超神學院世界的宇宙分為大宇宙和小宇宙，和魔法少女奈葉的世界觀很相似，在無數宇宙中的一個宇宙文明裏，大發明家黑默丁格創造了時光神基蘭，時光神可以連接散布在宇宙間的各個文明，基蘭所用的神器，則是大發明家黑默丁格創造的大時鍾。
當時空被鏈接之後，各個明文中的先進文明便開始相信，創造神，是一件可能的事情，於是，諸如太陽神，戰神，造物神，死神，大地之神等，也在各個文明中孕育而生。
一場神之間的戰爭爆發了，德星的大地之神與諾星的戰神之間進行了一場浩瀚的較量，並且把太陽神卷入了矛盾，於是，忍無可忍的太陽神，將德諾星係的太陽引爆從而毀滅了德諾星係。而太陽神所屬的烈陽星，也被戰神的巨斧劈成兩半，剩下的子民在極度惡劣的環境下生存，而被諾星戰神辟開的地方被後來的人們叫做巨神峰。
基蘭全程見證了那場戰爭，並且帶回了德諾星係造神工程中眾神的基因，並且將幸存者們帶到了各個文明的安全地方，而年僅十歲的德瑪西亞的皇子嘉文，就被帶到了地球。隻是到了地球後，德星的皇子嘉文便陷入了沉睡
具那場戰爭已經有萬年之遙。
但造神運動並沒有停止，其中有個創造了死神，，這個死神叫卡爾薩斯，他給自己取了個更好的名字叫——死亡歌頌者。
他盜取了時光神基蘭的大時鍾，妄圖鏈接各個落後的文明，並傳播他們的理念——既死亡便是重生。
而位於創神宇宙的地球正處核時代，每個文明都會經曆核時代，核時代最大的特點就是，他會決定文明的走向：昌盛或是消亡，善良或是邪惡。而核時代的核洗禮卻是成就神體的最佳方法，大部分的神明都是從核洗禮中成就所謂的不朽的。而如今，地球也將會創造自己的神，進入超神科技時代。地球會創造怎樣的神呢?於是卡爾薩斯則把魔抓伸向了地球。
基蘭很明白這意味著什麼，於是，他聯合，千年的魔法師瑞茲、諾星的戰爭狂人杜卡奧，帶著德瑪西亞和諾克的基因種子，提前於卡爾薩斯來到了地球，並把那些逝去文明的基因傳播到了地球的各個角落，其中還有，沉睡了萬年之久的嘉文。
他們建立起了超神學院。靠著神河文明的一些技術培養這些擁有超神基因的戰士。
於是，在這樣的背景下，繼承了1萬年前德諾星係等文明的基因的人，被聚集到了超神學院，當務之急，是如何應對死神帶來的危機。死神會讓更多邪惡文明卷入到地球時空。
而太陽神引爆德諾星係太陽毀滅德諾星係後，太陽神意識到了自己的的錯誤，決定自裁，並希望自己的繼承者是溫柔善良的，於是，決定太陽神基因的繼承者隻能是女性，並重命名為曙光女神。他把這個希望托付給了時光神基蘭。
而這一切信息，而羅傑在知道自己在超神學院的世界後。羅傑表示，這個世界太危險。尼瑪直接就是戰爭的世界。大道你個坑貨。不過羅傑也知道自己到這個世界的原因。畢竟自己是，混沌魔神之淨世魔神，而超神學院世界正是自己成長的好地方，畢竟混沌早已經被盤古打破平衡，現在的混沌太過暴虐。
如今孕育的混沌魔神，都是被大道扔到符合他們法則發展的世界。混沌魔神對於混沌是不能缺少的。因為他們是支撐者混沌大道三千法則的。混沌魔神可以短時間內缺少但不能永久缺少當一個混沌魔神，死去之後，下一個混沌魔神，才會孕育。每個混沌魔神對應一種法則。同一種法則永遠隻有一個人可以掌握到最後，畢竟合道者隻有一個。混沌魔神到了最後便是於所長控法則同在，法則既是魔神，魔神即是法則。三千大道法則不分長短不分高低。所區別的隻是在求道的路途中，所謂的戰鬥力的強弱。就好比前期，無人可逃脫空間的破壞。後期，所有魔神的身體，比空間還要堅固隨手一擊便可破碎虛空。就好像海賊王中的惡魔果實沒有渣渣的惡魔果實隻有不會使用的人。