考慮到與培訓的銜接工作，此時不對庫存的準確性作進一步的要求，此時的入庫是為了便於支持同時開展的全員培訓需要，保證後期醫生培訓、藥房培訓等工作可以仿真進行。簡單地說，沒有庫存，醫生開不了處方，業務流程無法進行。
——與之相仿，要同步進行診療項目與收費項目類別的字典編寫工作。主要由臨床醫務人員參與完成。社區衛生服務信息係統中的臨床診療項目，主要包含臨床診療項目字典和收費類別項目的字典。可以根據社區衛生服務信息係統要求，結合本院工作實際，將診療項目字典庫分為護理、處置、檢查、化驗、麻醉、手術、營養、康複等部分進行編寫。護理、處置、手術項目名稱由各臨床醫務人員確定。檢查還可分為普通放射、放射治療、特殊檢查等。檢查、檢驗項目主要由各醫技科室製定，其中由各臨床完成的檢驗和檢查項目由臨床醫務人員提供。
在編寫“診療項目”字典時還應注意。
a.要確定哪些診療項目可以是一組診療項目的組合；哪些診療項目是給藥途徑的同義表示，同時隱含耗材的處理，如靜脈輸液——既含靜脈滴注治療，又暗含消耗針管材料。類似如檢驗項目的設置，醫生隻需要選擇“血脂四項”。具體的檢驗指標項就不需要一一輸入了。
b.要進一步確定哪一些治療項目需要打印紙質單據，如各種治療單、收費清單；
c.要確定診療項目的使用特征，如經濟特征——是否屬於醫療保險報銷範圍，費用的類別。
d.其他常用字典編寫簡介。如社區衛生服務基本情況字典。打印報表時提取社區衛生服務名稱。人員字典。為整個係統提供社區衛生服務內部人員及其屬性，需要明確其掛號收費標準、職稱級別、崗位權限、入院工作時間、學曆、進修經曆、特長。給藥途徑字典。為醫囑錄入提供給藥途徑選擇。用戶定義字典。各種照顧計劃。
（4）模擬運行階段。在完成上述基礎準備之後，培訓開始進入仿真模擬運行，各個業務相關人員可以同時進入角色，進行實際操作，以證實過程的完備性和錄入數據的正確性，做到心中有數。在模擬運行過程中，發現問題，隨時修改。模擬運行主要內容。一方麵要模擬工作流程，另一方麵又要檢驗基礎數據字典對應關係是否符合要求；通過分工檢測實現各個環節和功能的測試，更完整地檢驗和調試整個係統的性能。
具體的檢測分工如下。
由財務和收費監管人員負責監控門診收費處、住院收費處規章製度落實情況。負責核對價目表項目是否符合當地收費標準，以及會計項目分類、核算項目分類歸類的準確性。負責核對收費費別、身份及收費項目等基礎數據錄入的準確性，發票打印是否標準，項目歸類是否準確。負責核對收費結賬人員執行有關減免費、費別修改審批權限及減免額度的情況。參與門診收費和住院收費的日結、月結工作，監控日結賬與現金交接工作；核對會計轉記賬數據準確性；參與監控成本核算數據的準確性、可靠性。
由藥房庫管人員負責核對藥品采購的入庫上賬，藥品發放的出庫上賬及各藥房藥品請領的入庫上賬等數據的準確性和及時性。負責監控門診藥房、住院藥房、藥庫規章製度落實情況，核對門診藥房、住院藥房、藥庫的日結和月結工作，嚴格審核彙總數據的準確性。
由醫務管理人員負責檢查和監督所有醫療服務流程的業務工作，如門診掛號、入出轉院、數據錄入、護士工作站、綜合查詢，確保問診、檢查、診斷、治療、照顧等服務信息和醫療信息的準確性和完整性。
（5）正式運行階段。最後，在經過一定時間的嚴格調試、檢驗，解決了影響係統正常運行的問題，就可以進入正式運行階段。此時，需要進行正式的盤點工作。為了不影響實際工作的開展，可將盤點當日發生的全部處方另放一處，在盤點結束後，再將其輸入係統。為防止差錯，可以針對當日所用藥品清單，再次對當日所用這部分藥物進行盤點。這樣就可以確保電腦庫存與實際庫存保持一致了。
（6）運行後的管理問題。
①安全和隱私問題。安全和隱私問題是社區衛生服務信息資源管理中的另一個重要的方麵。安全機製實際上是一個信息係統中如何進行內部控製的問題。另一方麵，隨著Internet的普及，互聯網上的安全性問題也不容忽視。網上黑客、病毒、破壞性的惡意攻擊也可能給信息資源造成重大的破壞。對於社區衛生機構來說，Internet在帶來方便的同時也帶來了危險，如何確保居民的健康資料和社區服務的服務信息不被竊取或泄漏、遺失，都是十分重要的問題。
安全問題歸根結底是要由人來控製的，其控製的對象包括所有可能接觸到信息係統中的人員。僅僅靠技術不能完全解決安全問題，內部控製一定要建立在一係列工作程序和規章製度之上。在建立一個安全控製係統時需要考慮。係統的使用者應如何分工？各有什麼職責、權限？應當有哪些明確的規章製度，才能夠保證分工得以實現？可以處理哪些數據和信息？允許以什麼方式處理信息。查詢、修改、刪除、錄入？哪些信息的修改具有時間和其他具體條件的限製？或者不允許事後進行修改的限製？例如處方用藥，一經收費不允許修改。例如對於具有係統管理員權限的用戶的認定手續。必須經機構主要負責人書麵正式任命。如何進行對權限的分派和修改等，都必須按照明確的工作步驟或遵照規章製度來進行。
因為工作的需要，社區衛生服務機構內部的工作人員必然涉及一些個人隱私的數據。在社區衛生服務信息係統中，對個人隱私的信息保密如何處理也是重要的問題。社區衛生服務中的信息有多種保密要求。一般而言，居民信息對其他的居民是需要保密的；有的居民信息按當事人的要求，不僅對其他居民是保密的，對社區衛生服務機構內部的某些工作人員也應保密。對於某些特定的信息，哪些人可以讀、哪些人可以改寫、哪些人可以複製等，必須對此都給出嚴格的規定。對於重要的信息，可采用若幹加密和屏蔽的方法進行處理。對於可能連入係統的硬件設備作嚴格的控製，這是防止外來人員和外來不明安全物侵入電腦網絡的設備的一種有效的方法。譬如拆卸掉或拆封住某些外部連接接口。光驅、軟驅、USB接口……