這十二位神靈就是以神王宙斯為首的十二主神，主神們擁有超越一般神靈的難以現象地力量。為普通神靈以及廣大神民們所敬仰和畏懼，亞特蘭蒂斯的主體--亞特蘭蒂斯神殿並不是一片固定的土地，而是一艘類似太空航母地巨型艦體（母體＝外星人？）。神殿大部分時間都停留在擁有特別能源的古希臘奧林匹斯山上，所以十二主神也被稱呼為奧林匹斯十二神。十二位主神各有其特殊的能力，頻繁在人類世界中顯露神跡，留下了無數的傳說.然而。有權力和欲望的地方，就必定會有無休止的爭鬥.由於十二主神之首宙斯的獨裁統治，其他的主神心中的不滿漸漸愛得越來越強烈。最後終於引發了衝突，並升級為大規模的戰爭。這次神的戰鬥進行地相當激烈，亞特蘭蒂斯的文明被摧毀殆盡，神民們和屬下的人類也死傷無數。宙斯的力量強橫，遠勝其他人，是十二主神之首，盡管十一位主神聯手，還還是無法獲勝。
在最後的一戰中，海皇波賽冬將整個亞特蘭蒂斯神殿以大神通移動到了最有利與自己戰鬥的海上，並用海水籠罩了天空，使得宙斯的雷電街無法發揮最大的力量，終於擊倒了不可一世的神王。憤怒的宙斯以自己生命為媒，開啟了亞特蘭蒂斯神殿的自我毀滅程序，神殿在海洋中爆炸引起的可怕力量使當時的世界（歐洲？）都遭遇了滅頂之災，隻有少數人類僥幸存活了下來。亞特蘭蒂斯神殿的廢墟也隨之沉入海底，精神母體“神恩”因此遭遇了極大的損害，十一位主神也由於母體的損傷而都陷入了永恒的沉睡之中。在不明就裏的普通人類中，也留下了這樣一個傳說：眾神之首宙斯為懲罰人們的墮落，引發地震和洪水，亞特蘭蒂斯王國便在一天一夜中沒入海底……
一萬五千餘年後，西方教廷的比修斯為追求力量而遊曆整個世界，在大西洋的直布羅陀海峽一帶修煉時，偶爾發現了海中的異象，並敏銳地感覺出其中所蘊涵的巨大力量。經過五年的探索和努力，比修斯終於成功潛入深海，來到了沉默的亞特蘭蒂斯神殿。
比修斯在機緣巧合下，得到了母體的能量，或者說，是母體為早日離開海底和恢複力量而特意選攆了萬年來首次的闖入者比修斯。就這樣，比修斯取代了已經消失的宙斯而成為神王，統領著其餘十一位主神，十二位主神以一種類似領域的精神方式寄居在比修斯的體內恢複力量，並以神力創造出自己的神仆.與當年一樣，比修斯所代表的宙斯雖然是諸神之王，但並不能完全統禦所有的主神，所以才有了和葉之秋戰鬥時性格各異、各自為戰的情況。如果比修斯能整合並自如操縱所有的十二主神，那麼當日的勝負還很難說.當時，那個差點讓葉之秋領域力量化成的孫悟空失敗的十二主神合力戰技“眾神之怒”實際上就是集合使用母體的本原力量，最終還是敗給了破壞力極其強大的火雲陣。
在火雲陣將母體連帶比修斯一起毀滅後，也不知是否偶然，有一絲母體殘餘的精神碎片被火雲陣的“坤”字吸了葉之秋的體內，成為了日後困擾葉之秋多時的七彩光點.“這麼說來，還真是我把你吸進來的？”葉之秋不由苦笑，一直困擾自己的力量居然是自己招惹的，而對於亞特蘭蒂斯的諸多秘密，葉之秋心中又充滿了好奇，“你也是十二主神之一？你是哪一位主神呢？”
“偉大的生命主體，你是我重生的唯一希望，請幫助我。”七彩光點沒有直接回答葉之秋的問題，而是提出了一個讓他意外的請求。
葉之秋心中一陣警惕：“我不是毀滅了母體的凶手嗎？為什麼你會提出這樣的要求？再說我也不敢相信你，難道我會去複活一個敵人嗎？”
“我不是你的設人，當時我脫離‘神恩’來到你體內時，力量相當薄弱，幾乎消失，後末依靠著吸收並轉化你的體內的力量，才漸漸恢複自己的意識.從某種意義上來說，你就是我現在的母體.問題是你近來體內的兩種奇特力量越來越強，我已經無法成功轉換，所以必須尋求你的幫助，否則我遲早將逐漸喪失意識而死亡。”
葉之秋一聽這討厭的家夥就快消失，心中不由一喜，正打算拒絕它的要求，但轉念一想，還是多問了一句：“我要怎樣才能幫助你呢？”