晉商的商務活動多通過商號、票號進行。通常一個晉商家族所立“號”下設有多處分號或分支機構，少則十來家，多則數十家，廣泛分布於全國各地甚至海外。對於一個店鋪叢生、經營種類繁多的龐大企業，要使之運行有序、高效，整體實力不斷增強，沒有一套成熟可行的經營管理模式是難以想像的。大量史料表明，晉商確有許多巧妙的經營藝術。
1組織管理上權力集中，統而不死
從現代企業管理上講，一個企業的高效運行，首先需要設計一個合理的組織結構。即在勞動合理分工的基礎上，設計出組織所需的管理職務和各個管理職位之間的關係，並以相應的機構為載體，使各項管理職能發揮應有的效用。經過這樣的製度安排，一個擁有數百、上千甚至上萬人的大型企業才可能較為順利地運轉開來。從這個意義上講，企業的組織管理是搞好其他管理工作的前提條件，沒有合理的組織安排，企業的人事、營銷、財務等的管理也往往難以盡如人意。
對於晉商而言，一個家族的商號或票號規模大多可達百人以上，其資本遍布全國各大商埠和城鎮，而這些商號、票號製約互利，通過資源整合，使整個家族企業形成一個有條不紊的管理係統，成功實現了各自的集團化經營。當然，以現代企業管理理論來看，晉商家族企業所采取的正是一種高度集中製的組織管理模式。
財東擁有所有權，一般不直接參與經營管理，而是委托總經理，授之以資金運用權、職員調配權、業務經營權，以充分發揮其才幹，即所謂的所有權與經營權分離。總經理坐鎮總號，除管理總號內部各項事務外，就是對各地分號進行大的調控。晉商商號、票號總號實為企業的權力中心，凡經總號集體研究，由總經理最後定奪的經營決策、業務方針、存放彙兌等各種規章以及人事管理製度，上至經理（包括分號老板），下至一般夥友，必須不折不扣地遵行，不準有絲毫違背。否則，即以違犯號規論處。
分號經理（掌櫃）擁有所在商號的業務開拓權、資金運用權和人員管理權，但機構設置、資金調度、人事任免和贏利分配等重大權限均由總號控製。分號實際上是總號根據經營種類或區域範圍下設的從屬部門，雖然年終或賬期也須向總經理及財東彙報經營績效，但衡量標準不僅僅是看其贏利多寡，更重要的是該分號對總號實力增強做出多大貢獻。
無論總號與分號，其內部人員設置的原則都是“因事設人”，絕不“因人設職”。每個商號一般從業人員在10人左右，其中大掌櫃（經理）是決策人物，二掌櫃處理日常事務，負責對外聯絡、安排日飯譜，三掌櫃（櫃頭）總管櫃台業務，內事先生（管賬先生）監管文書、出納及金銀首飾等貴重物品的保管，櫃員2~4人，經辦具體業務事項；學徒2人，協助櫃員打雜。
比如，祁縣複恒當設置人員的標準是“緊七慢八”。就是說7個人緊一點，8個人就比較寬鬆。所以夥友一般為7~8人，絕不超編。精幹的機構設置大大提高了商號辦事效率，減少了管理費用，同時又增強了雇員的責任心，充分調動了他們的積極性，從而為商號、票號的穩定、發展和繁榮提供了可靠的組織保證。
2製度管理上嚴格號規，令行禁止
晉商之所以長盛不衰數百年，一個十分重要的原因是製訂並切實實行了嚴密而完善的號規。晉商有諺稱：“國有國法，家有家規，鋪有鋪規。”號規無疑是商號的根本大法，其製訂得是否完善，是否切合實際，是否對發展有利，無疑與商號的命運息息相關。
大德通的號規上有這樣的話：“凡事之首要，箴規為先。始不箴規，後頭難齊。”作為統轄商號全局的法規，必須對商號的性質、人事、業務及福利待遇等重大事宜做出原則性的規範，使號內任何人都必須在號規的規定範圍內活動。如果能夠切實遵守明文規定可得到獎賞。如果觸犯，也應視其程度，作出相應的處罰。晉商號規極嚴，無論經理、夥計、學徒，均須遵守。從而使商號上下努力任事，團結一致，勤奮進取，充滿活力。
晉商在號規方麵創立了許多行之有效的管理製度，諸如經理負責製、學徒製、休假製、賬簿製、保密製等。晉商號規內容之全麵，條款之嚴密，實施之切實，是現代不少企業難以做到的。尤其是令行禁止，人人遵守，更值得現代企業管理借鑒。
經理負責製主要是實行量才錄用、規範管理的嚴格製度。用請掌櫃、寫合約、定人股來規範財東和掌櫃雙方的權益和行為。經理（大掌櫃）一經聘用，財東則委以全權，不幹預號事，靜候年終決算報告，真正做到了用人不疑，疑人不用。經理則做到了受人之托，忠人之事，以忠義來答報知遇之恩。經理在任期內業務突出有成績者，則加股（人身股）加薪獎勵。