祭天大典的歡呼聲未歇，立國未穩的蕭梁王朝即發生一係列極端事件，從而讓蕭衍關於“朽索六馬”的譬如一語成讖。
其實，倒梁的勢力幾乎就在蕭衍宣布建國的當天就開始了他們的行動。祭天大典結束後的當夜二更時分，神武門、東掖門突然同時燃起衝天大火，趁著羽林軍救火的空隙，一批不明身份的騷亂者拿著武器一直朝蕭衍的寢宮撲來。羽林軍首領張弘策帶領一支軍隊阻擊著騷亂者的進攻，陳慶之、呂僧珍則帶著另一批人死死守在蕭衍的寢宮外。那邊的動靜越來越大，顯然，羽林軍的人數布置不足。混亂中，有人從背後朝張弘策刺了一刀，張弘策立即撲身倒地。騷亂者喊著口號，向這邊撲來。呂僧珍讓陳慶之一步不離皇上身邊，自己帶領幾十個羽林軍向那邊增援去了。
剛剛躺下的蕭衍一邊穿衣，一邊問：“發生什麼事了？”
陳慶之說：“好象有刺客。”
蕭衍推開窗戶看了看外麵的大火，問：“現在是什麼時候？”
“三更剛過。”
“你立即登上譙樓，敲響四更之鼓。”
陳慶之放心不下蕭衍，蕭衍說：“趁著夜深人靜時動手，刺客人數一定不是很多，等你把四更鼓敲響，他們自會退走。”
陳慶之明白了，交待十幾名羽林軍，讓他們以死護駕，自己轉身向譙樓跑去。蕭衍不顧羽林軍阻擋，來到前殿坐下，開始批閱奏折，就像什麼事也沒有發生一樣。這時，從譙樓果然傳來四更鼓聲，這鼓聲讓騷亂者產生錯覺，以為天就要亮了，於是便不敢戀戰。鼓聲以及神虎門大火也讓宮城外的領軍將軍王茂意識到宮裏出大事了，王茂帶著一隊人馬火速趕進宮來。不等天亮，騷亂即被平息，被俘的騷亂者竟有百人之眾。經連夜突審，騷亂者供出，他們是受蕭寶卷死黨孫文明指使，天黑前趁著為宮裏運送柴禾的機會夾帶武器混進宮來，又策動部分羽林軍，在深夜舉行暴動，意在刺殺蕭衍。
這場騷亂，蕭衍失去了他的親屬以及最好的軍師張弘策。神虎門事件給了蕭衍當頭一棒，蕭衍決定用鮮血來警告齊皇室成員。於是連夜下達了誅殺令。這次被圈入誅殺名單中的除了此前赦免的孫文明等人，還包括四名前皇室成員，他們是齊明帝六子蕭寶寅，九子蕭寶攸，十子蕭寶嵩，十一子蕭寶貞。
在誅殺這幾名前皇室成員的同時，蕭衍又下詔，特赦一批前皇室成員，其中有蕭鸞長子蕭寶興。蕭寶興因有殘疾，不僅逃過了誅殺，還被封巴陵郡（今湖南嶽陽）王。蕭衍並特許他有祭祀南齊王朝祖先的權力。蕭衍在最高法院大理寺的一份報告上又作出批示：“請大理寺盡早出台一份關於安撫舊朝遺屬及議定贖罪的條例，此條文可依照周、漢二代律條，凡身居官位而犯有鞭杖之罪者，可以出贖金而停止懲罰。中央各直屬機關（台、省），各州刺史的主要負責人，士兵如果犯有鞭杖罪，其願意用錢贖罪者，也可依此條例實施。”
趁此機會，蕭衍特別召見了蕭子恪、蕭子顯等十六位高、武時代的舊朝子弟，這十六人，都是才學過人者。在此前的組閣中，蕭子恪擔任零陵內史，而他的兄弟、年僅十三歲的蕭子顯因尚未達到任職年齡，武帝囑他好好讀書，將來報效朝廷一定會大有用處。蕭衍對所在舊朝的親屬說：“今天在座的，都同姓一個蕭字，雖然出了五服，但卻是同宗同族的兄弟。想當年朕的父親曾為輔佐你們父輩而出生入死，因此，我們也算得上是同甘共苦的一家人。當初明帝當政，高帝十九個兒子、武帝二十三個兒子全部被殺。