話說張凡的靈魂被一顆珠子帶著，穿越了無盡時空，也不知道過了多少年，終於有一天，珠子進入了一個無邊的混沌世界，帶著張凡的靈魂紮入了混沌靈根菩提樹內。
歲月悠悠，張凡終於從沉睡中醒來，突然一股大量的信息湧入大腦，張凡隨之就昏迷過去了。
混沌不記年，萬年時光匆匆而過。
當張凡醒過來的時候，他已經明了的前應後果。
他穿越了！被混沌珠帶回了混沌時期，成為了混沌菩提樹，此時還沒有盤－古開辟的後世的洪荒世界，混沌珠為混沌至寶，混沌中的靈寶分為先天靈寶，先天至寶，混沌靈寶和混沌至寶。先天靈寶分四級，下品先天靈寶，含1－12道先天禁製，中品先天靈寶含13－24道先天禁製，上品先天靈寶含25－36道先天禁製，37－45道先天禁製的靈寶為極品先天靈寶，先天至寶含46－49道先天禁製，取天道四九之意，其中45道禁製的極品先天靈寶又叫做頂級先天靈寶或者半步至寶，因為隻要加入大功德頂級先天靈寶就有可能成為先天至寶。混沌靈寶含50－53道先天禁製，混沌至寶含54道禁製。混沌珠就是一件54道禁製的混沌至寶，內含完整的造化大道，可演化世界。要知道混沌中隻有四件混沌至寶，分別是三十六品混沌青蓮，開天斧，造化玉蝶，混沌珠，前三件全部為盤古所得，盤古不愧為大道之子！
先天靈根分為下品，中品，上品，極品，頂級五種，混沌靈根隻有玄天級混沌靈根和造化級混沌靈根。頂級先天靈根相當於先天至寶，玄天級混沌靈根相當於混沌靈寶，造化級混沌靈根相當於混沌至寶，如三十六品混沌青蓮相當於混沌至寶，張凡的本體菩提樹就是玄天級混沌靈根。
當張凡接收完菩提樹的傳承之後，知道了混沌修煉境界的劃分。混沌中修煉等級分為真仙，玄仙，金仙，太乙金仙，大羅金仙，混元大羅金仙，混元太極金仙，混元無極金仙以及混沌境，大道境。
張凡接收了菩提樹的記憶，和對大道的感悟，修為堪堪達到真仙初期，他從菩提樹的記憶中得到了一篇可以修煉到大羅金仙的功法，他將之命名為菩提大道訣，表明自己的向道之心，隻為大道！就在張凡準備開始修煉的時候，一股心悸傳來，他知道這是大道讓他發誓，他也不拖拉，立馬發誓：“大道在上，從此隻有混沌菩提樹菩提道人張玄，再無後世玄道子張凡”。發完誓後立即趕到元神一直清爽，要知道修士從不輕易發誓，一旦發誓必須實現誓言，否則輕則修為難以寸進，重則神魂俱滅。不過張凡不在乎，他矢誌向道，雖九死其猶未悔。
發完誓後張玄開始修煉，混沌不記年，眨眼睛數萬年過去，張玄的修為卡在太乙巔峰一千年了，混沌珠也祭煉了36道禁製，之後就難以祭煉了。他知道苦修已經沒有作用，必須提升心境，找到自己的道。於是他準備出去遊曆混沌。
就這樣，一顆菩提樹悠悠的在混沌到處遊走，見到一些混沌頑石什麼的就刷的一下一下收到菩提樹的內空間（每顆先天靈根都有，混沌靈根更不用說了）。如此數萬年下來，雖然靈寶沒有找到一件（此時盤－古和三千魔神還在孕育中，那些靈寶還沒有孕育好），但是混沌頑石被他找到了幾百顆，還找到了一團999粒混沌萬土之祖混沌息壤，要知道就是後世洪荒萬土之祖九天息壤就是混沌息壤所化。還有一些混沌精金，這可是煉製靈寶的頂級材料啊！
在這萬年中，菩提的修為也到了大羅金仙初期，他現在要考慮化形的問題了。
要知道混沌有四大混沌靈根，分別是造化級混沌靈根三十六品混沌青蓮，其餘三大玄天級混沌靈根分別為人參果，菩提樹，葫蘆藤，本來混沌靈根是不會產生靈智的，否則一但以本體化行就是混元大羅金仙修為，也就是洪荒中的聖人之境，要知道普通的三千混沌魔神剛剛出世時也就是大羅金仙罷了，所以大道是不允許的。
現在擺在張玄麵前有兩條路可走，一是放棄本體以元神化形而出，將本體練成本命法寶，不過這樣一來他的資質就大大降低了，要知道他一旦以本體化形資質不下於一般的混沌魔神，甚至可以比肩排名前十的混沌魔神，但是一旦元神化形他的資質最多相當於後世的三清。二是找一些其他的靈物借以化形。