大蛇丸看著手裏止殤給的資料，裏麵的記載不知道真假，但是記載的東西說的一套一套的，邏輯很通順，連止殤的強大精神力配合氣機感應都不能進行基因層次的探索，大蛇丸就更不要說了，但是這個資料同時附帶了可以用來研究基因的設備的基本原理，在這個奇葩的高科技和查克拉同事存在的忍界，大蛇丸可以通過忍術和高科技的結合弄出一套設備來，反正錢也來的容易，大蛇丸決定試試。
正在大蛇丸想著為什麼止殤會有這種資料的時候，有名手下急急忙忙的闖了進來，對他氣喘籲籲的說：“大大大人，有木葉的忍者闖進來了，實力很強。”
大蛇丸很是淡定，心想該來的總算來了，出去見見也好，吩咐到：“去通知佐助，秘密帶他去3號基地。”
那個人趕忙答應：“是，大人。”
大蛇丸不再管他，把止殤給的資料塞進了一條通靈蛇的嘴裏，大步向外走去，當他從通道中往外走的時候沒有發現在自己的腳底下香子正以土遁術向裏走去。
當大蛇丸來到基地的外圍的時候，木葉眾人正在自己的基地裏大發神威，手下們正在節節敗退，沒有救援手下的意思，大蛇丸直接看向了同樣沒出手的自來也。
自來也不再是當年的那個單純的想要把大蛇丸帶回木葉的自來也了，現在和大蛇丸的關係在大蛇丸殺死了三代的時候就不再是夥伴了，而是徹底轉變成了仇人，看著這個天賦高絕卻走上邪路的曾經的隊友，自來也的眼裏不再是信任和期盼，而是憤怒的火焰。
“大蛇丸！一決生死吧！”說完自來也咬破手指雙手結印往地上一按，瞬間召出了一隻巨型蛤蟆——文太。
大蛇丸看著憤怒的自來也，發出嗬嗬的笑聲，配上他蒼白的麵孔和此時邪惡的表情，就像一尊地獄爬出的惡鬼，也是雙手結印召喚出了萬蛇，兩人宿命的對決馬上就要展開。
看到大蛇丸完好如初了雙手，自來也的表情變得凝重，本以為大蛇丸沒有了雙手這是自己報仇的好機會，卻不知怎麼的大蛇丸的手竟然好了，自來也問到：“你的手怎麼好了？”他沒指望大蛇丸會回答，隻是要分散他的注意力。
大蛇丸卻回答了，而且答案直接分散了自來也的注意力，“嗬嗬，是你的好弟子濱崎止殤為我治好的，在做老師這一方麵是你唯一超過我的地方，嗬嗬嗬。”
自來也的眼神有些黯淡了，他不自覺的小聲的問著：“為什麼？為什麼你們這些天賦超群的家夥都要走上邪路，都要背叛木葉？”
他的聲音雖小，大蛇丸卻聽得一清二楚，神情嚴肅了很多，平淡的回答了他：“我們的理想不是你們這些凡人可以理解的，這個世界上唯一能夠理解我的大概就隻有止殤君了，我不得不再次讚歎你的好運，總是能夠遇到天賦卓絕的弟子，波風水門是，止殤君也是，即使你沒有教過他們什麼，他們一樣都走上了巔峰。”
自來也的眼神更加黯淡了，自己對止殤的教導確實太少了，他如今背叛了木葉和自己的放任有很大關係，如果自己多多引導，他也許就不會叛逃，自己聽到止殤最後的一句話是止殤說他想回家，那樣一個急切的想要回家的少年怎麼就背叛了自己家所在的村子，村子不也是家麼？對於他在心裏問的問題，大蛇丸是不會回答他了。
看到失神的自來也再也沒有了繼續調戲的興趣，自己基地最重要人的應該都走了，最重要的東西被通靈獸帶回了通靈界，剩下的都是些無關緊要的貨色，沒什麼好留戀的了，於是趁著自來也失神，融化在了蛇頭裏，“破兒”一聲想連人帶蛇都不見了。
回過神來的自來也問文太為什麼不阻止大蛇丸的逃跑，文太的回答是不想做無謂的戰鬥，最後木葉一行人隻收獲了大量的各種研究資料、設備和剿滅了一個大蛇丸的窩點，本來的目的一個也沒有達成。
和一個帶路人一起在去往另外一個基地的佐助在半路遇上了自己日思夜想的最想見到的哥哥和最想殺死的仇人宇智波鼬。看見仇人的佐助瞬間變成了自己的最強形態，用出了自己最強的忍術，在他和鼬之間劃出一道閃電，但他的手和身體隻是撞破了一個幻影，耳邊傳來了仇人的話，“你為什麼還是這麼弱？我可愛的弟弟，憑著宇智波的優秀血脈，盡然連一個普通忍者的兒子都遠遠不如，這是為什麼呢？佐助。”
佐助自己也想問為什麼，他大喊一聲：“閉嘴！今天我要殺了你！”這句話，他自己都不信，但是他還是義無返顧的衝了過去，但是如果止殤現在在這裏的話他不會覺得不可能，因為他不久才從佐助身上知道信念意誌竟然可以成為一種力量，而且效果很神奇。
佐助的信念並沒有達到可以影響現實的地步，無謂的衝刺換來的隻是疲憊，輕易的被鼬製服了，鼬討厭的聲音又一次傳來“太柔小了，太柔小了，根本就不值得我出手，看來你的恨還不夠，月讀！”噩夢又一次次的在出現，殘酷的場景一次次的衝擊著佐助的心智，直到他失去了意識。