正文 第二十三章 質粒DNA的提取和純化(2 / 2)

實驗材料

(一)材料:攜帶質粒的大腸杆菌菌株。攜帶四環素抗性和氨苄青黴素抗性基因。

(二)器材:台式高速離心機及配套塑料離心管,微量移液器及其配套吸嘴,旋渦振蕩器,高速離心機、恒溫空氣振蕩器,常規生化玻璃器皿,電泳儀及電泳槽。

實驗內容

(一)質粒DNA的小量製備

1.將2ml含有氨苄青黴素的LB液體培養基加入到無菌15ml試管,接入單一菌落,於37攝氏度條件下振蕩培養過液。

2.取1.5ml培養物加入到1.5ml管中,室溫下10分鍾,去除上清液。

3.用乙醇洗滌雙鏈人沉澱,離心5分鍾,棄上清。在空氣中將DNA沉澱幹燥10分鍾。

4.加入50mlTE溶液重新溶解DNA沉澱。

5.用瓊脂糖凝膠電泳檢測質粒,或利用紫外分光光度計檢測所抽提的質粒的濃度。剩餘溶液於41保存。

(二)質粒A的大量製備

1.取小量製備保存下來的30ml含目的質粒的細菌溶液加入250ml含氨苄青黴素的LB液體培養基中,37攝氏度劇烈振蕩培養3小時。

2.加入氯黴素溶液溶於乙醇,劇烈振蕩(300轉/分)培養12~16小時。

3.再入10ml溶液1及10ml溶菌酶液。

4.加20ml新配製的溶液,顛倒離心管數次充分混勻,於室溫下放置5~10分鍾。

5.加入15ml冰預冷的溶液,充分混勻,此時應不出現明顯的兩個液相,置冰上10分鍾,形成白色絮狀沉澱。

6.用4層無菌紗布將上清過濾到另一離心管中,加0.6倍體積異丙醇,充分混勻,室溫放置10分鍾。

7.加入5mlTE溶解質粒DNA,零下20攝氏度保存。

(三)質粒DNA的純化

1.在大量製備所得的質粒人溶液中,加入DNA溶液中,37攝氏度保溫2—3小時。

2.加入SDS至1%,68攝氏度水浴30分鍾。

3.加入溶液,冰浴1小時後,4攝氏度,離心20分鍾。

4.將上清液轉至另一離心管中,加適量PEG溶液充分混勻,4攝氏度過液。

5.4攝氏度離心25分鍾,棄上清。

6.沉澱溶於10mlTE溶液中,依次用酚:氯仿和氯仿抽提一次。

7.將水相轉至另一離心管中,加入2倍體積無水乙醇沉澱DNA。

8.4攝氏度離心5分鍾,棄上清。

9.加5ml70%乙醇洗滌沉澱,再離心5分鍾。

10.棄乙醇、室溫下瓶口向下使乙醇揮發。

11.加入1mlTE溶液溶解沉澱。

12.取5~100進行瓊脂糖凝膠電泳檢測或紫外分光光度計檢測質粒DNA濃度。

注意事項

1.苯酚腐蝕性很強,可引起嚴重灼傷,操作時應帶手套,如若濺到皮膚上,應立即用大量水清洗:並用肥皂水洗滌,切忌用乙醇。

2.實驗所用的離心管、微量移液器吸嘴以及試劑均需消毒至無菌狀態。

3.偶然情況下,小量製備物中無質粒DNA,一般是DNA沉澱隨同乙醇一起被棄去,操作時應十分小心。

4.如進一步對質粒DNA進行限製酶切時,發現質粒DNA不能被限製酶所消化,可能是質粒核酸沉澱中含有較多雜質,如蛋白質等。可用酚氯仿(1:1)溶液進一步抽提。