離開神奇寶貝學院的小琦一行人，正向下一個道館的所在地枯葉市前進，今天，他們來到了正輝燈塔所在的海邊……
“終於要到巨大快龍的劇情了啊！怎麼樣手癢了嗎？”在海灘上，小琦突然用心靈感應問阿毅，阿毅先是吃了一驚，沒想到小琦會心靈感應，然後就笑了，應該是覺得以後事情可能會變得越來越有趣了而感到欣喜吧。
終於，小琦一行人來到了正輝燈塔，一看，根本就不覺得正輝博士會住在這裏，按道理來說，博士應該都住在研究所裏，就像大木博士一樣，但正輝博士這個跟大木博士齊名的博士就是住在這裏，隻能說“林子大了，什麼鳥都有！”。
“請問正輝博士在嗎？”小琦直接敲著門問道。
阿彬看門沒關，就直接闖了進去，小琦頓時有阿彬還是個冒失鬼的感覺。
“是誰擅自進來了！”一個很響的聲音說道。
“我是華藍市的阿彬，他們分別是真新鎮的小琦，真新鎮的小雪，常磐市的小露，常磐市的阿雅，若葉鎮的小燦，若葉鎮的小紫，煙墨市的阿毅，煙墨市的欣兒，我們是特地來找正輝博士的。”阿彬回答道，“因為門沒關我們就自己進來了。”小琦倒是覺得阿彬還真有心情，連每個人所住的城鎮都說出來了。
“哦，是這樣啊。我就是正輝。”那個聲音說道。燈開了，一隻巨大的化石盔坐在椅子上。“對了，我給你一百塊錢，你過來幫我一下，幫我按一下我右手下麵的按鈕吧。”那隻巨大的化石盔說道。阿彬走上前去，按了下那按鈕，化石盔的衣服就散開了，從裏麵出來個綠頭發的青年。“來這是你的報酬！”正輝博士說道。“正輝博士，我倒貼你五百塊錢，你能不能演示給我們看，你是怎麼把自己鎖在裏麵的。”阿彬掏出五百塊錢說道。對麵，正輝博士頓時無語了……
“算了，算了，阿彬，你就別為難正輝博士了。”小琦過來“勤王救駕”了。“多謝了，對了，你來找我有事嗎事嗎？”正輝說道。“我們聽說這裏有位和大木博士齊名的研究者所以就過來拜訪一下，由於天色不早了所以先借住一晚。”小琦答道。
“哦，是這樣啊，可以啊，對了，你們是旅行者吧，那你們一定會做飯，你們誰做飯技術好點幫我做一下晚飯吧。”正輝博士說道。“這個我在行，就包在我身上了。”阿雅說道。現在，小琦知道為什麼阿雅是他們一行人中除了小露之外最弱的了——原來還分出心來學習一些飼育家的知識啊。
吃完晚飯，小琦他們和正輝來到了燈塔頂上，正輝正在講他所在等的那隻神奇寶貝，接著一個叫聲從霧的對麵傳了過來。正輝相當的激動，馬上出了回應的聲音。由於小智不在，自然也沒有火箭隊礙事。巨大的身影來到了小琦一行人麵前。
“快龍，你好，我叫小琦，是在你麵前的燈塔旁邊的一行人之一，你是不是尋找自己的同伴呢？”這時，在巨大快龍心中響起了一個聲音，快龍馬上大叫了起來，聲音又在巨大快龍的心中響起，“好了，如果你想和我交談的話，就在心中說吧，我聽的懂得。哦，是這樣啊，但其實你並不是沒有同伴啊，隻不過你的體型大了點，快龍的話我也有，如果你願意的話，我就駕著快龍去你那裏吧！”
“出來吧，快龍，對不起要你當一下坐騎了。飛到那個巨大快龍那吧！”小琦放出了快龍，騎著快龍就飛向了巨大快龍那。
“誒，小琦怎麼就騎著快龍飛過去啦？”
“應該是小琦用心靈感應跟快龍說了什麼吧！”還好有小雪這個小琦的知音在，不然眾人又要胡思亂想半天了。
“嗨，這就是我的快龍，也是我最重要的夥伴之一！”小琦到了巨大快龍的麵前，在遠處看一點都沒有在近處看來的那麼大，小琦也是讚歎半天啊……
“看了我的快龍，就相信你有同伴的了吧，怎麼樣跟我一起走吧！”小琦直接提出了自己的目的。快龍這次沒有說話，沉默了一會兒，又看了看小琦的快龍，最終是答應了，小琦就飛回去向正輝博士要了一個超重球，小琦知道像正輝博士這樣有名氣的博士肯定是有超重球的，正輝博士意外的爽氣將一個超重球扔給小琦，又將一個大師球扔給了小琦，說是禮物。小琦就會覺得快龍那收服了快龍，沒有戰鬥，沒有掙紮，到底快龍是很溫順的神奇寶貝。
“那個……嘿嘿！”小琦回來之後，正輝博士就一直在對著小琦在笑，笑得小琦心慌，“是不是想研究一下我的巨大快龍啊！”小琦似乎看出了正輝博士的想法，正輝博士點了點頭，小琦也正好借這次機會好好“敲詐”一下……
“可以啊，不過……”小琦說著，頓了頓，“不過什麼？”正輝博士似乎也是察覺到了危險來臨。