李鴻章旋向士迪佛立提出交涉，常勝軍應由中國人會同管帶。士迪佛立初不願意，雙方反複爭辯，乃至舌敝唇焦，最後簽訂了“統帶常勝軍協議十六條”。規定常勝軍暫以奧倫為管帶，李恒嵩會同管帶；裁至三千人，削減雜項開支及長夫額數；不得私購軍火；懲辦士兵由中方做主；鬆江地方事務外國人不得幹涉；將來征得英國政府同意後，改由戈登統帶。
這是李鴻章第一次與外國進行交涉，簽訂中外協議。梁啟超稱讚：“其決斷強硬之慨，論者韙之。”④
常勝軍接到裁汰命令後，一度鼓噪，一些洋兵竟把城牆上的大炮推下，摔成幾截。李鴻章不為所動，最終洋兵也不得不服從。長官把常勝軍士兵集合起來，傳令：“今後如遇缺餉受枉等事，隻準牌中頭目稟，不準囉唕，故違中國官長將令。如服者各脫帽響喊三聲。”軍中喊聲雷動，皆表服從。常勝軍從此每天繼續正常操練，事態得到平息。
①李鴻章《上曾相》。《李鴻章全集》（五），時代文藝出版社，1998年。
②《李鴻章書信》。《吳煦檔案中的太平天囯史料選輯》，三聯書店，1958年。
③李鴻章《白齊文滋事撤換片》。《李鴻章全集》（一），時代文藝出版社，1998年。
④梁啟超《李鴻章傳》，中華書局，2012年。
朝廷接到李鴻章的“整飭常勝軍片”後，十二月二十四日，嚴令緝拿白齊文歸案，諭曰：“白齊文以劫餉毆官之犯，自應按中國軍法懲辦，現經英國提督士迪佛立押解來滬，由英國兵船看管，並未交出。並藉口華爾、白齊文先後托買軍火賬未清算，請由中國派員會算，顯係藉詞拖延，希圖寢事，情殊狡展。已諭總理各國事務衙門照會駐京公使，妥為剖辯，仍著李鴻章飭將白齊文迅速交出，毋得任令含糊了事，將此由六百裏各諭令知之。”①
同治二年（1863）正月，白齊文偷偷跑到北京，找英、美兩國公使，尋求庇護。英、美公使竟聯合向總理衙門提出讓白齊文複職。英國公使讚美白齊文“勇敢、誠實、態度溫和，並且真誠地願為中國政府服務”，美國公使則說，“我們必須承認白齊文將軍是不應受到責備的”，因為他沒有前科、作戰英勇。②
在英、美公使的壓力下，恭親王隻好把案子發還江蘇，重新處理。二月十五日上諭：“白齊文劫餉毆官，不遵調遣，律以中國軍法，其罪萬無可逭。而英、美公使在京饒舌，若遽允其所請，則封疆大吏無複操縱之權，自應照總理衙門所議，由李鴻章酌量辦理。現在白齊文赴滬，該撫即欲稍寬其罪，必當使所犯各節一一認伏，然後量為施恩，則白齊文既感該撫之恩，又感不殺之惠，且遇有交涉事件，中國官員或偶傷犯外國人，各國饒舌，亦可援此案以自解。”③
這個上諭與前一份上諭，態度完全不同。李鴻章極為失望。三月四日，白齊文從北京返回上海，竟然大模廝樣見李鴻章，要求複職。李鴻章自認為打痞子腔有一套，沒想到遇上個比他還痞的，不禁勃然大怒，喚人把白齊文轟出門去。
三月十日，李鴻章給曾國藩寫信，壓抑不住滿肚怨氣：“接總理衙門來函，商令白齊文複帶常勝軍，雖英美公使代為力保，中國豈毫無法度。白齊文自京回滬，竟然得意，求鴻章即委管帶，已嚴拒之，並詳複恭邸矣。朝廷紀綱須共存，乃如此模棱畏事，是非何由得明，令人灰心。”④李鴻章憂慮，朝廷懾於洋人淫威，朝令夕改，連一個小小的管帶都不敢處理，將來如何與世界各國辦交涉。
經李鴻章堅持，英國公使同意由戈登接管常勝軍，戈登也於二月七日在鬆江正式履任。由此可見，在白齊文事件上，英國的立場，也頗為微妙，英國始終希望在常勝軍中安排一名英國管帶，白齊文劫餉毆官，給了他們一個機會。因此，他們盡管一方麵與美國聯手向中國交涉，另一方麵，已急急忙忙派戈登到常勝軍，堵住白齊文複職之路了。
①③《清實錄》（同治朝實錄）。
②［美］馬士（H.B.Morse）《中華帝國對外關係史》（二），商務印書館，1963年。
④李鴻章《上曾相》。《李鴻章全集》（五），時代文藝出版社，1998年。
李鴻章便以此為理由，不奉朝命，迅速把常勝軍的欠餉全部付清，化解了常勝軍嘩變的危機，使戈登順利接任。
白齊文事件的背後，其實糾纏著中國與外國、英國與美國、李鴻章與吳煦等人錯綜複雜的關係。
這個一時震驚中外的事件，還有一些餘緒。遭到李鴻章拒絕之後，白齊文惱羞成怒，搶了一條輪船，開到蘇州，向慕王譚紹光輸誠，加入太平軍。他的這一舉動，令英、美啞口無言。李鴻章震怒不已，發出通告，如將白齊文拿獲歸案，不拘生死，賞銀三千兩。