看著那麼大一麵牆要刷，湯姆滿心的歡樂沒有了，而此時，許多孩子陸續過來嘲笑他，看他的熱鬧。這時，他想到了一個好主意：把刷牆當做非常光榮的、神聖的工作，無論誰過來他都不理，仍然全神貫注地刷牆。這引起了許多孩子的好奇心，他們希望湯姆能讓自己刷，而湯姆故意吊他們的胃口，最後，孩子們都拿自己的寶貝來換這件“光榮”的工作。就這樣，湯姆不僅幹完了活，還賺了不少東西。
下午，湯姆出去玩時發現了一個可愛的小女孩，他一下子就愛上她了。
星期天，是主教學校上課的時候。在路上，湯姆用那天刷牆賺來的寶貝與小朋友換了藍、紅、黃條兒(每張條兒都是背《聖經》的憑據，十張黃條兒便可換一部《聖經》)。
而恰巧今天有一位嘉賓——薩契爾大法官(湯姆意中人的父親)，因此，校長想找出某個同學能換取他手中的《聖經》，這可是一個不小的榮譽。他在學生中轉了一圈又一圈，他逐漸失望了。而此時湯姆卻挺身而出(為了博取意中人的歡心)，校長介紹湯姆同大法官認識，湯姆一看到他便有些緊張，因為他是湯姆意中人的父親。大法官要他背誦幾段，湯姆卻支支吾吾答不上來。
星期一上學的時候，湯姆發現他的意中人就是他的同學，叫貝奇·薩契爾。於是湯姆便千方百計與她套近乎，並最終煞有其事地與她訂了婚。然後卻由於湯姆說自己還有另外一名女友，讓貝奇很是吃醋，於是二人吵了一架，貝奇便不再理湯姆，湯姆無奈之下便與朋友喬埃·哈波在樹林裏玩起了綠林好漢的遊戲。
晚上，湯姆一直沒睡，等到11點鍾，他便溜了出去，因為白天他和哈克貝利·費恩有個約定，他們約定到一個老式的墳場，用魔法去掉手上的瘊子。費恩是一個遊手好閑、無法無天、又沒有教養的孩子。
他們到墳場後，卻無意中發現老莫夫·波特、殺人魔王印江·喬埃和年輕的魯賓遜醫生在盜墓，結果不知因何三人打了起來，結果醫生把波特打昏了，喬埃卻用波特的刀子把醫生給捅死了，然後又把刀子放在波特手裏，並把波特叫醒說人是波特殺的，波特頓時嚇得酒醒了，請求喬埃別說出去。這一切把兩個孩子嚇壞了，他們怕喬埃報複，因此約定誰也不能將此事說出去，並寫下了血書。
接下來的幾天，貝奇故意與別的男孩玩，讓湯姆吃醋，這一切令湯姆著實非常傷心。恰巧這時他的朋友哈波因被母親冤枉很不開心，於是兩個同病相憐的家夥走到了一塊。他們決定離開這個令人苦惱的村子去當海盜，於是他們找到了費恩。三人約定半夜到河邊聚會。
半夜到了，三人每人帶了一些吃的會合了。於是，他們駕著河邊的木排向荒蕪的傑克遜島駛去。
在島上他們無拘無束，離開了大人的束縛，想怎麼著就怎麼著。他們釣魚、遊泳、玩耍，餓了就吃東西，困了就露天睡在沙灘上，玩得好不開心。
快樂地過了幾天，他們發現村子裏一些人駕著船在河上搜索著什麼東西。他們揣測著這些人在找他們，他們更加興奮了，為自己的逃跑而興奮不已，覺得自己成了村裏人心中的英雄。
到了晚上，等到費恩和哈波睡著之後，湯姆向對岸遊去，他決定回家看一下。
透過窗戶，湯姆發現姨母、席德還有哈波的母親正在談論著湯姆和哈波的好處，後悔當初沒有善待他們。她們商量著三天後在教堂裏舉行喪禮。最後，這兩個遭受喪子之痛的女人互相擁抱著，痛痛快快地大哭了一場，然後就分手了。分手之後，波莉阿姨跪下來為湯姆祈禱，把湯姆感動得淚流滿麵，但他還是沒有現身去見阿姨。
等阿姨睡著後，湯姆又向小島出發。回到小島後，湯姆向另外兩人說，三天後村裏將為他們舉行喪禮。於是，三個人想出了一個絕妙的計劃：等到舉行喪禮時，突然出現在教堂，給他們一個驚喜。
在三天後舉行喪禮時，正當人們都在哭泣時，門嘎的一聲打開了，三個孩子出現在眾人麵前，頓時教堂裏歡呼起來，他們成為眾人歡迎的對象。
經過了這件事以後，學校裏的孩子們都把湯姆和哈波看得很了不起，大家都以與他們在一起而自豪。而此時，貝奇想和湯姆和好，但湯姆卻故意擺起了架子，等到他想主動與貝奇和好時，貝奇卻又生他的氣，叫他別再纏她了，頓時湯姆目瞪口呆。
有一天中午，貝奇無意中把校長的書撕開了一半，恰巧被湯姆看見了，貝奇又急又惱，把湯姆給罵了一頓。下課之後，校長發現他的書被撕了，就怒氣衝衝地質問學生們。眼看著貝奇就要露餡了，湯姆心一橫，承認是自己做的。湯姆遭到了校長的懲罰，但他毫不在乎，因為貝奇已經感激他了，從她的眼神中便能看出這一點。
從那以後，貝奇和湯姆就和好了。但是湯姆並沒因此而開心，因為他聽說波特將要受到審判，要是不揭穿喬埃的話，波特就死定了。
審判那天到了，眼看所有證據都對波特不利，波特也陷入了痛苦之中。這時湯姆心一狠站了出來，揭發了喬埃，但喬埃卻從窗口逃了出去，眾人沒能捉到他，但卻因此而救了老波特一命。
湯姆又一次成了一位金光閃閃的英雄——為年長的人們所寵愛、年輕的人所羨慕的人物，他的名字甚至得到了不朽的流傳，因為鎮上的報紙把他大大宣揚了一番。甚至有些人相信他將來有一天還能做總統。
然而湯姆雖然在白天過著風頭十足、歡天喜地的日子，可是一到夜裏他就陷入恐怖之中。喬埃老是闖進他所有的夢裏，而且眼睛裏老是有一股殺人的凶氣。天黑以後，他也不敢再出去玩。
這樣提心吊膽地過了一段日子，他的恐懼便逐漸消失了。隨即湯姆又萌生了冒險的念頭，於是他又找來費恩、哈波，商量著尋找寶藏。
於是他們找到了一把十字鎬和一把大鐵鍬便出發了。在途中，他們想到那個鬧鬼的屋子，但卻沒敢去。
第二天，湯姆和費恩來到那鬧鬼的屋子，正在他們尋找時，有兩個人衝著這間屋子來了，嚇得他們趕快爬到樓上，趴在樓板上一動也不敢動。
從縫隙裏他們認出其中一個是近來在鎮上露過一兩次麵的西班牙老頭，另外一個是殺人犯喬埃。喬埃身上有一些錢，他想把它埋在這兒，就用他的獵刀在一個角落裏挖，無意中卻挖出一個裝滿金幣的箱子。於是，為了安全起見，他們決定把箱子帶走。
等他們二人走後，湯姆和費恩決定跟蹤他們。但隨後第二天，貝奇一家從外地回來，湯姆便把跟蹤一事拋在腦後了，於是艱巨的任務便壓在費恩肩上。在跟蹤途中，費恩聽到喬埃要殺山上的道格拉斯寡婦，因其丈夫生前對喬埃不好。費恩趕緊告訴了道格拉斯寡婦的鄰居，她也因此逃過一劫。
而此時的湯姆和貝奇及同學們正在野餐，其後他們進山腰的一個山洞中去玩，湯姆和貝奇兩個人一直往裏走，不知不覺中兩人迷了路，怎麼轉也出不來了。而且吃的東西也沒了，正當又餓又困的時候，他們聽到了一些聲音，他們以為是同學，湯姆便大叫起來，結果，那人一聽有人扭頭便跑。原來那人不是旁人，正是殺人犯喬埃，他還以為是抓他的人來了呢，連箱子都沒拿，便一溜煙地跑了。
就這樣，湯姆和貝奇一直往前走。最後，貝奇實在走不動了，於是湯姆一個人往前走，手裏拿著蠟燭。最終，燭光在黑夜中的閃亮引起了一些人的注意，他們按燭光方向救出了湯姆和貝奇，此時的他們已昏迷不醒了。
湯姆和貝奇醒了以後，向薩契爾說殺人犯就在洞中，於是眾人前往山洞，薩契爾法官已下令把山洞封了起來。等打開山洞之後，人們發現喬埃已經孤寂地死去了。
這件事了結之後，費恩和湯姆便去找寶藏，湯姆想起箱子可能還在洞裏，於是便一齊到山洞裏去找。最終他們找到了那個箱子，並把它藏在道格拉斯寡婦家的柴棚的閣樓上。
由於費恩陰差陽錯地救了道格拉斯寡婦，寡婦向眾人說她準備收養費恩，並說準備讓他受教育，並且說等她出得起一筆錢的時候，就要讓他去做一個小規模的買賣。
這時，湯姆把兩隻挺重的口袋裏的金幣倒在桌子上說：“這些錢一半是費恩的，一半是我的，費恩已經不缺錢了。”
道格拉斯寡婦把費恩的錢拿出去照六分收債，薩契爾法官也接受了波莉阿姨的委托，把湯姆的錢照樣處理。
薩契爾法官希望湯姆將來成為一個大律師或著名的軍人；而費恩既有了錢，又得到道格拉斯寡婦的保護，生活得也非常幸福。