話說竇建德兵敗被俘，最後被李淵下令殺死。其部下則是四處逃散。而唐朝的官員對這些曾經是大唐敵人的人，並沒有好好的安撫他們，使他們真心歸附大唐，反而處處為難他們，搞得他們不能過正常認得生活，有的則是隱姓埋名，但還是無法逃脫這些官員監管。這些人被逼無奈，逃逸到漳南老家的劉黑闥聯合範願、董康買、曹湛、高雅賢等竇建德部將在漳南舉兵反唐。劉黑闥在漳南縣設壇祭奠竇建德，自稱大將軍。徐圓朗在充州響應劉黑闥，山東再亂。劉黑闥在起兵的之時，一方麵利用唐朝官吏對待竇建德舊將的錯誤政策，四處聯絡，發動竇建德舊將以及其他降唐者反唐；一方麵派遣使者聯絡突厥，引誘突厥南下，威脅關中，給唐朝以軍事壓力；最後為了避免與唐朝主力發生交戰，他采用靈活激動的戰術，尋找機會消滅唐軍的有生力量。
劉黑闥叛亂，突厥出兵襄助，消息像雪片一般飛到長安，李淵急召李建成和李世民商議，最後決定有秦王領兵前往平叛，由太子領兵鎮守北邊，防備突厥。
武德五年（公元622年）正月，劉黑闥攻占相州，自稱“漢東王”，改元為“天造”，以洺州位都城。二月，頡利可汗出兵數萬，勾結竇建德舊將劉黑闥攻擊李大恩，李大恩戰死，全軍覆沒。三月，李世民率軍進入河南，開始與劉黑闥作戰。雙方對峙於洺水兩岸。五月，李世民破竇建德舊部劉黑闥，黑闥奔突厥，山東悉平。就在秦王回朝沒有多久，武德五年六月，劉黑闥從突厥借兵，再次攻入河北，並擊敗史萬寶等唐將，河北諸州再次叛唐。頡利又與劉黑闥聯合，以數萬騎圍攻汾州，又遣數千騎圍攻靈、原等州，掠男女五千餘人。十一、十二月，李建成采納魏徵的建議，主動請纓率軍討伐劉黑闥。武德六年（公元623年）正月，劉黑闥的屬下、饒州刺史葛德威擒獲劉黑闥並投降李建成。李建成斬殺劉黑闥於洺州，河北一帶徹底平定。
同年九月，突厥進逼高祖因突厥進逼，欲遷都，以秦王李世民急諫而止。李淵和李建成、李世民、李元吉一起到城南打獵。李建成誣陷李世民。八月，世民引軍禦突厥於幽州，施離間之計，使頡利、突利生隙，突厥撤兵請和親，世民許之，與之盟而罷。
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秦王以計退了突厥，高祖十分歡喜，大擺宴席以示慶賀，太子看在眼裏卻是急在心裏。這日，東宮的後花園內，李建成獨自一人站在園中，貼身衛士楊文幹急急忙忙的跑了過來，李建成看到他過來了，便問道：“事情辦得怎麼樣了？現在一共召了多少人啊？”
楊文幹來到李建成身邊，聽到他在問自己，急忙說道：“回殿下，現已將近二千人，人數不算少，但戰鬥力不高，若能夠從邊關調一些武藝高強的驍勇的、、、、、、”楊文幹的後半句話的聲音越說越小，顯然是處於安全的考慮，李建成很明白，一輝手說：“走，咱們到偏殿去說。”