突然，京都的大街小巷裏喊聲四起。正值新春正月初四，那些毫無心理準備的市民突然聽到有人喊了一聲：
“戰爭又打起來了！”他們已顧不得是什麼人、在哪兒又打起來，一心隻想快逃。街上並沒看見武士模樣的人，隻是一群普通百姓。
“這可不得了了！”“快收拾一下跑吧！”
家家戶戶立刻亂成一團，城市也失去了往日的寧靜。任何一個地方的人都不曾像京都百姓這樣飽嚐戰亂之苦，甚至可以說京都的每一寸土地都來源於曆次戰亂時的灰燼。每當這裏發生內亂時，京都內外都是火光衝天。
此次，信長率大軍進京時，百姓都非常恐懼。他們回想起木曾山的軍源義仲進京後犯下的種種燒殺搶掠的罪行，所以他們對於織田軍的畏懼也不難理解。
然而，信長並不是義仲，市民們終於認清了這一點。在一片祥和的氣氛中，京都百姓送走了舊年，迎來了新春。城裏秩序井然，婦女們甚至可以安心地在夜間行走，大街小巷都在傳送信長及織田軍的美德。
然而，就在年底的時候，京都就有傳言說流竄到泉州至河內地區的三好餘黨開始作亂。不過，老百姓都堅信織田軍會保護京都，所以他們並未有任何不安。可是，信長留在京都的駐軍並不多，京城內外隻有兩千軍兵負責警備。同時，三好餘黨的細作喬裝改扮悄悄溜進京城，當他們得知信長的大部隊已返回岐阜城時，便將城內兵力不足的消息通知給各地餘黨。
密切注視著信長一舉一動的敵人不隻有三好、鬆永兩黨的殘部，還有那位被信長逐出美濃的齋藤龍興，以及剛被信長掃平的佐佐木家的殘餘勢力。此時，齋藤龍興的身影開始在河內及泉州附近頻頻出現，原美濃重臣長井隼人一直追隨著他。隨後，龍興就與三好、鬆永餘黨結成了連盟。
這些人打算趁虛而入，攻進京都。於是，敵人在年底時動了手，負責城內警備工作的藤吉郎不敢有絲毫鬆懈，為了避免引起騷亂，他未將此消息告知市民。然而，戰況的發展卻對織田軍越來越不利。新春剛過，敵人就集結了一萬兵馬向京都逼來。
同時，那些潛入城中的殘黨趁著織田軍忙於布防之機，悄悄與埋伏在城外的部分敵軍會合，並在正月初四白天，突然包圍了本國寺的護城河。
“啊！”敵軍一邊呐喊著，一邊架橋越過護城河。將軍義昭就住在本國寺裏。因為他剛剛入京不久，幕府的辦公衙門和將軍府第還未來得及籌建。所以在新府第竣工之前，義昭便暫住在本國寺裏。前一位將軍義輝因鬆永彈正作亂，被燒死在自己的府裏。此時的義昭沒想到，在朗朗乾坤、光天化日之下，那慘絕人寰的殺戮又要在本國寺重演，寺內頓時陷入一片混亂之中。當藤吉郎聽到消息時，大喊一聲：“不好！”立刻帶領一隊人馬與敵軍展開了巷戰。兩軍相遇在本國寺與七條道場之間的十字路口，這場巷戰從中午一直打到傍晚仍未結束。
附近民宅的門上、牆上濺滿了血跡，隨後這些民宅也都被付之一炬。然而，這場戰爭依然未分勝負。盡管負責警備的織田軍人數不多，但藤吉郎指揮有方，他們仍能與敵人僵持下去。當然，這其中的傷亡自不必說。眼看天就要黑了，藤吉郎覺得這些自信滿滿的敵軍快要堅持不住了。沒想到，敵軍的全麵潰敗比他設想得還要快。
“撤！”“快撤回去！”
敵將拚命喊叫著後退，一時間潰兵如潮，隻見他們走過的地上到處散落著殘破的刀槍、頭盔、草鞋、燒殘的旗杆、碎紙和兜襠布。
“木下大人在嗎？木下大人在嗎？”天剛擦黑之時，三四百名援兵從本國寺附近趕到了藤吉郎的營中。
“我在這裏。”滿臉汗水的藤吉郎應聲答道。當敵軍撤走後，他立刻命令：“不要追趕敗軍，要立刻滅火，以防火勢蔓延至整個城區。”藤吉郎一直四處奔走查看，臉上、頭上都是熱氣騰騰。看到援兵後，他走上前問道：“請問你們是誰的部隊？”“就是剛來的人的。”隻聽一名全身盔甲的將官從隊伍裏走出來答道，原來正是荒木村重。“咦，怎麼是你？”