隨著與半藏戰鬥的結束。佩恩也進入了自己在火影世界裏又一個新的篇章。然而他不知道的是，在殺死半藏後，他也被陷入了被這個忍界的強者們極度關注的目光中。畢竟他殺死的是半藏，一個站在忍界巔峰，被稱為半神的強大忍者！
火之國，木葉村中，三代火影猿飛正在批閱文件。此時的猿飛正值壯年，更是被忍界冠以忍者博士，號稱史上最強大的火影！雨忍村發生的事他也很關注，畢竟那裏的狀況也關係著木葉的利益。不過，現在的猿飛並不為新崛起的絕世強者－－佩恩感到什麼憂心。在他帶領下的木葉，現在也是繁榮一時。自己的弟子三忍，木葉的金色閃光－－波風水門，以及一大批經曆過戰爭浸潤，年輕有為的忍者。曆經過忍界大戰慘狀的猿飛，不想為了一個小忍村新的首領破壞眼前難得的和平。現在的忍界雖然還有一些小規模的衝突爆發，但整體上還是相對平靜的。如果雨忍村新的首領沒有挑起爭端的意圖，猿飛也就默認了對方對雨忍村的掌控，即便那會讓木葉損失些許利益。
咚咚......輕輕響起的敲門聲打斷了正在沉思處理著一個文件的猿飛。輕輕的收回心思，猿飛拿起放在辦公桌上的紅木煙鬥，微微吸了一口，伴隨輕輕浮起的煙霧對著門口凝聲說道：“進來吧......”
隨著話音的落下，一個中年忍者應聲而入。對著正在抽煙的猿飛微微一禮道：“火影大人，團藏大人求見，要他進來麼？”
團藏？猿飛在心裏微微一歎，恐怕是為了雨忍村的事吧......
“讓他進來吧。”
“是！”傳話的忍者應了一聲，隨即轉身向門外走去。
不多時，一個略顯消瘦的人影走了進來。黑色的短發，微微眯起的雙眼，身上滿是戰場的戾氣。此時的團藏並沒有漫畫中那樣身上包纏著繃帶。而是一身忍者服，腰間挎著一柄暗部佩刀，不怒自威的表情中，透露著一種上位者，決定他人生死的強悍氣勢。
“有事麼？團藏。”微微掃了一眼對方，猿飛不鹹不淡的問道。
團藏聞言皺了下眉，隨即開口道：“你知道我的目的，猿飛！說說你的想法吧。我不知道你默認雨忍村發生的事是為了什麼，但我需要你的解釋！”
絲毫沒有在意團藏不客氣的語氣，猿飛左右看了一眼正在幫助他處理文件的忍者。兩人也了解的起身對著猿飛和團藏躬身行禮後，走出了辦公室。
看著被關上的門微微出神了一會兒，猿飛清淡的開口道：“現在我們和雲隱還有一些領土上的爭端，我隻是不想為了雨忍的事情分散木葉的力量。”
“這不是理由！”團藏聞言大聲質問道：“半藏為雨忍首領時，每年都會分配給不少任務以及可觀的資金給木葉。雖然現在的木葉不會在意那種程度的資源，但那也是無數的忍者用生命換來的利益。這麼簡單就要放棄，我希望你能有個合理的解釋。不然的話我想不少的人會對你的決策產生懷疑！”
猿飛聞言沒有說話，隻是抬頭輕輕的看著天花板。良久之後才緩緩開口道：“團藏，你也經曆過忍界大戰，你該了解那種被視為親人的同胞死去的悲痛。為什麼你就不能珍惜一下眼前難得的平靜呢!”
“平靜？”團藏沒有正麵回答猿飛的問題，隻是用一種解答的語氣說道：“這樣的平靜毫無意義！忍者這個職業就是為了戰爭而存在的。他們中的無數人都有自己的家人，朋友，愛人！為了保護他們珍視的人，每一個木葉忍者都能夠接受犧牲和坦然的麵對死亡！這就是忍者存在的意義！為了守護他們心中重要的存在，也為了這個國家和村子繁榮以及真正意義上的和平！”
猿飛聞言沒有在解釋什麼，二人的理念不同，他和團藏也就沒什麼可說的了。
打定心思，猿飛的語氣有些生硬的道：“雨忍村的事情就這樣了，現在首要任務是和雲隱的領土爭端。還是不要被別的事情分散了心思為好！”
“你......”聞言的團藏滿是氣憤！“火影大人！你的決定我無法接受。如果這樣的話我就要動用自己手中的力量警告一下雨忍村了！不管雨忍村新的首領怎麼看待木葉，他都有必要知道哪個才是支配這個忍界的最強忍村！”
聽到已經稱呼他為火影大人，沒有直呼其名的團藏，猿飛略顯無奈的揮揮手，算是同意了團藏的說法。而得到答複的團藏也沒有在開口，深深的看了一眼猿飛後，略含怒氣的走出火影的辦公室。直到良久後，猿飛微微揮了一下手，對著房間內突然浮起的人影說道：“盯住團藏，一旦他有什麼過激的行為馬上報告！”
“是！”人影對著猿飛一禮道，消失在了空氣中。
......
就在木葉也在極度關注雨忍村的同時，佩恩則開始了他對新的雨忍村的改造。首先他就要求手下的忍者都佩戴新的雨忍護額，而不是以前的叛忍護額。在佩恩看來，自己已經打敗了半藏，他已經是雨忍真正意義上的首領了，不管其他忍村怎麼想，這是事實！在改造過程中，無數的建築物被拆除，新的雨忍村規劃的占地麵積比以前足足大了一倍有餘。而後他又動用忍者的力量和手中為數不多的資源，開始建立新的雨忍村建築。以前的雨忍村在佩恩眼裏顯得太過僵硬和死氣沉沉。雖然他沒有把雨忍打造成天堂一樣美麗的幼稚想法，但有自己獨特的新的雨忍村有必要建立起來，為了自己，也為了生活在這個村子中人。