燕子門創立於元末明初，開山鼻祖姓張名漢。張漢原名張思聰，隻因蒙元殘暴，民不聊生，張思聰立誌逐胡虜於漠北，恢複漢家河山，遂改名張漢！張漢年少時常與山中巨猿嬉戲，練的身輕如燕。後於一山洞之中偶得一本絕世奇書，學的滿身本領。
此奇書上半本乃是兵法，教人行軍打仗，戰無不勝；下半本是一些呼吸吐納的法門，教人強身健體，百病不生。書的最後幾頁寫著一些怪字，並附有一張地圖，圖中線條縱橫交錯，讓人摸不著頭腦。
張漢得書後，勤修苦練，學成後出山輔佐明太祖朱元璋，做了朱元璋的親軍統領。憑著一身驚人的藝業，攻伐數年，終於成就大業。其時徐達、常遇春等武將常與張漢研討兵法，從中受益匪淺。更兼鄱陽湖大戰，陳友諒乘船敗退之時，張漢腳踩湖中碎木板，三起三落，一箭射殺陳友諒，立下不世奇功，博得一個“燕子王”的美名！
有道是鳥盡弓藏，明太祖朱元璋開國後大殺功臣，勳貴重臣幾乎無一幸免。但懾於張漢的武功名望，始終不敢對其下手。張漢自知朱元璋不是可以共富貴之人，便自請辭官歸隱故裏，更請朱元璋抹去史書對其一切記載。朱元璋假意挽留未果，又殺其不成，隻得應張漢之請，任歸故裏。是以張漢立下如此大功，史書卻無一字提及！
張漢歸隱故裏，創立燕子門，傳藝授道，倒也逍遙快活。某日張漢遠遊歸來，發現家中遭竊，那本絕世奇書從此下落不明。此書張漢雖早已另錄副本，但原書最後幾頁卻未曾臨摹，此後數十年張漢遍尋不著，隱為心中大恨，臨終立下遺言，後世門人務須尋得此書，在其墓前三米處，挖地三丈焚化！
其時門人心中奇怪，何以要挖地三丈？但也並未深究。曆代掌門皆以尋找此書為己任，奈何天下之大，於廣袤之地尋此奇書，實是難上加難。燕子門流傳至今，也未找到！
期間世事多變，張漢所傳戰陣打仗之法，幾近失傳，曆代掌門也僅知皮毛而已。但縱是皮毛，也夠威服天下！明英宗土木堡之變，燕子門正值興盛之時，時任掌門葉秋山，帶領三百門人，力助兵部尚書於謙打響了北京保衛戰。於謙率師二十萬，於北京城下大破瓦刺。此戰過後，大明得以延續兩百年的國運，葉秋山實居首功！
燕子門傳至明末，已然式微，門下徒眾寥寥無幾，僅剩武功要訣尚未失傳。天啟年間，後金大汗努爾哈赤揮師攻寧遠，時任掌門劉禹陽謹記張漢祖師匡扶漢室之遺訓，趕赴寧遠，力助袁崇煥重挫後金軍，更親臨城頭開炮殺敵，努爾哈赤此役受傷，半載後不治而亡。