，命令當地百姓出役看守墳塋，他打算將來把她遷葬在徐皇後陵中。因為思念權妃，朱棣對她的哥哥更加厚待。在給他授予誥命時，朱棣不禁含淚傷歎，悲痛得說不出話來。
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權妃為什麼突然死去，起初無人猜疑。但一次呂美人和權貴妃兩家的奴婢在吵罵中卻透露了不尋常的消息。權貴妃入宮時，皇後徐氏已死。朱棣讓她接替皇後，掌管六宮的事。呂美人對此十分不滿，曾麵責權妃說：“有子孫的皇後也死了。你管得幾個月，這般無禮！”於是，呂美人串通宦官金得、金良，從一個銀匠家裏借來砒霜，研成末子，放進胡桃茶中送給權妃吃了，權妃因而斃命。朱棣得知此情，大怒，將內官、銀匠一並處死。呂美人罹刑最慘，朱棣命用烙鐵烙她一個月，最後將她殺死。呂美人在宮的從人也一起被殺，牽連被株殺者達數百人。朱棣還逼迫朝鮮王廷將呂美人的母親抓來殺了
。但這實在是一個冤獄，直到永樂晚年才大白於天下。
原來，權貴妃、呂美人等被選入宮後，又有商人之女呂氏被選入宮。呂氏因與呂美人同姓，欲相結好。但呂美人不樂意，呂氏因而懷恨在心。後來權貴妃猝死，呂氏便乘機誣告呂美人毒死了權妃，以致造成上述的慘案。
後來，呂氏和宮人魚氏行為不檢點，與宦官私通。朱棣雖有察覺，但卻因寵愛呂、魚二人而未做處置。二人知道隱秘泄漏，懼罪自縊。這一下事情就鬧大了。朱棣認為壞事都因呂氏所起，便把呂氏的侍婢都拘來審訊。這些侍婢不勝拷掠，便違心認罪，說是要謀殺朱棣。既然問出了大逆之罪，一場刑殺的大禍就不可避免了，連坐被殺的竟達兩千八百人。行刑之日，朱棣親臨刑場監督，要眼看著將她們一一剮死。有的宮人臨刑時當麵大罵朱棣說：“你自家陽衰，所以人家才和宦官私通，這有什麼罪？”朱棣為了懲戒後人，讓畫工把呂氏與小宦官相抱的情況畫下來。但是，他對魚氏的思念卻難以割斷，命人將魚氏葬在壽陵的旁邊。
這案初發時，朝鮮人嬪妃任氏、鄭氏便自縊而死。黃氏、李氏被鞫處斬。黃氏死前援引了很多人。李氏說：“反正都是死，幹嗎要牽連別人！要死我自己死！”終於不誣一人。這時朝鮮諸女大都被誅殺，隻有崔氏在南京而幸免。朱棣曾命南京的宮女北上，崔氏因病未成行。慘殺開始時，韓氏被幽閉在空室，好幾天不給飲食。守門宦官可憐她，有時在門口放些吃的，因而沒有餓死。但她的從婢卻全部被殺了。韓氏的乳母金黑也被囚於獄中，事後才得赦免。
就在朱棣濫殺的時候(永樂十九年)，四月初八庚子日夜晚，雷雨交加，奉天、華蓋、謹身三大殿被雷擊中起火。大火衝天，力救不及。經十餘年耗盡民財才修建成的壯麗宮殿，就這樣化為灰燼，很多人喪身火海。宮人們卻慶幸火災的發生，以為天降的大火可能會使皇帝的虐殺稍稍收斂。在當時的人們看來，天變是對人事的懲戒。人事有錯誤，天才震怒降災。
第二天，朱棣下了一道詔書，對上天的懲戒表示自責：
朕躬膺天命，祗紹鴻圖，爰仿古製，肇建兩京，乃永樂十九年四月初八日奉天等三殿災，朕心惶懼，莫知所措。意者於敬天事神之禮有所怠歟？或法祖有戾而政務有乖歟？或小人在位賢人隱遁而善惡不分歟？或刑獄冤濫及無辜而曲直不辨歟？或讒慝交作諂諛並進而忠言不入歟？或橫征暴斂剝削掊■而殃及田裏歟？或賞罰不當財妄費而國用無度歟？或租稅太重徭役不均而民生不遂歟？或軍旅未息征調無方而■餉空乏歟？或工作過度徵需繁數而民力凋弊歟？或奸人附勢群吏弄法抑有司■茸罷軟貪殘恣縱而致是歟？下厲於民，上違於天，朕之冥昧，未究所由，爾文武群臣受朕委任，休戚是同，朕所行果有不當，宜條陳無隱，庶圖悛改，以回天意。
朱棣認錯反省的態度似乎極為誠懇。到了十三日，朱棣再次下詔，宣布將“見有不便於民及諸不急之務者，悉皆停止，用蘇困弊，仰答天心”。然而，後宮的殺戮並未被列入他的反省範圍之內，朱棣“恣行誅戮，無異平日”，並沒有停止對宮人的誅戮。先後因二呂之案被殺的竟有三千多人。
朱棣如此狂殺濫誅，還有一個原因。朱棣晚年龐愛貴妃王氏。據說王氏有賢德，侍奉皇帝皇後恭謹如一，在宮闈之內肅雍有禮，和藹仁厚，掌理庶務有條不紊，甚為朱棣所重。朱棣晚年有病，常常發脾氣，王貴妃常常從中調護，以免宮人們受到譴責。自皇太子、親王公主以下都很信賴王氏。朱棣甚至有立王氏為皇後之意。王氏的死，使朱棣痛悼不止，更加重了他的喪心風病。自此以後，朱棣處事更多錯謬，用刑也更加殘酷了
。
朱棣在臨死前的幾個月還要求朝鮮進獻美女，這時朱棣已經是六十五歲的老人了。
然而，這些可憐的淑女，不論是何處選來，也不論受寵與否，最後在宮中也難免一死。原來，明朝初年仍然保持著為皇帝殉葬的製度，朱棣死時，被殉葬的宮人有三十餘人。即使最受寵愛的韓氏和在呂氏慘案中幸免於難的崔氏亦在其列。殉死那天，要賞她們一頓酒宴，隨後，把她們領入大堂，這時大堂上已經安置好了許多小木床。隻聽得哭聲震天，宮人們一個個被強迫站在木床上，把頭伸進吊好的繩套中。站在一旁的宦官將床一撤，宮人們便升天了。韓氏死時，呼喊著自己的乳母說：“娘，我去了！娘，我去了！”喊聲未絕，床已撤去。雖然殉葬者的家屬被稱為朝天女戶，受到優恤，殉葬者也會得到好聽的諡號，並被葬入皇陵，但這又怎能補償她們被斷送的青春和被虐殺的生命！