同治是清朝人關後的第八位皇帝，1874年]2月駕崩，即位時才六歲，而死的那年僅十九歲。即位前後不滿十三年。同治皇帝是慈禧太後的兒子，這樣的一個小皇帝，他是怎麼死的？有人說他是嫖妓後得了風流病梅毒而不治身亡；有人認為他是得了清朝人最感到可怕的天花，當時的醫學根本治不了這種病；還有人說是死於疥瘡，也有人認為他是被慈禧太後害死的。眾說紛紜，莫衷一是。
同治帝死於梅毒，在同治死後流傳頗廣。據《清朝野史大觀》記載，同治帝與皇後阿魯特氏相親相愛，但慈禧太後不喜歡阿魯特氏。慈禧開始常命皇後等人陪她看戲。但皇後喜靜，每次看到男女私情，則麵壁而坐。慈禧對皇後不滿。皇後多次受責怪。慈禧濫施淫威，限製同治帝寵愛皇後，強令其移愛慧妃。而同治偏偏討厭慈禧所喜歡的慧妃。
同治帝盡失情愛之樂，於是與太監佞臣常常微服外出尋花問柳。在一些正規學術著作裏都記載著同治帝微服出宮，出入煙館妓院的故事，如蕭一山所著《清代通史》中就有同治因出遊而患梅毒。北京外城的著名妓院中，清朝的官員是常客，同治生怕被臣下發現，不敢去，不敢去京中較大的妓院名樓，專門找隱蔽的小妓院、暗娼等處。當時還有太監在東華門內開煙館，藏垢納汙，導男引女，供其取樂。侍讀王慶祺又進**，同治縱情享受。
一些王公大臣注意到同治帝微行紛傳於內外，屢次勸諫同治而毫無成效。有一次，同治帝對醇親王當麵勸諫矢口否認，醇親王隻好把時間、地點一一指明，同治帝卻一再追問他消息的來源。
據說，同治從煙花巷院染上梅毒，開始時毫無察覺，但後來病症發到了臉上，繼而發到背部。才召太醫診治。太醫一看，大驚失色，不知如何是好，因此請命於慈禧。慈禧下旨道：“恐怕是屬於天花。”於是，禦醫們按照出痘的醫法開藥，沒有效果。同治帝得病後內心十分急躁，厲聲大罵太醫：“我得的不是天花病，為什麼要當作天花來治療？”太醫回奏：“太後命之。”同治帝這才不說話，而內心咬牙切齒的發恨。臨死前的幾天，同治帝的頭發全部脫落，下**潰爛，發出極其難聞的臭味，據說潰爛處有洞，能看見腰腎。
清朝官方修的史書和一些官員的筆記日記中，都稱同治死於天花，其原因是他們為了皇帝的顏麵，不得不對皇帝的死作出合理交代。如果說當時把梅毒當作天花來治，最後皇帝也死掉了，這樣的消息傳到外界，豈不被世人恥笑？《翁同和日記》中記載說：“風聲過大，且非兩宮聖意。”梅毒在當時是絕症，以天花治之，顯然是為了掩蓋醜聞，以免丟皇家臉麵。所以同治日益病重，最後痛苦而死也就不奇怪了。
也有人認為同治病死與太醫誤診有關。當時的太醫誤將梅毒當作天花治療，結果用藥不當。有一個叫唐魯孫的人抗戰時期在北京居住，結識了一位清朝的張太醫，此人是光緒朝的太醫院院判，曾為同治治過病。張太醫說，同治病時，許多太醫都隻說是天花，隻有他所開的藥方斷定為梅毒。等到同治死後，慈禧太後才知道其他的太醫都沒有看出真正的病因，隻有張太醫的診斷是正確的，因此屢加升擢。
還有一種說法是同治得了天花而死。當時的官方典籍及其後的正史均持這種說法。而且人們在清代檔案中發現了記載同治帝脈案的《萬歲爺進藥用藥底簿》，比較詳細的記錄了自同治十三年十月三十日下午同治帝得病，召禦醫李德立等人人宮請脈，直至十二月初五日夜病死，前後37天的脈案，完全可以證明同治帝是因患天花而死的。這本脈案是敬事房太監根據當時的禦醫每天請脈記錄和所開的方子，譽抄彙輯成冊的。