李自成攻北京這段兒時間，大明王朝內部還有著很多勢力。
一是武將集團。
明朝末年，麵臨著內憂外患的嚴峻局麵，內有農民大起義，外有滿清的軍事威脅，軍事上的成敗直接關係著大明王朝的生死存亡，在這種情況下，武將的重要性空前突出，激烈的軍事鬥爭為武將勢力的崛起提供了舞台。
左良玉是明末著名的武將之一，早年在抗清鬥爭中嶄露頭角，受到破格提拔，不久奉命圍剿農民軍，積極作戰，屢次取得勝利，形成了一支著名的左家軍。明末文臣多庸碌無為，對武將多方掣肘，文武矛盾日益突出。在激烈的軍事鬥爭中，左良玉因不願受文臣節製，與文臣之間的矛盾日益尖銳，因而對朝廷的不滿傾向日增，開始積極擴充自己的軍隊，消極作戰，不聽指揮，不僅擺脫了文臣的控製，甚至使朝廷也無可奈何，最終形成了專製一方，不聽節製的軍事集團。
而其它武將也紛紛效仿，朝廷逐漸失去了對武將的絕對控製權，使明軍在戰場上一再潰敗，直接加速了明朝滅亡的步伐。
左良玉也早已經成為勇於虐民、怯於大戰的大軍閥，軍隊殺擄淫掠可謂無惡不作，比之農民軍的部隊還不如。
類似這樣的明朝武將勢力很多很多，說是官，其實比匪徒還不如，甚至更加的殘暴。
武將集團中必需提到一人，就是鄭芝龍，明末清初最大的海商兼軍事集團首領，先後歸附明清兩朝為官，鄭成功的父親，台灣鄭氏王朝的開創者。
鄭芝龍的一生，可以說精彩無比，比之各種穿越小說中的豬腳更像豬腳。
鄭芝龍18歲時，與兄弟齊至澳門的舅父黃程處學習經商，並於澳門接受天主教洗禮，教名Nicolas，因此也被西洋人稱作NicholasIquan（尼古拉·一官）。之後往來東南亞各地，後到日本九州，因習劍術，結識並娶了福建華僑鐵匠翁翊皇的義女田川氏為妻。一開始追隨於日本平戶島的華僑大海盜商人李旦門下，初時擔任翻譯等工作，逐漸成為李旦的得力助手。李旦過世後，鄭芝龍逐漸接收其勢力；1623年接收李旦的事業船隊，經營合法生意，另一手則走私。
1624年中秋後，芝龍將事業重心自日本九州島遷到台灣，歸附“日本甲螺”（倭寇首領）顏思齊。此後不久，荷蘭東印度公司登島，驅逐了以台灣為基地的其他勢力，鄭芝龍遂攜妻子定居於中國大陸。
1625年顏思齊死，芝龍結合諸海盜首領，號稱十八芝，擁有當時福建沿海實力最強大的一支武力及商業團隊，領導海賊數萬人，經營走私與劫掠事業，橫行於台灣海峽。當時泉州府同安知縣寫給福建巡撫的文書中說鄭芝龍雖事劫掠，但對泉州百姓卻是異常仁慈，不但不殺人，甚至救濟貧苦，威望比官家還高。“所到地方但令報水（即通報官府蹤跡），而未嚐殺人。有徹貧者，且以錢米與之。”
1628年，受福建巡撫熊文燦招安，成為官員，率領原部，為明廷守備沿海以防海盜倭寇和荷蘭人進攻，率軍討伐其他昔日結拜契兄弟海盜力量，包括李魁奇、鍾斌，官至總兵。不久便返回福建泉州南安老家，成為當地首富，也是少數迎娶了日本人卻仍能正式返回中國內地的海盜。
1633年芝龍於福建沿海金門海戰擊潰荷屬東印度公司艦隊，從此控製海路、收取各國商船舶靠費用，鄭芝龍也因此迅速富可傾國。儼然稱為閩南的領主與海上霸主，並對繳保護費給芝龍的商船（一艘大船需繳三千兩銀錢），給予鄭家的令旗；如不繳費而想經過芝龍海域的，恐怕難逃被劫的命運。芝龍如此強橫，使荷蘭東印度公司營運不寧，荷蘭人數度聯合其他勢力合取芝龍，但芝龍仍持續擴張其勢力，並將荷蘭人次次打敗。
不久，鄭芝龍應明朝廷要求，繼續率軍討伐其他昔日結拜契兄弟海盜僅存最大股力量劉香，於虎門大獲全勝，名震福建官至都督。不久福建省內發生旱災，鄭芝龍提議載饑民移民台灣，並給予移民十分優惠的資助條件，有人認為其為開創了大規模移民台灣之先河。
如果姬慶不出現，那麼不久之後，南明弘光皇帝冊封鄭芝龍為南安伯，福建總鎮，負責福建全省的抗清軍務。
無論是左良玉，還是鄭芝龍，都是姬慶收服的對象。左良玉，不值得一提。鄭芝龍，可謂大材，不過，姬慶是不可能允許這股處於半獨立的勢力繼續存在，他們必須接受大明朝廷的整編，改造為未來的大明朝海軍。其控製的海上貿易，也要交給朝廷，設立海關，征收賦稅。
當然，姬慶知道就算鄭芝龍會同意，他的勢力中的既得利益者，也不會同意的。利益之下，人是什麼事情都會做出來的。
二是農民軍集團。