3）係統工具欄
菜單欄的下方是係統工具欄，工具欄實際上是菜單欄菜單中的部分內容，但使用工具欄能更加快捷的進行一些常用操作。
用於啟動/關閉設計管理器。
用於打開一個已有的設計數據庫文件，文件的後綴名除了可以是“.ddb”外，還可以是“.sch”或“.pcb”。
用於打開各種幫助信息。
4）狀態欄和命令欄
（1）狀態欄
界麵底部的狀態欄，它分為左、中、右三個部分，左邊一般顯示當前光標所在的坐標，中間顯示當前的操作，右邊以百分比顯示當前進行的操作進度。
（2）命令狀態欄
命令狀態欄，它顯示當前正在執行的命令。沒有新建或打開任何文檔，也沒有進行任何編輯操作時，命令狀態欄中會顯示“Idlestatereadyforcommand（空閑狀態，等待命令）”。
用Protel99SE設計印製電路板的一般步驟
對於印製電路板設計的初學者，首先要麵臨的問題就是整個的設計工作究竟包括哪些步驟，在設計軟件中從什麼地方入手，各個步驟、模塊之間是怎麼銜接的。因此，在利用Protel99SE設計印製電路板之前，有必要簡單了解以下PCB設計的一般步驟。
1）設計電路原理圖
設計電路原理圖是進行電路設計的第一步，也是最重要的一步。電路原理圖的設計是否正確、結構是否嚴謹將直接影響到產品的使用效果，且由於在Protel99SE軟件中，繪製電路原理圖是進行後麵各種工作的前提，故電路原理圖的設計工作就顯得尤為重要。
2）生成網絡表
當我們設計好電路原理圖，並進行了ERC電氣規則測試正確無誤後，就要生成網絡表，為PCB布線做準備。網絡表文件是電路原理圖與印製電路板之間的連接橋梁，通過Protel99SE進行自動布線時，必須先將網絡表文件導入，然後才能進行下一步的工作。網絡表文件可以直接在原理圖編輯器中通過電路原理圖生成，也可以在文本文件編輯器中通過手工編寫。
3）設計印製電路板
從生成的網絡表中獲得電氣連接以及封裝形式，並通過這些封裝形式及網絡表內記載的元器件電氣連接特性，將元器件的管腳用信號線連接起來，然後再使用手工或者自動布線，完成PCB的製作。這一步是進行電子產品設計工作的一個重要步驟，其質量將直接影響到產品的性能。因此，在整個設計工作過程中，印製電路板的設計工作是一個不容忽視的工作環節。
設計電路原理圖
設計電路原理圖的準備工作
1）新建一個設計數據庫
在Protel99SE中，要想設立一個設計項目，首先要新建一個新的設計數據庫文件（數據庫文件的後綴名為“*·ddb”），然後才能在這個設計數據庫文件中建立各種設計文件，如電路原理圖文件（後綴名為“*·Sch”）、印製電路板文件（即：PCB文件，後綴名為“*·PCB”）。
啟動Protel99SE後，選擇“New新建”選項，隨後就會出現的“新建設計數據庫文件（後綴名為“*.ddb”）的自定義選項”對話框。
在該對話框中，選項是文件存儲類型選擇框，單擊右邊的下拉箭頭即可進行選擇，在通常情況下選擇默認值即可；選項是新建的設計數據庫文件名稱，用戶可以根據自己的需要在該選項後的編輯框中設定設計數據庫名；選項是數據庫文件的保存路徑，該選項下麵的路徑是係統默認的路徑，用戶若想改變保存路徑，可以單擊按鈕，在的“保存路徑”對話框中選擇自己需要的保存路徑。
將以上自定義選項設置完畢後，單擊按鈕，就會完成設計數據庫文件的創建工作，此時Protel99SE的工作界麵就會變成的新建設計數據庫工作界麵。
2）啟動原理圖編輯器
新建了一個設計數據庫以後必須要先啟動原理圖編輯器才能進行電路原理圖的設計工作。下麵就介紹一下怎樣啟動電路原理圖編輯器。
選擇“New……新建文件”按鈕，則可以打開的“NewDocument（新建設計）”對話框，在該對話框中雙擊圖標（也可以單擊該圖標，然後再單擊按鈕）即可進入的原理圖編輯器的工作界麵。
3）設計原理圖的一般步驟
一般來講，進入原理圖設計環境之後，需要經過以下幾個步驟才算完成原理圖的設計。
（1）圖紙設置：包括設計圖紙的尺寸、標題欄、網格和光標的設置等。
（2）製作原理圖符號、加載元器件庫：很多元器件在protel99SE元器件庫中並沒有收錄，這就需要用戶自己繪製這些元器件的原理圖符號，並最終將其應用於電路原理圖的繪製過程中。加載元器件庫是將所需元器件庫設置為當前元器件庫，這樣才能在設計過程中調用該元器件庫中的元器件。