唯建康城內，已無主子，司徒王謐等，當然背玄，迎裕入都。王仲德抱元德子方回，出城候裕。裕接見後，便將方回抱入懷中，與仲德對哭一場，麵授仲德為中兵參軍，追贈元德為給事中，然後將方回繳還仲德，引兵馳入都中。越日，移屯石頭城，設立留台，令百官照常辦事，取出桓溫神主，至宣陽門外毀去，另造晉室新主，奉入太廟。又派劉毅等追玄，所有桓氏族黨，留居建康，盡行捕誅。再使部將臧熹入宮檢收圖書器物，封閉府庫，熹一一斂貯，毫無所私。裕乃倡言迎駕，使尚書王嘏，率百官往尋陽，迎還安帝。嘏與百官奉令去訖，唯王謐居守留台，推裕領揚州軍事。裕一再固辭，讓謐為揚州刺史，仍領司徒，兼官侍中，錄尚書事。謐複推裕都督揚徐兗豫青冀幽並八州，領徐州刺史，裕即受任不辭。辭揚州而不辭八州，其意可知。當下令毅為青州刺史，何無忌為琅琊內史，孟昶為丹陽尹，劉道規為義昌太守。凡軍國處置，俱委任劉穆之，倉猝辦定，無不就緒，朝野翕然。隻諸葛長民前與裕約，謀據曆陽，事尚未發，為刺史刁逵所聞，將他拘住，檻送建康。行亞當利，聞得桓玄出走，建康已屬劉裕，解差樂得用情，破檻放出長民，還趨曆陽。曆陽兵民，乘機反正，逐去刺史刁逵，逵棄城出走，正與長民相值，再經城中兵士追來，無從逃避，隻好下馬受縛，由他解送石頭，一刀處死。子侄等亦皆駢戮，唯季弟給事中刁聘，幸得赦免。裕令魏詠之為豫州刺史，鎮守曆陽，諸葛長民為宣城內史。先是裕少年微賤，輕狡無行，名流多不與往來，唯王謐素來重裕，嚐語裕道：“卿當為一代英雄。”裕亦因此自負。會與刁逵賭博，輸資不償，逵縛諸樹上，責令還值，嗣由謐代為償還，方得釋裕。裕感謐愈深，恨逵亦愈甚，至是酬恩報怨，才得伸誌。唯桓玄篡位時，謐實助玄為虐，手解安帝璽綬，獻與桓玄。見前回。時論皆不直王謐，謂宜聲罪伏誅，獨裕力為保全，謐才得無恙。因私廢公，終屬非是。
桓玄奔至尋陽，將要息肩，聞得劉毅等又複追來，他急脅迫安帝兄弟，及何王二後，乘舟西行。安帝被徙尋陽，事見上文。留龍驤將軍何澹之，與前將軍郭銓，刺史郭昶之等，堵仗湓口。劉毅等不能前進，尚書王嘏等，無從迎駕，隻好還報劉裕。裕乃托稱受帝密詔，迎武陵王司馬遵為大將軍，暫居東宮，承製行事。遵父名晞，就是元帝第四子，受封武陵，由遵襲爵，留官建康，任中領軍。桓玄篡位，降遵為彭澤侯，勒令就鎮。遵甫出石頭，裕軍已至，乃退還就第，此時總攝百揆，稱製大赦，唯桓玄一族，不在赦例。可巧劉敬宣司馬休之，自南燕奔歸，遂令休之領荊州刺史，監督荊益梁寧秦雍六州軍事，敬宣為晉陵太守。他兩人奔往南燕時，曾與劉軌高雅之同行，見前回。後欲密圖南燕王慕容備德，事泄南奔，軌與雅之被南燕兵追斬，獨休之敬宣得脫，還為晉臣。休之奉命赴鎮，但此時的荊州，尚為桓石康所據，怎肯讓與休之，再加桓玄自尋陽奔赴，當然迎納桓玄，與晉反抗。玄仍稱楚帝，即以江陵為楚都，眼見得桓玄雖敗，還有一片尾聲。小子有詩詠道：
石頭城內慶安全，半壁江山得少延。
隻有荊襄還未靖，尚勞兵甲掃殘煙。
欲知江陵如何攻克，待至下回再表。
劉裕起兵討玄，主謀者實為孟昶，昶之慫恿劉裕，為私怨而發，非真知有公義也。觀其對妻之言，全為劉邁一人，而周氏獨能傾囊相助。且謂義無歸誌，彼知從夫之義，寧不能知報國之忠，其所由慨然給資者，正欲昶之乘間除逆耳。周氏誠賢矣哉！本回特舉以標目。所以揚巾幗，愧須眉也。何無忌母，為弟複仇，猶其次焉者耳。劉裕一舉，桓氏瓦解，師直為壯，曲為老，複得裕以統率之，何患不成？玄之懼裕，譬諸賊膽心虛，不寒自栗耳。然裕誅刁逵而不誅王謐，裕已第知有私，不知有晉矣，寧待篡位而始見裕之心哉？