馬尼拉是整個西班牙在菲律賓精華所在，可稱********。即使在部隊出發後，這裏仍然有兩個土著步兵連隊，四個臨時動員的土著兵連隊（各連都有缺額）以及半個西班牙人工程兵連隊，結合棱堡，守備可謂嚴密。
但是在阿方索主力離開不久，摩洛人就對馬尼拉發起了一次大規模進攻。這些居住在南菲律賓的摩洛人簡直就是西班牙人的噩夢，無時無刻不在騷擾著西班牙控菲律賓。他們這次的進攻太過倉促，配合的也不好，西班牙人最終把他們頂了回去，可是自己傷亡也非常大。
就在這時，大明的艦隊登陸了，天女門留在菲律賓的棋子也全部發揮作用，有人直接打開了棱堡的門，大明的軍隊直接就突了進去。可是隨後的戰鬥情形，交戰雙方的記載就完全不同了。
按西班牙著名曆史著作《不敗軍神，唐胡安征戰錄》（唐胡安糖業公司讚助出版）的記載，當時唐胡安少校遭到小人陷害，無端被囚。可是他依舊對祖國無限中正，正在監獄裏為如何戰勝英格蘭而製定戰略。就在這時，大明人的攻擊讓西班牙守軍無計可施，結果忠於他的部下說服了看守，打開了牢門。
唐胡安不負重望，一出來就組織起手下全部的部隊，一個半連的菲律賓土著兵（含一個連輜重兵），以及半個連隊的工程兵。這其中戰鬥兵隻有半個連土著兵，其他都為特種兵。
但是勇敢的唐胡安閣下並沒有任何猶豫，而果斷向明軍發動了反突擊。在戰鬥中，他左衝右突有如神助，上帝保佑的他，沒有任何一種武器能傷害他。
大明軍隊狼狽而逃，戰場遺屍六萬有餘，連那些尊貴的西班牙女性，都被唐胡安閣下拯救出了數名，而這幾位美麗貞潔的女性，都在後來的歲月中，與唐胡安先生結下不解之緣。
當然也有曆史學者提出反證，比如事後根據大明方麵的記載，其部隊基本完整，怎麼可能有六萬的陣亡？再說他們此次動員部隊不過一萬三千，又哪來的六萬部隊可供斬殺。
再比如， 西班牙婦女一共被擄去四十三人內中包括阿方索的妻子和表妹，隻有三名身形較為臃腫的婦人被明軍遺棄，不應該算做唐胡安功勞。棱堡為大明部隊主動放棄等。
可是以上這些，都沒有什麼作用，支持唐胡安一派論據更為充分。比如根據後來的情況看，凡是有唐胡安先生出現的戰場，明軍一定會失敗，而唐胡安先生隻要離開，明軍就一定會勝利。可見，這都是唐胡安先生的功勞。如果西班牙帝國能堅持任用唐胡安先生為菲律賓總督，就不會有四次戰敗最終導致在遠東與大明這個邪惡軸心媾和之痛。
不過不管怎麼說，傳奇永遠更受歡迎。唐胡安的故事後來成了好來塢最熱中的題材，根據他的故事改編的動作片、愛情片、動作愛情片都能拿到不錯的票房，還能捧紅幾個俊男靚女。至於原形到底長什麼模樣，誰在乎？
大明方麵記載卻語焉不詳，甚至有些不敢記錄。這更讓有些曆史學家認為，這一仗是大明吃了虧。可實際情況是，李炎卿等問明白馬尼拉攻略戰始末後，評價就是：“這個怎麼記錄啊。”
他們攻打西班牙總督府的行動沒有什麼收獲，即使是唐胡安主動帶路讓他們洗劫了教堂和倉庫，所得也不過幾十石米糧，千把兩銀子和幾十兩黃金。剩下的無非是些武器火藥，所值有限。
不過他們這次行動，倒是替唐胡安結清了首尾，讓他順利的把幾個倉庫付之一炬，把那龐大的虧空抹平。順帶還洗劫了教產，發了大財。總歸他是西班牙人，在搶劫自己人這方麵，比起大明有太多優勢。