在一個風雨交加的夜晚，一個青年正在電腦上玩最新出版的口袋妖怪典藏大合集，玩著玩著，電腦忽然短線，那青年一看－－原來是他媽媽把電線拔了，並叮囑好讓他睡覺，看著他走到床上漸漸睡下後便走了，令人想不到的是，他還沒睡，在他媽媽麵前隻是假睡而已。
他碾起腳，輕輕走到電腦前，打開電腦，正當他想和火箭隊對戰的時候，天空中，一道雷電襲來，他還沒反映過來便被電倒，但他還是沒打消玩口袋妖怪的念頭，努力站了起來，但是電腦周圍還是有電，使他再次被電倒，連續幾次後，終於死了，創世神阿尓宙斯看他盡然為了口袋妖怪寧願犧牲自己，於是把他帶到了一個自己的空間，那青年還是暈在那，隻能等他醒來了，由於從現實世界到了神奇寶貝世界，而在神奇寶貝世界，不管怎樣電，都不會死亡，頂多也就是暈了。
過了幾個小時後，那青年醒來了，創世神阿爾宙斯說：“這位人類啊，因為你的執著－－－－到神奇寶貝世界，所以這次讓你贏得了穿越到神奇寶貝世界的機會，你想要去嗎？”這位青年回答到：“是的，我要去，請務必讓我去。”那青年覺得眼前一黑，暈暈乎乎的，過了許久，他睜開眼睛，看見周圍至少有500多個人圍者他，看見他醒過來，一個個不由得大哭。
一個像管家的人哭泣著說：“少爺醒過來了，少爺醒過來了。”那一群人都在歡呼。那青年小心翼翼得問：“請問，我這是在哪裏？”“少爺雖然醒過來，但卻失憶了，事情的經過是這樣的，你叫佐佐木小次郎，你隻前和卡蒂狗玩不小心摔到了，昏迷不醒，現在終於醒了。那位青年就把自己當成了小次郎，點頭表示理解。雖然他覺得小次郎是壞的，但是聯想到了自己，自己也的確不算好，他控製著小次郎，爬了起來，並對著那群人大聲說了一句話：“我要去旅行”一個人喝聲道：“不行，都什麼年齡了，還要去旅行，我還給你準備了未婚妻呢!”
鏡頭轉向真新鎮，“我出發啦！”“小智，路上小心。”很明顯的，散發主角光環的小智還是像原來一樣遲到了。
他匆匆忙忙的跑到了大木研究所，小茂已經跟跟他告別的人告別了。
小智氣喘薰薰的停在了大木研究所，小茂用他高傲的語氣說：“呦!這才第一天你就已經輸給了我”小智懶得跟他較勁。就沒搭理他。走進了研究所，小智擾擾頭說：“大木博士，我的神奇寶貝呢!”“哦，你遲到了，我這的神奇寶貝都被拿走了”“真的沒有其他方法了嗎?那我怎麼旅遊啊”“有是有，不過那隻神奇寶貝很掘啊”“沒事，有就可以了”於是大木博士就把那個精靈球給了小智拿到精靈球後放出了寵物，是一隻皮卡丘，小智－－－－已經不再是我們認識的那個小智，他，不再帶著他的神奇寶貝標誌性的帽子，也不再穿他那身藍色的衣服，而是穿一身黑色的衣服和黑色的褲子，給人一種帥氣的感覺。不帶他的帽子，給人一種成熟感、、他放出了皮卡丘，皮卡丘一出來就使用了電擊，不過小智敏捷的一跳，避開了。皮卡丘吃驚的望著眼前這個人，小智說：“皮卡丘，多多相照哦”說著就要把皮卡丘收回神奇寶貝球裏麵，皮卡丘自然不願意。對著小智使用了電擊，小智隻好收回神奇寶貝球，“哦，皮卡丘，你不喜歡進神奇寶貝球裏啊!那就別進好了。大木博士，我們告辭了。”小智告別了大木博士，來到門口，小智的媽媽拿給他一堆東西，都是旅行用了，小智什麼都不拿，在一個風雨交加的夜晚，一個青年正在電腦上玩最新出版的口袋妖怪典藏大合集，玩著玩著，電腦忽然短線，那青年一看－－原來是他媽媽把電線拔了，並叮囑好讓他睡覺，看著他走到床上漸漸睡下後便走了，令人想不到的是，他還沒睡，在他媽媽麵前隻是假睡而已。