現在，黨衛軍裝甲軍繼續保持著對頓涅茨的攻勢，因此，所屬的3個黨衛軍裝甲擲彈兵師必須齊頭並進，向北以及東北麵保持對蘇軍的壓力。骷髏師從丘古耶夫——維希尼基·薩多夫之間發起攻擊，帝國師則在其左翼並進，以及希特勒警衛旗隊師則護衛著北翼，並向別爾戈羅德挺進。3月16日，骷髏師遭到了從其他方向上退下來，試圖突圍的蘇軍的攻擊，經過整整24小時不眠不休的戰鬥，骷髏師最終擊退了所有的攻擊。3月17日，第6裝甲師到達丘古耶夫東南麵，並與鮑姆戰鬥群取得聯係。後者完成了肅清丘古耶夫小鎮的任務，並隨後前往尼波科內達亞的東南麵，掩護朝別爾戈羅德進攻的黨衛軍裝甲軍右翼。
三、向北麵進攻
3月18日，由於帝國師和希特勒警衛旗隊師順利的向別爾戈羅德挺進的情況下，黨衛軍裝甲軍向第4裝甲集團軍指揮部提議派遣骷髏師前往穆羅姆，去消滅那些仍殘留在後方頓涅茨西岸的蘇軍。因此，骷髏師接到全師轉向北麵的命令。3月19日時，德軍拿下了別爾戈羅德，並且幾乎將頓涅茨西岸和哈爾科夫東北麵的蘇軍全殲，為南方集團軍群的勝利反擊畫上了完美的句號。但也不能算完全徹底的成功，馮·曼施坦因的目標都沒有實現，他本人極想乘此機會，與北麵的中央集團軍群一起，對庫爾斯克實施相向突擊，圍殲突出部內的蘇軍重兵集團，並縮短德軍戰線。然而，麵對蘇軍強大兵力的阻擊，德軍兵力有限，加之大地已經解凍，曼施坦因不得不在3月22日停止了進攻，轉入防禦。此戰，德軍南方集團軍群宣布在戰場上擊斃蘇軍23000人，俘虜9000餘人。至於德軍方麵，他們的損失同樣巨大：黨衛軍裝甲軍在戰場上總共損失了365名軍官，11154名士官和士兵（包括陣亡，負傷以及失蹤）。在1943年2月10日至3月20日這一期間，骷髏師累計有94名軍官，2170名士官和士兵陣亡，負傷，或失蹤。在數量上的驚人損失，使得黨衛軍部隊隻能將那些沒有戰鬥經驗的新兵補充進部隊，而這些新兵再不是當初進入黨衛軍部隊那種超高標準的精銳了。另外，哈爾科夫戰役的直接結果是在庫爾斯克地區形成了一個巨大的突出部。
四、隊伍的整編
4月1日，骷髏師在斯達裏察與第6裝甲師換防，並劃入在別爾戈羅德的勞斯軍級戰鬥群麾下，並得到了黨衛軍裝甲軍軍屬火箭炮營的加強。4月10日，骷髏師的現任師長馬克斯·西蒙因為負傷離開，將返回德國一所醫院治療。赫爾曼·普裏斯接任師長一職。骷髏師其他的人事變動為：師屬裝甲團的團長萊納，以自己能力不足為由主動離職，隨後團長一職由來自黨衛隊指揮總局的庫斯特曼少校接任。炮兵團團長一職在普裏斯提升為師長後，由約瑟夫·斯溫特克少校擔任。普裏斯立刻著手對軍士和候補軍士進行訓練，使得他們能夠彌補人員的空缺。狙擊手和駕駛員也在培訓中，普裏斯還調整了一些人員：新的後勤處長是施圖茨貝歇爾上尉，偵查營交給了克龍上尉，他原先的防空營營長一職，現在則由菲爾蘭德中尉擔任。6月，克勒少校成為骷髏師的參謀長，桑德爾少校則被調往剛剛組建的黨衛軍第10裝甲擲彈兵師，他的職位由骷髏師炮兵團4營營長梅塞爾勒上尉接任。
骷髏師的“圖勒”摩托化步兵團由於在人員和裝備上的慘重損失，黨衛軍裝甲軍決定在4月19日，將該團解散，並縮編成1個營，最後連1個營都組成不了，不得不再次解散，全部編入偵查營，不過，兩周後，該團又得以重建，並正式成為“圖勒”裝甲擲彈兵團。
骷髏師從4月24日起，將其在別爾戈羅德北麵的防務交由第168步兵師。部隊主力駐紮在哈爾科夫的東北部，開始休整。5月和6月間，骷髏師炮兵團換裝了新的自行火炮。同時，軍官和士官被送往專門的訓練營進修，新的駕駛員和通訊兵也在培訓之中。並且，在得不到上級補充的情況下，骷髏師開始在烏克蘭當地的德意誌裔人裏征募新兵。這些新兵隨後表現非常不錯，隻是無線電發報員卻非常糟糕，原因是由於不太懂得德語。6月1日時，骷髏師終於迎來586名軍官，2964名士官和16567名士兵，使其總人數達到19999人，並一直接受人員補充，到了6月底時，骷髏師總人數達到了21000人左右。骷髏師利用這段休整時間，大大提高了全師的訓練水平，6月22日，SS少將西蒙向骷髏師的暫代他職位的普裏斯作了最後的告別，隨後普裏斯正式成為骷髏師的師長。第二天，骷髏師就奉命前往德軍即將發動的“堡壘作戰”的出發陣地，為即將到來的大戰做準備。