行“茶馬互市”、“榷茶製”、“引岸製”等策“以茶治邊”，雅州便曾是茶馬司之地。假以時日，經營得當，朱永興希望在雅州開展茶馬交易，在成都平原地帶訓練出一支精幹騎兵。
當然，這都是長遠規劃，沒有兩、三年的經營，沒有大量人口的填充、重建，沒有財力、物力的源源支撐，一切都是空談。
而經營的第一步便是軍屯，“一手刀槍，一手鋤”、“自力更生，豐衣足食”、“生產即是戰鬥”等等口號，自然是朱永興剽竊後世的做法。沒辦法，既要養活軍隊，又要移民拓墾，所需錢糧實在是太多了。軍隊如果還是全部脫產，雅州一地的錢糧可能勉強夠用，但移民至少需要半年時間，即墾出荒地、收獲一季糧食之後，才能不用官府再補貼吃用。
這便是攻掠廣西和開拓四川的不同之處：攻掠廣西簡單，一個字“打”；開拓四川則重在籌劃和經營，軍事上卻暫時不主要。攻掠廣西主要依靠將領的作戰指揮，戰士的英勇用命；開拓四川則考驗政府的規劃，錢糧的籌措、運輸，移民的有序遷入，地方官員的治理水平，耕牛、種子、農具等的供給等等，實在是一個全麵的工程。
昌國公高文貴率部先行入川，在雅州站穩了腳跟，並開始軍屯；數月後，慶陽王劉震率部抵達嘉定，沿路派兵駐防，保證了滇川通路的暢通，並收降了一些投清的蜀王舊部，與高文貴所部並力軍屯；再數月後，晉王李定國由建昌入蜀，徹底穩定了川南局勢，並護送了第一批三千多移民。
分批入川，相隔數月，是在計算和衡量了政府財政情況下的無奈之舉。雖然緩慢，但卻保證了錢糧的最小供應和運輸量，是一種滾動發展的策略。
晉王入川後駐洪雅之天生城，昌國公高文貴和慶陽王劉震有了後盾，方才分別向北、向東緩步發展。而填川移民則保持著每月千人的數量不斷湧入，有安南人、南掌人、真臘人、廣西人、滇人，更有退伍的明軍。隨著移民入川，政府的錢糧物資也不斷運來，穩定著人心，重建著地方。
昌國公高文貴打虎未成，便帶著親兵返回了成都。沒錯，在一個月前他率領兩千明軍，護送著一千多移民來到了這座四川首府。
當時的成都荊棘遍地，高大、宏偉的城牆上長滿雜草，滿城竟隻有不到百戶人家。誰能想到，成都這座大城曾容納過數十萬人口，萬曆、天啟年間，成都僅織工就有數萬之多，大片的織廠連夜間都不休息，生產著天下聞名的蜀錦，銷向全國各地；這裏也曾是川西平原的商業中心，外地的客商到此購買到青城、峨嵋等地的茶葉和其他各種土產，繁榮的商業還衍生出種類繁多的行業，那時每天成都的眾多城門前都是川流不息的人群。