第二天大早，九江城外秩序較為混亂，三個匪徒趁騷亂衝進大碼頭的協順土店，搶了幾千銅圓和銀元後奪路狂奔，被聞訊追趕的革命軍抓獲並就地正法。此時，人們才發現，九江城隨處可見湖北軍政府都督黎元洪的文告，並豎起三麵起義大旗，城內警察紛紛響應，都在左臂纏上白布。數千年的帝王專製體製在九江滅亡。
九江獨立後，革命軍將九江道署改為軍政分府，眾人推馬毓寶為中華民國駐潯軍政分府都督。兩天後，李烈鈞趕到九江，被公舉為參謀部長。
此時，清朝政府還沒放棄抵抗，受清廷之命的海軍提督薩鎮冰令海軍司令黃鍾瑛領3艘巡洋艦、2艘魚雷艇、8艘炮艦增援武漢清兵。但他聽到九江獨立，擔心燃料和糧草不濟，慌忙駛向上海，不料經過九江時，被金雞坡炮台的大炮一陣狂轟。無奈之下，黃鍾瑛命部下打旗語表示合作。馬毓寶、李烈鈞知道艦上官兵多是福建人，便下令停炮，並派出也是福建人的參謀龔少甫上艦遊說，各艦聽後表示願意加入革命軍。
在商會擺設的歡迎宴上，黃鍾瑛突然放下酒杯拍案而起，令同來的軍官立刻回艦準備作戰。原來是馬毓寶趁海軍軍官赴宴，偷偷派金雞坡炮台司令登艦拆了艦上的炮閂。李烈鈞見氣氛緊張，暗示龔少甫出麵打圓場。就在海軍怒氣稍平時，炮台司令又盛氣而來，李烈鈞忙笑臉介紹雙方，複入座。第二天，李烈鈞派人將炮閂送回，海軍也送來艦上的幾十挺機關槍和步槍，事件平息。就這樣，清廷的全部海軍在九江參加革命，李烈鈞成了海陸軍總司令。
四、九江光複 萬眾歡騰
1911年10月23日（農曆九月初二），同盟會會員林森、蔣群、吳照軒、張魯瑋等聯絡軍、學各界，剪掉了第五十三標標統馬毓寶的辮子，逼其下令全標起義，響應武昌，宣告九江獨立。馬毓寶為了活命，接受了革命黨人的要求，命令第五十三標起義，並規定了三條紀律，即“不擾害租界教堂”“不擾害人民”“不加害非敵對滿人”等。接著，起義軍很快就攻下道府兩署，道台保恒、知府璞良聞聲匿跡，不知去向。
從當晚9點至12點，起義新軍相繼攻占了道、署兩衙，24日上午8時，起義軍進攻坐鎮九江的清提法使行轅，其衛隊40人歸順新軍，城內外的警兵同時響應新軍起義。至此，九江道台保恒和九江知府璞良聞聲攜家眷逃走，其他零散清軍，見大勢已去，不敢抵抗，都先後加入起義隊伍，這樣九江起義就兵不血刃取得了勝利。清軍在九江的江防、陸防、警界武裝相繼瓦解，九江城鄉全部光複。革命軍公舉馬毓寶為都督。25日，馬標統移居道署，稱中華民國駐潯軍政分府，分軍務、政務二部。軍務部由馬自己負責，政務部公推羅大佺負責。當時軍政府官員共80餘人。起義清軍宣布脫離清政府，並照同盟會會章，升起青天白日旗。不久，九江軍政府成立，公推馬毓寶為九江都督，蔣群為幫辦兼參謀長，林森為民政長。林森因“須主持同盟會方麵的工作，沒有就事”。不久李烈鈞到九江，蔣群慨讓參謀長一職給他。據1911年11月18日日本筱本警士向日本駐漢口總領事報告的《九江事情》記載，當時軍政府主要成員是：
駐潯軍政分府都督：馬毓寶
參謀處參謀總長：李烈鈞
政事參謀官：蔣群、吳照軒
軍事參謀官：潘世遠、劉世鈞、範增福、何文斌、唐作模、祚禎
憲兵部總部：廖柏琅
執法部部長：張宗林
運送部部長：張榮嶼
籌糧局局長：顧英
軍機局局長：柳國璋
聯隊統帶：第一聯隊大隊長：範增福（兼）
第二聯隊大隊長：何文斌（兼）
第三聯隊大隊長：李定魁