對於實施這個計劃，德納克顯得極其躁動。
基於在“斯布雷帝”的工作經驗，他本來可以勝任研究主管的職位，但近來發生的一些事有些阻礙到他對公司業績的影響，加上幾個不支持者的反對，最終還是沒有當上SP大樓的管理人。
在Sanfer市病毒兩次泄露之後，克瑞斯的搭檔佩吉決定和他一起離開“斯布雷帝”
然而不僅僅是離開，他們需要對自己製造的這次災難*件負責。病毒樣本仍然保存在倫娜·克裏夫斯特手裏，她是市政廳的安全主管，同時也是“斯布雷帝”安排在政府的線人。但是這個在曾經在CIA（中央情報局）待過的女人可不是個傻瓜，她用隨身帶的微型攝像機錄下了德納克和泛美組織簽訂大規模對外醫藥援助的畫麵，沒錯，當然沒有得到當局的授權。
同時憑著信用製度潛入病毒研究室，拿走了爆發後唯一的樣本。
沒有人知道她現在在哪裏。佩吉通過在聯邦署的網站了解到倫娜曾服役摩根部隊，任研究員，主要做實驗工作。也許現在她在為他們工作。摩根特別行動部隊是一個早年在中東支援的小分隊，下設突擊隊、尋找者和實驗組。
碰巧的是部隊有一個分部的基地在Sanfer市，兩人需要潛入這個基地尋找倫娜。
整個城市基本上都被病毒感染，人們呈現出惡性的狀態，好鬥且極具攻擊性。政府已經撤離，“斯布雷帝”也將在這裏的總部轉移。克瑞斯和佩吉需要穿過整個鬧市區來到一間隱蔽的工廠，下麵就是摩根基地。
然而經曆不友好的市民的“歡迎”來到基地的他們卻並沒有發現任何人，這個地方看上去早已被丟棄。
由於事件進一步惡化，城市內百分之七十的人感染病毒，於是政府決定實行“星球小姐”計劃，毀滅Sanfer。然而這項計劃的秘密進行遭到了議員們的強烈反對，由於城市內太多涉及資本利益的東西還未能轉移，所以毀滅計劃停止。
雇傭兵進入Sanfer，開始大量屠殺感染者和未感染者，並將大公司財產轉移。
關於GT計劃，是“斯布雷帝”為了緊急應對產品研發係統出現故障導致的變異以及進化的措施，隻要出現兩種情況，立馬銷毀試驗品和實驗對象。但是在沒有限定適用對象和範圍的情況下，這個計劃對一切生效。
然而這一次他們估計錯了情況，第一批研製出來的病毒並不是侵蝕生理係統的病毒，它是接下來幾種變異病毒的吞噬體，即解藥。
隨著第一批感染者的出現，GT計劃開始執行，基本上清除了所有攜帶人員。等到他們意識到計劃實施是個錯誤的時候已經為時已晚，能做的也隻有停止研究。可事情並不會那樣發展。
變種病毒出現，並隨著意外事件泄露。這次大規模的感染出現的特征表現的征兆不明顯，以至於感染者在一星期內不會有任何異常，感染途徑是食物滲透。
尋找倫娜失敗後，克瑞斯和佩吉決定停止搜索，離開城市。
而就在他們離開後一星期，也就是雇傭兵進入公司轉移財產時，病毒第三次爆發，這次是由一個雇傭兵攜帶，隱藏了兩周之久。當時這名士兵並沒有被立馬殺死，病毒也被帶到了其他城市。
病毒的第三次變異使得特征更加不明顯，但一旦蔓延到患者全身，就會出現嗜血、狂暴、肌肉僵化、腦死亡等情況。
克瑞斯在撤離途中感染了第二病毒，由於他參加了初代病毒的研究，知道第一病毒就是吞噬體，於是決定回到Sanfer市取到解藥。
------倫娜·克裏夫斯特的兒子，作為初代病毒的實驗對象，已經被執行GT計劃。
病毒的爆發在末日前一年開始，持續了三個月。下一次爆發在一星期之後，直到末日來臨。