東漢的地方官製與西漢相比較，在郡、縣兩級是基本相同的，不過郡的重要性和權力較西漢下降很多。在州一級，則有根本性的差異，東漢的州已經演變成為一級地方，淩駕於郡之上。至此，中國古代的地方行政區劃由郡縣製轉變為州、郡、縣三級製，一直延續到隋朝“廢郡”為止。
州刺史
東漢將洛陽之外的地區劃分為十二個州，各遣刺史一人為長官。另以京兆、左馮翊、右扶風、河東、河南、河內、弘農七郡為司隸校尉轄區，稱司隸部（漢代州也稱部）。司隸校尉是京官，本職為監察在京百官諸不法事。東漢時，每每退罷三公均由司隸校尉糾劾所致，所以司隸校尉號為“雄職”。皇帝召集朝會的時候，司隸校尉與禦史中丞、尚書令三人有單獨的席位，稱“三獨坐”。司隸校尉秩比二千石，屬官有從事（近來流行的韓劇中每每出現的從事官就是由此得名）、假佐（假：代理的意思；佐：助手的意思。就是說是可以代行事務的助手）等，另統領一支由一千二百名奴隸組成的武裝警察部隊，司隸校尉的官名也由此而得。諸州沿西漢漢成帝製度，設州牧一人，秩二千石。建武十八年（公元42年）改刺史，秩六百石。漢靈帝中平五年（公元188年），再改州牧，秩二千石。東漢刺史有固定的駐地和官署，糾劾所部太守縣令不必如西漢製度上三公按驗，可以直接罷免之。改州牧後，兼領軍政，位高權重，有點類似於唐朝的節度使，而管轄地域的廣闊，又不是節度使所可以相比的。與西漢相同的是，刺史也要周行郡國，刺探政情，年終回京複奏。不過東漢的刺史不必親自回京，而是派遣屬吏向司徒府報送文書而已。
郡國
東漢共設郡國一百零五：王國二十七，司隸部屬郡七，列郡七十一。除司隸部所轄七郡外，王國與列郡均分隸諸州，其中豫州領郡國六，冀州領九，兗州領八，徐州領五，並州領九，幽州領十一，青州領六，荊州領七，揚州領六，益州、涼州各領十二，交州領九郡。東漢製度，皇子封王，以郡為國。每國置傅、相各一人。傅主王府事，職如漢朝的太傅；相如郡太守，主政務；相有長史一人，職如郡丞。另置中尉一人，秩二千石，職如郡都尉，是主管軍政、緝捕盜賊的軍官。王府置郎中令一人，秩千石，職務和漢朝的郎中令相類似，主管王府的大夫、郎等；仆一人，秩千石，負責王府的車馬訓練與駕馭；治書數人，秩六百石，職如尚書；謁者數人，秩四百石，職務是奉王命出使；另有禮樂長、衛士長、醫工長、永蒼長、祠祀長等，秩皆比四百石。郡太守秩皆二千石，隻有河南郡因京師所在，長官稱河南尹，位比九卿，秩中二千石。諸郡各置丞一人，位次太守，秩六百石，負責民政事務；邊郡（就是設置在邊境地區的郡）另置長史一人，秩六百石，負責軍政事務。長史之下有司馬一人，負責具體軍事指揮。東漢內地不設郡都尉，以太守領兵。邊郡置都尉或屬國都尉領軍並轄縣，地位略與內地較小的郡相仿。如漢和帝永元元年（公元89年），置西河屬國都尉、上郡屬國都尉；永和十五年（公元105年）置遼東西部都尉；漢安帝置右扶風都尉、京兆虎牙都尉等。
侯國、縣、邑、道
東漢的縣級地方建製與西漢相同。列侯以縣為封地則稱侯國，侯國置相一人，相當於縣令或縣長（以侯國大小為異），相不隸屬於列侯，但負責為列侯征收租稅。封國戶數在千戶以上的，置家丞、庶子各一人，是侯府官，不管理民政；不滿千戶的，隻置庶子一人。東漢的侯另有鄉侯、亭侯，所封之地各為一鄉、一亭，這樣的封地轄於所在縣，與鄉、亭相等。皇後、皇太後、公主的封地稱邑，置令、長。邑的體製與侯國相當。少數民族聚居地設道，隸屬於郡，多設於巴、蜀等西南地區，以少數民族部落首領為道的長官。萬戶以上的縣置縣令一人，秩千石；縣丞一人，掌民政、文書、倉庫；縣尉二人，掌治安。萬戶以下的縣置縣長一人，秩三百石或四百石；縣丞、縣尉各一人。東漢諸縣出產鹽的，置鹽官，負責管理鹽場、鹽礦，征收鹽稅。出產鐵的縣置鐵官，負責冶煉、鑄造。在手工業發達的縣置工官，負責管理工匠、征收工商稅賦。在水產發達的縣置水官，負責管理漁場、征收稅賦。以上這些官吏不隸屬於郡縣，均隸屬於少府，屬於派出機關。東漢在縣以下的官製與西漢無異，具體可以參見西漢官製。
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