後來，尼米茲曾乘美西戰爭中的老戰列艦“馬薩諸塞”號和“印第安納”號以及一艘驅逐艦出海航行。在驅逐艦上，他的耳朵出現膿腫。因為艦上沒有醫生，艦長把他叫到機房裏，用一個可能沒有消毒的噴油器將硼酸注射到他發炎的耳朵裏。尼米茲的耳朵有點聾，可能是這次膿腫的結果。他學會觀察別人說話時的口形變化，以彌補聽力上的困難。
每年夏天，尼米茲所在的這個班都要離校實習，從事軍事科目訓練。有一些教官喜歡故弄玄虛，尼米茲對這種做法十分不滿。他認為一個教官的威信來自於明晰、簡潔、正確的指令，而不是想方設法讓學員盲目地依從。
在一次航行中，一個教官為學員做示範，但他發出的命令，把配合訓練的水兵弄得暈頭轉向。還有一回，教官試圖難為學員，他把學員的隊列完全打亂、顛倒，然後要求學員發6次口令把隊列恢複到原來的位置。有幾個學員試了試，都沒有成功。教員十分自得，擺出一副傲慢的樣子準備給出他的答案。尼米茲站了出來，他準備擺脫教官的思路，運用極為簡單而又巧妙的方式解決問題。
他自信地說：“我隻需要兩次口令就夠了。”
教官不相信，輕蔑地說道：“那麼你就證明這一點吧！”
學員們已經立正站好，尼米茲發出第一個口令：“解散！”他們照此做了。然後，尼米茲發出第二個口令：“麵向我整隊集合！”學員們迅速排列成原來的隊列。
尼米茲學習刻苦，但他絕不是那種“兩耳不聞窗外事，一心隻讀聖賢書”的書呆子。他繼承了爺爺開朗活潑的個性，樂善好施，廣交朋友，他認識的學員比他的大部分班友都要多。他經常講一些得克薩斯州的故事為大夥消遣，有時他的故事還插進了一些驚人的妙語和黃色內容。對他來說，沒有什麼比同大夥在一起聊天更讓他高興了。
在校園橄欖球聯賽的季節，尼米茲認識了比他高一年級的比爾·哈爾西。值得一提的是，比爾·哈爾西盡管比尼米茲年高一級，但在整個太平洋戰爭中一直位居尼米茲之下。比爾綽號“公牛”，是尼米茲手下的得力幹將，兩人從學生時代培養起來的情誼，在共同從事的事業中一直得以保持。
一天傍晚，哈爾西練完球找到尼米茲，請他為自己遇到的麻煩出謀劃策。哈爾西說，我們穿工作服練球被海澤上尉發現了，海澤給違反規定的4個人記了黑點子。我已經被記3次啦！再有一次，就要在星期天被圈起來練球了。如果我不打算在星期天練球，就得在星期六把3個黑點去掉。
海澤上尉是一個三十出頭的單身漢。他隻有一個心眼兒，就是為發展海軍出力。由於兩次任期沒有提升他的級別，使他很惱火。辦事嚴謹、毫不通融是海澤上尉的一貫作風，他凡事喜歡循規蹈矩。對於這樣的軍官，尼米茲一般是不去觸犯的，但好朋友遇到問題，尼米茲又不能坐視不管。他想了想，也許是從小時候看到的爺爺的惡作劇中獲得了啟發，他很快想出了一個捉弄人的方案，哈爾西聽了直樂。
海澤上尉在星期三不管學員的操練，因為他要在這天下午去市鎮購物，回來時常抱著大包小包從軍人人行道回單身軍官宿舍。學校的東門是乘坐公用車輛下車的地方。這裏有一條人行道通到學員和未婚軍官的宿舍，濃密的樹木像籬笆那樣遮掩著這些房屋，前麵有1.5米高的鐵柵欄，通向各座房屋的人行道在每座房前20至30米處，從宿舍樓出來的人在人行道是看不見的。
這天，海澤上尉抱著東西從鎮上回來，向宿舍走去，走到人行道第一段路時，一個學員快步而出挺身向他敬禮，海澤吃了一驚，但很快想起來，小心地放下東西回禮，然後再拿起買來的東西。到了第二段路上又發生同樣的情況，走過第三段和第四段時也是這樣。這時開始下雨，海澤停了下來。當他走到第五段路上時，他隻好大聲吼了一句：“稍息！”
下一個星期三海澤回來時沒有帶東西，所以他走在路上沒有人阻攔他。再過一星期當他兩隻手又捧了一大堆東西回來時，學員們又對他敬禮。此後，學員們每當他回來不管有沒有帶東西，都站在各個路口等著。最後海澤上尉急了，揚言要開除他們，這才製止了這場鬧劇。這樣，學員穿工作服練足球的事也就不了了之了。
尼米茲對比爾·哈爾西說：“海澤上尉手上抱滿了東西，本來可以不還禮的，但我預料到他不會違反條例。”比爾·哈爾西大笑不止：“我說過，你的高招會解決我的問題的。”
1904年9月，尼米茲所在的班休假返校時，班克羅夫特大樓的第一個側樓已經竣工，他們作為高班生，住進了新樓。那時尼米茲已是戴三條杠的第8連連長。為了督促服裝店趕製畢業服，他們班被允許在課餘時間“自由出入”安納波利斯大門，尼米茲曾回憶說：“我們充分利用了這個特權。”
周六下午，尼米茲和同班的一些同學為了活躍生活，決定組織一次屋頂晚會。尼米茲負責去買啤酒。他身著袖上綴著三條杠、領上掛著三顆星的軍服，昂首闊步地走出軍營大門。