隨著現代生物技術的發展，轉基因食品已逐步進入普通百姓的生活。由於轉基因食品所具有的潛在非安全性，為保護廣大消費者的權益，滿足其選擇和知情權以及出於國際貿易的需要，轉基因食品的檢驗越來越引起各國政府和有關食品監督機構的重視。目前，基於GMO特異DNA片段的定性PCR篩選方法已廣泛應用於GMO（Genetically Modified Organism）食品的檢測，一些國家將此作為本國有關食品法規的標準檢測方法。
一、轉基因食品的定性檢測
（一）PCR-ELISA法用於轉基因食品的定性檢測
PCR-ELISA是一種將PCR高效性與ELISA高特異性結合在一起的轉基因檢測方法。利用共價交聯在PCR管壁上的寡核苷酸作為固相引物，在Taq酶作用下，以目標核酸為模板進行擴增，產物一部分交聯在管壁上成為固相產物，一部分遊離於液體中成為液相產物。固相產物可用標記探針與之雜交，再用堿性磷酸酯酶標記的鏈親和素進行ELISA檢測，通過凝膠電泳對液相產物進行分析。該方法靈敏度高，可靠性強，易於操作，適於批量檢測，是適合推廣的一種快速轉基因檢測方法。
已有的研究報道，在應用PCR-ELISA法快速檢測轉基因食品的方法中，關鍵因素主要是以下幾個方麵。
1.固相引物的包被
固相引物的包被是指利用特殊試劑將5′磷酸化或氨基化的引物特異性地固定在附著物上，通常用處理過的PCR管壁充當附著物，目的是方便隨後的PCR擴增。一般認為，理想的固定是DNA分子的單一位點共價固定在附著物上，包被上的DNA分子可以通過同位素標記探針進行定量，通常有20～50ng的核酸分子可以吸附到管壁上並排成1~2nm長，高濃度的寡核苷酸並不能提高吸附量。包被的效果與溫度、時間、核酸分子的濃度以及緩衝液的種類和pH等有關。
2.PCR擴增
在包被寡核苷酸的管內進行PCR擴增，擴增條件因目的片段而異，對35S啟動子和Nos終止子，PCR反應體係一般為：10倍緩衝液5μL，25mmol/L Mg2+ 4μL，10mmol/LdNTPs 1μL，25μmol/L引物11μL,8μmol/L引物2(固相引物)1μL，Taq酶2U，加水至50μL。固相引物與液相引物的濃度比值決定了兩種產物的量，1∶1利於瓊脂糖凝膠電泳檢測，8∶1利於雜交檢測，同時也適合凝膠電泳分析。35S啟動子和Nos終止子的擴增條件一般為：94℃ 5min，54℃ 55s，72℃ 1min，1個循環；94℃ 30s，54℃ 50s，72℃ 30s，35個循環；72℃延伸8min。NPTⅡ的退火溫度為50℃。
3.ELISA檢測
變性後的固相產物在5倍SSC(含0.5％BR)中雜交1h，雜交後用0.5倍SSC，0.1%吐溫20洗掉非特異性結合的探針，加入100μLAP(1∶2500)使之與探針上的地高辛結合，10mg/mL的PNPP顯色30min後，通過酶標儀讀數(波長為405nm)。去掉空白對照，高於10為陽性，低於0.1為陰性。
PCR-ELISA法將PCR擴增的高效性和ELISA的高特異性結合在一起，靈敏度高達0.1%，足以達到歐盟的要求(轉基因檢測閾值為1％)。歐盟利用PCR技術對轉基因玉米和大豆的35S啟動子和Nos終止子進行水平測試時，檢測靈敏度達到2％，而對於含量為0.5%的105個陽性樣品則出現3個假陰性結果，並且許多電泳條帶模糊。而利用PCR-ELISA對轉基因大豆的檢測靈敏度比歐盟推薦PCR方法提高5~10倍。
（二）反轉錄PCR(RT-PCR)用於轉基因食品的定性檢測
最早報道RT-PCR的是Larrick(1992)，他利用該法檢測外源基因在植物細胞內的表達情況。RT-PCR的原理是以植物總RNA或DNA為模板進行反轉錄，然後再經過PCR擴增，如果從細胞總RNA提取物中得到特異cDNA擴增帶，則表明外源基因得到了轉錄。該方法適用於通過檢測外源基因表達情況來檢測是否是轉基因食品。實驗可以以總RNA為材料，也可以以mRNA為材料，不同的材料在方法上不同，以下的具體操作供參考。