十五年（壬子）夏四月初三日，流賊張獻忠陷廬州府舒城縣，殺人殆盡（賊改舒城縣為得勝州）。
五月初七日，學臣徐之垣科考廬州府八屬，生童俱集城內，失於稽察。獻忠率群賊自桃集走小路，由小蜀山，夜至城下。自將軍廟攀堞入城，開西門放群賊入城，殺擄焚奸，殺人幾十萬口。而學臣徐之垣、知府鄭履祥、知縣潘登貴鹹逃去。兵備道蔡如蘅（字香君，四川人）遇害。其妾王月大罵，八賊殺之，屍立不仆，移時方倒。通判趙興基守水西門，朝衣朝冠，罵賊不屈被殺。鄉紳參議程楷（畸人）罵賊被殺。指揮同知趙之璞遇害。軍民婦女死節者不可勝紀。賊殺掠三日去，臭聞數十裏。食屍之鳥鳶蔽天，磷火晝見，夜多鬼哭，聲達於旦（廬州衛百戶李禺花同矮李百戶等四弁，具冠帶，朝流賊張獻忠於鼓樓南街富戶孫煇之家受招安。八賊每弁賞銀千兩，令其安撫百姓。封李禺花為都指揮使。禺花受職得銀即遁去。八賊大怒，大殺百姓。民無噍類者，實李禺花等釀之也）。後又二次入城，民無噍類矣。田地荒蕪，狐兔之跡滿路，令人不忍見聞，雖黃巢、龐勳之惡，不逾是也。
流賊自八年正月略廬、鳳等處，至十六年始入楚、蜀。賊首八大王張獻忠率大傻子劉通、隔裏眼孫仁（乃群賊中之最惡毒者）、老回回馬守應、一棵蔥王文、滿天星劉煥、小袁營張三貴、闖塌天韓國基、曹操王羅汝才、紅狼劉希堯、過天星徐世福、混十萬劉國龍、一鬥粟孫承恩、紫金梁馬進孝等賊，率從賊數十萬人，侵擾廬、鳳、桐、潛、滁、和諸州邑，焚殺擄略奸淫，不可勝言。屍橫遍野，白骨如麻，江北無完城。田地荒蕪，草萊沒人。村絕煙火，路斷行人。殘黎逃竄山穀水涯，食草根木皮，饑寒而死者，又不可以數記。雖有總漕朱大典、閣部史可法暨總兵參遊率兵援剿，每於賊去後方至，見賊先走，從無一當賊者。諸州官吏並無守禦之策，惟有聽其殺擄飽去而已。朝廷並未發遣一將一卒，百姓湯火，付之膜外，豈不傷哉！其閑臣死忠、子死孝、夫死義、妻死節者多矣，俱淹沒無聞，烏得而表揚之？雖有旌獎者，百中無一焉。即有旌揚，皆官室富家，多粉飾之詞，不足深信。幸是秋七月上旬，上命總兵黃得功同劉良佐、廖應登等率兵五萬餘人，援剿流賊，招撫殘黎，分鎮廬、鳳等處。黃得功駐劄廬州府，劉良佐駐紮壽州。流賊率眾入英、霍山中。賊雖去而官兵害民更勝於流賊，故民間有賊梳兵篦之謠。賊雖殺擄慘毒，猶有去時，亦有不到之地。兵之殘害，搜括一無遺漏。小民恨入骨髓，相詛雲：寧忍死於賊，不肯死於兵！是則小民前罹賊之火燒，而後複遭兵之湯燙。奈何民受湯火，國亦隨亡。
闖賊李自成於十四年再攻開封府，不克。是年，複合群賊百萬圍之。上出侯恂於獄，督師河上。調左良玉各鎮共十三鎮援開封，壁於朱仙鎮（在府城南四十裏）。良玉持兩端，不肯當賊。忽夜半，縱兵大噪突諸營。諸營驚亂，疑賊至。良玉乘亂，掠諸營馬羸潰而去。賊覘擊之，大敗，諸營悉潰。良玉走襄陽。自是開封援絕，遂至淪沒。或謂良玉擊賊不勝，敗去，蓋飾詞也。
九月九日，闖王李自成、曹操王羅汝才，二人合圍開封府，脅從之賊近百萬。賊掘黃河之水衝開封。十六日，大水衝開曹門。十七日，滿城成渠，人民溺死無算。止存鍾樓、鼓樓、各王府屋脊、相國寺寺頂、周王紫禁城及夷山頂。避水者滿屋脊。十八日，推官黃澍遣善泅家丁李用過河請救。監軍道王燮得推官手書，自乘二十餘舟，從北門揚帆人。值巡撫高名衡、黃推官各乘舟至紫禁城上，見周王慟哭，請王同宮眷五六百人同行。在城頭屋角樹杪避水難民俱漸次渡河北去，在柳園鬻粥食難民。此古今未有之苦，亦古今未有之厄也。知府吳士講，合肥人，乘筏去，回鄉，後論功升川南道，懇辭不仕，隱於田野終身。
上以禦史楊仁願言，誡廠衛羅織。未幾，吏科給事中阮震亨有請托書至吏部文選司，為東廠所獲，奏之。廠衛之設，實不便廷臣。
晉劉宗周左都禦史。上言祖製設紅凳二條，責禦史之不稱職者，請複之。上可其奏。於是禦史人人側目，未幾罷去。
大內宮殿鴟吻如煙霧蒙罩，命中官登視，乃蠛蠓也。數日方散（蠛蠓，小飛蟲，謂之醯雞，生於朽壞之木。因久雨而生，睹陽則死。今生大內，亦不祥之兆也）。
黃道周既遣，人謂必不能生還。一日，上禦經筵，問儒生品行學問孰優。眾以道周對。上曰：道周何在？對曰：在戍所。上默然。明日，遂詔還道周，仍為少詹事。野史雲，上與周延儒論嶽飛，延儒乘間言之，故有是命；謊言也。
山東土賊李青山作亂，勇衛營督理太監劉元斌剿平之。禦史王孫蕃參其殺良冒功。上怒，逮元斌下刑部，論死，並誅提督太監王之民，即前為司禮監者。
殺兵部尚書陳新甲。先是新甲密建和議，撤關寧勁旅並力剿賊。輔臣泄其語，科道交劾，遂殺之。新甲，樞臣中最有謀略者。乙榜出身。為人所忌，功未成而被殺，傷哉！惜哉！
十一月，京師戒嚴。是時十七路總兵入援，兵馬數十萬。首輔周延儒督師。以大同總兵王璞為前鋒，克期進兵。璞引兵遁去，致誤軍機。次年四月解嚴，命緹騎逮璞至京，誅之。
兵部侍郎金之俟（字起凡，吳江人）督治昌平。上命錦衣衛訪之，悉得其守禦方略。召之俊來平台。之俟大懼，入朝麵無人色。廷臣皆危之，私語曰：此袁崇煥之續矣！及見，上溫言慰勞曰：卿某事善，某事善，但守某處將不善，宜易，糧草積某處者非是，宜徙。之俊惶恐伏地謝。及出，汗流至足、如更生焉。身顫終日，食飲無味。國變從賊，後仕於清，入閣為大學士，晉太傅。蘇郡鄉紳贈以聯雲：從明從順從清，三朝之俊傑；縱子縱孫縱仆，一代超凡人（此鄉人之確評也）。
三大營領之者，總督、提督、協理。外有四衛營軍，以龍驤左、龍驤右、武驤左、武驤右四衛官軍充之，為朝廷禁旅，以禦馬監掌印太監為提督。後曹化淳領之，改名為勇衛營，以黃得功、周遇吉為將，練為戰兵。又有巡捕營，專司捕盜，以五府帶俸都督為提督。後添設內臣一員，名為內提督，以王之俊（字奇吾，容城人）為之，亦練為戰兵，改名練捕營。襄城伯李國禎請選京衛各官蔭襲舍人六千充護衛，名選練營。總計京營兵約數十萬人，而可用者獨勇衛營。其後亦無用。後逢瞎賊，則束手而降。
十六年（癸未）四月朔，享廟；駕未出，中極殿左忽起旋風，有白衣人隨風而出。宿衛軍校皆隨風向東南行，至大通橋二閘而止。自此瘟疫流行，日死萬餘人，城門雍擁，千棺不能出。黃昏街衢人鬼相雜，遇白衣者必死。識者以為不祥。次年，都城陷沒。國家將亡，必有妖孽，信不誣矣。
五月，雷震奉先殿，太祖神主移禦床數寸。同日震鑾駕庫。上天震怒，由諸奸臣招之也。
上禦門嚐朝，鴻臚寺引安慶巡撫中軍官範邦禎麵恩。其人宿酒未醒，言語模糊，伏地叩頭不起。命錦衣衛拏出，袖攜酒壺墮地。上怒，禦中左門親鞫之。邦禎自供，乃運糧把總，用賄三千金於兵部，謀陞此缺。下錦衣衛獄，未幾死。兵部尚書戴罪，職方司郎中降罰，書吏下刑部治罪。
上一日召周延儒至平台，屏左右曰：朕夜夢太祖寫一有字，是何祥也？廷儒沉吟良久曰：不祥！上曰：何故？對曰：上不成大，下不成明，大明去半矣！上曰：密之！不懌而退。延儒出，即語閣臣。堂吏葉盛枝聞之，出語所親，諠傳都下。堂吏徐文煒叩闕訐奏。上怒，遂有殺延儒之意。及文選司郎中吳昌時（嘉興人）事敗，逮至京，賜死。延儒兩入相，受恩最深，而壅蔽聖聰，奸貪誤國，一死不足伏其辜矣。延儒與嘉定侯周奎通譜，嚐使客董山人（號心懷，後為盜所殺）懷重寶，與奎子監博，故意負之。監喜，時時與燕飲，遂得探內廷消息，凡事先意逢迎，其奸多類此。