甲州地區的武田一族前不久被織田軍殺得片甲不留，此時該地區也是人心騷亂，開始出現捅了蜂窩一樣的妄動。堅守、攻略、合並、分離，戰亂隨處可見。那些被安置在新領地的人，比如蘭丸的兄長森長可、河尻秀隆、毛利秀賴等人，全都在這次大地震般的變動中失去了自己的位置，有的戰死，有的流亡，下場十分淒慘。
總之，可以這麼說，今年三月信長剛奪取的原屬武田的領地，一夜之間全部易主了。趁機貪小便宜，這樣一群行動迅速的人數不勝數，也說不清他們是什麼來頭。其中規模較大的是北越的上杉、小田原的北條，他們把欲望的觸角也伸向了柴田勝家和德川家康的領地，幾乎是盲目地開始了侵略行動。幾乎可以這麼說，民眾唯恐天下再亂的預測確實言中了。“但是，不管怎樣，與信長公最親近的血親中為什麼沒有一個人毅然決然地站出來呢？為什麼不名正言順地舉起大旗呢？”民眾都有了這樣的焦慮。這種想法是針對信長的次子北畠信雄和三子神戶信孝油然而生的，也是一種同情心。留守安土主城的將士此時是如何應對的呢？從地理位置來看，它與京都近在咫尺。估計當天傍晚所有事情就都傳到安土了。
據說，當天晚上光秀就已經悄悄差人把招降的書信送到蒲生賢秀那裏了。
“做夢！”他自然是不予理會。六月三日，他護送信長的夫人生駒氏以及其他親眷，退移到位於故鄉蒲生東郡的日野城。然後與他的兒子氏鄉一起抓緊加強日野城的防守，同時向駐守伊勢鬆崎城的信長的次子北畠信雄快馬報信：“光秀肯定會來襲擊遺留的家屬，請急速派兵來援。”
此時，北畠信雄已經在整備軍隊，但並非為了支援他，而是為了出兵中國地區。一聽說事變，這邊也是一片震驚，人們驚慌失措，不知如何應對。信雄暫且以蒲生家的一個女兒作為人質，派去了援軍。
“殺父之仇，豈能不報？”他懷著悲壯的決心，親自向江州土山挺進。但是身後的領地伊勢和途中的伊賀地區都陽奉陰違，臨時變卦。信雄躊躇不決地想：“如果江州一帶有人與光秀勾結，突然起義怎麼辦？又或者在伊勢的後方發生暴動呢？”他一味忙於鎮壓和環顧形勢，結果把難得的意誌消磨掉了，白白地錯失了進攻的時機。而且為了應付各地的小暴動，拚死戰鬥一番，結果就沒有義無反顧地奔向正義與道義。
由此可見，既有人絕對忌諱光秀，把他視為逆賊，同時也有不少豪族接到他的聯絡書信後，暗地裏與他結下秘密約定，他們參照形勢進展，想要投靠明智那邊。尤其是大阪城的織田信澄，他是光秀的女婿，其父親織田信行又被信長處斬，雖說是同族的人，卻有著殺父之仇。光秀期待他能從大阪城響應自己，心想：“至少他一定會站到自己這邊。”
六月二日本能寺之變的當天。恰好信澄與信長的三兒子神戶信孝以及丹羽長秀等人一起做好了出征阿波、中國地區的準備，正要從住吉的海岸搭乘兵船。
“京都突發重大變故了！”一聽說此事，全軍不知所措，甚至陸續有士兵逃散。丹羽長秀和神戶信孝商議之後，暫且返回了大阪城，五日晚上偷襲信澄，將其亂槍刺死。少數成為漏網之魚的信澄的部下，立即跑去京都投奔了明智軍。