恩赫巴亞爾是一位學者總統，他在文學、曆史、佛學等領域都頗有造詣。他1980年畢業於莫斯科高爾基文學院，是個俄羅斯通。此後他還曾到英格蘭北部的利茲大學就讀，深受西方文化的熏陶。他曾將蒙古的傳統史詩翻譯成英文、並將英國作家狄更斯和其他西方作家的作品翻譯成蒙文。和絕大多數蒙古人一樣，恩赫巴亞爾篤信藏傳佛教，他參加總統競選時，首先就是去蒙古最大的寺廟甘丹寺祈福，他曾經翻譯過佛經，他的7本佛學理論書籍已經出版。
值得一提的還有他的語言天分。他同俄羅斯人交流從不用翻譯，包括他同俄羅斯領導人的會談，也是自己用俄語直接交談。在出訪英語國家時，他也不帶英文翻譯，而是自己直接用英語交流。
生活中的恩赫巴亞爾又是另一番模樣，一次他和很多媒體記者一同下鄉，互相打賭講笑話，竟把自己多年簽字用的銀製鋼筆輸了出去。
恩赫巴亞爾喜歡運動，興趣廣泛，國際象棋、自行車、乒乓球、排球、足球、籃球等樣樣在行。在運動場上，若沒有人指點，你不會發現這位略微發福的運動健將就是蒙古政壇的風雲人物。蒙古政府定期與外國使團組織係列文體比賽，恩赫巴亞爾每次都踴躍參加。有一次，蒙古政府部門與駐蒙外交使團進行足球友誼賽，時任總理的恩赫巴亞爾在場上生龍活虎，被衝撞跌倒後馬上爬起來繼續衝搶；最後，蒙古政府隊憑借恩赫巴亞爾一記漂亮的頭球取得了勝利。
恩赫巴亞爾有一個幸福美滿的家庭，妻子朝勒蒙·鄂嫩知識淵博且有親和力，目前是蒙古兒童基金會會長，他們育有4個孩子。