除了安置災民、監督新式武舉考試和征募士兵等紛繁的公務外，李雲天還有兩件事情必須要做，那就是清理交趾各府縣不合格的官員，以及嚴懲投靠叛軍的土民。
在李雲天看來，交趾的境況之所以會到今天這個地步，各個府縣的官員難辭其咎，如果他們盡職盡責的話交趾百姓就會過上安穩的日子，誰還會跟著黎利等人造反？
很可惜，交趾的大多數官員素質低下，想著來交趾撈上一筆的，像羅通和何忠這樣進士出身的官員寥寥無幾，故而那些官員不再適合繼續在交趾為官。
故而，李雲天對交趾五品以下的官員進行了一次考核，以檢驗其在交趾為官時的政績，不合格者將被革職，貶為庶民。
李雲天之所以選擇五品以下的官員，是因為宣德帝給予了他交趾五品以下官員的任免大權，故而李雲天擁有著將五品以下官員革職的大權。
雖然五品官看上去好像不大，但一個府的知府也不過才是正四品，而一個府中正五品以上的官員隻有兩三個。
這意味著李雲天掌握著交趾百分之九十五以上的官員的仕途命運，職權之重大明前所未有。
由於交趾的戰亂，交趾各府縣的官員幸存者隻有一半，另外一半在戰亂中死於非命。
經過李雲天的考核，剩下的這一半官員中在考試後得以留任的僅僅隻有兩成，其他的官員考試成績一塌糊塗，有的官員連一些最基本的政務都不清楚，也不知道他們平常都做了一些什麼。
本來李雲天想放那些官員一馬，畢竟交趾的事情已經發生，當務之急是平叛，可當他看見那些慘不忍睹的成績單時不由得勃然大怒，絕對給那些屍位素餐的家夥一個教訓，故而以玩忽職守的名義懲治了一批倒黴蛋。
對於那些通過考核的官員，李雲天則大力提拔，將他們安置在了明軍管轄得的府縣中，以協助各地知府處理好本地的事務。
與此同時，李雲天還大張旗鼓地麵向交趾各府征召吏員，用以維持各個地方衙門的運作，並且明確了那些吏員的俸祿由交趾布政使司發放，其人員編製也屬於交趾布政使司所管轄，不再由各府縣衙門自行任命。
當然了，那些吏員的編製歸於交趾布政使司後也就成為了“流官”，交趾布政使司將根據需求安排他們到相應的府縣任命。
尤為重要的是，李雲天還公布了吏員的俸祿體係和晉升製度，將吏員像官員一樣分為了數等，每提升一等其俸祿待遇相應提高，其職權也隨之擴大。
而且，政務優秀的吏員將會被交趾布政使司提升為從九品的官員，自此踏入仕途。
不過，並不是任何人都能擔任吏員的，要想成為吏員的話也必須要通過相關的考試，隻有考試合格後才能成為吏員。
李雲天通過這種方式不僅組建了交趾的吏員體係，而且還一舉打破了交趾地方上的權力構架。
通常來說，地方上那些大族的族人往往會在地方衙門裏擔任吏員，使得那些大族在當地的勢力更加穩固，也滋生出了許許多多的問題，李雲天要切斷那些地方大族與衙門的這種密切聯係，以便官府掌控當地的局勢。
除了懲治那些不合格的官員，李雲天還嚴懲了投靠叛軍的土人，主要是那些趁機燒殺劫掠的暴民，對那些暴民的惡行一經查明後立刻嚴懲，罪輕者流配到廣西和雲南，罪重者就地處斬。
在李雲天昏天黑地的忙碌中，明軍所掌控的交趾州府的社會局勢迅速穩定下來，農業和經濟開始複蘇，展現出了一副欣欣向榮的景象。
為了交趾的農業事宜，李雲天從內陸運來了不少嶄新的農具，按照各家成年男丁的數目免費提供給交趾的鄉民和災民，使得那些鄉民大喜過望，要知道農具就是他們賴以生存的武器，有了那些好農具會使得他們種出收成更好的地來。
尤為重要的是，李雲天為了得到交趾的民心做出了一件從根本上改變交趾勢力格局的事情，大張旗鼓地進行了一場土地革新，幾乎將交趾原先的地主階層一網打盡，將他們的土地分給了交趾的百姓。
此舉一出，立刻使得李雲天在交趾獲得了百姓的支持和擁護，田地是古代社會最為重要的資產，每名百姓都希望擁有屬於自己的田地，可惜田地被那些地主階層所霸占，而李雲天使得他們擁有了田地。
當然了，李雲天的這個舉動立刻遭到了交趾地主階層的反對，這使得明軍的轄地內相繼出現了騷亂和暴亂。
不過，隨著秦昆和韓衛等明軍的強勢介入，尤其是在交趾當地百姓的支持下，明軍順利地平定了各地的騷亂、暴亂，將那些鬧事的地主階層悉數抓捕，或就地處斬，或流配到廣西和雲南。