崇禎十年皇帝要求江南緊急運餉的命令，被朱斌和曹桓二人聯手頂了回去。麵對曹桓的密折，崇禎沉思良久，忽然麵露怒容：
“江南朝廷富裕之地，焉能無銀？曹桓與朱由斌有殺師之仇，對朕又忠心耿耿，此必然是受到朱由斌脅迫，難道朕少了他朱由斌，就滅不得賊寇，定不了天下了嗎？”
其後，崇禎再次拿出內帑，交熊文燦十萬人六月餉銀，以安張獻忠等人之心，但這個時候的崇禎，卻在心裏對朱斌的猜忌又多了了幾分……
而隨著餉銀的到位，張獻忠看起來似乎本分了不少。
張獻忠、劉國能的投降引起了連鎖反應，混十萬馬進忠、射塌天李萬慶、曹操羅汝才、過天星惠登相、整世王王國寧、托天王常國安、十反王楊友賢、小秦王王光恩等部叛軍陸續投降，湖廣、河南的心腹之患一下子得以平息。
到了崇禎十一年的時候，朝廷局勢似乎得到了進一步的緩解，甚至麵臨著大好的局麵。
原來就在張獻忠投降的時候，五省總督洪承疇、陝西巡撫孫傳庭在陝西全力圍剿李自成、過天星等部賊寇，取得了前所未有的成效，賊軍接連受到挫折，幾乎近於瓦解。
李自成為了擺脫重壓，與殘存的六隊、祁總管等部合計三千人馬，由陽平關、白水江逃往四川。洪承疇命令陝西軍隊追擊，四川軍隊堵截，經過幾次激戰，祁總管投降，六隊損失殆盡，李自成僅一千人馬出川，進入漢中的深山密林。
闖賊李自成不甘心失敗，走出深山密林，企圖進入河南，與尚未投降的革裏眼、左金王、老回回等部會合，因此必須從潼關突圍。
洪承疇獲悉這一動向，命令孫傳廷在潼關南原布置埋伏，不讓一人一馬得以逃脫；又派曹變蛟從後麵追趕。李自成邊戰邊退，在潼關南原遭遇埋伏，陣腳大亂，全軍覆沒。狼狽的李自成丟棄妻女，與劉宗敏、田見秀等十八人策馬逃往商洛山中。
眼看著剿匪一步步順利實施，賊軍已被逼得無路可走。可是崇禎卻還深陷在了一個問題裏，“虜”與“寇”――外患與內憂困擾著崇禎。十一年五月初三日，他在中極殿召見大臣，要他們就這一問題出謀劃策。他的擔憂概括為八個字：“剿兵難撤，敵國生心。”也就是說，如何兼顧安內與攘外？
楊嗣昌第一個表達出了這的觀點，他認為就算強盛如光武帝者，為了穩定國內局勢，這位皇帝力排眾議，接受五官中郎將耿國的建議，接受匈奴單於的議和請求，實現了北方邊境的安寧。楊嗣昌的意圖十分明顯，就是主張與清朝議和，爭取時間全力從事“安內”。
在他的授意之下，遼東巡撫方一藻、總督太監高起潛派出一名算命先生周元忠，到清朝方麵試探口風，受到清朝方麵的禮遇。
皇太極表示，如果確實能夠議和，他願意撤兵東歸。楊嗣昌接到方一藻、高起潛的報告，向崇禎彙報：既然對方有意議和，不妨請他們在寧遠談判，這樣就不至於每年都有京師畿輔的岌岌之危，可以騰出手來平定“流寇”。因此請求皇帝準許方一藻、高起潛在談判中可以“便宜從事”，這一要求得到了朱由檢的默許。
使者周元忠回到寧遠，帶回皇太極寫給總督太監高起潛的一封信，信中說，同意和談，如果不能達成協議，“夏秋必有舉動”。方一藻在給楊嗣昌的私人信函中，極力主張“和議消禍”。
楊嗣昌隨後向崇禎報告了這一情況，並且強調指出，假如有人用計謀使滿洲鐵騎三年不來，那麼中原內亂早已平定了。按照自己的意思，用議和爭取邊關三年沒有戰事，以集中全部精力平定內亂。
一接到朝廷居然與金虜議和的消息，朝野上下亂成了一團，紛紛指責楊嗣昌通敵賣國。儒臣黃道周反對最為激烈，毫無商量餘地，認為必不可議和，議和必不可能成功，即使成功必不可能持久。