羅德裏戈-鮑吉亞是由叔叔、教皇卡利特斯三世引上神職之路的，後者任命他為紅衣主教兼教堂副主管；後來羅德裏戈一直登上了教皇寶座，成為教皇亞曆山大六世；然後他又任命自己的私生長子吉奧瓦尼為公爵兼紅衣主教，其私生次子愷撒為大教主；傳說其女兒盧克西婭第一個孩子的父親不是羅德裏戈就是愷撒。在當時羅馬世俗政權淪入腐敗貧困之時，梵蒂岡羅馬教廷就成為了暫時的權力中樞。
後來，吉奧瓦尼死於暗殺，很可能就是被愷撒殺死的。當其父去世之後，愷撒就被新教皇流放並關押，很快也死於非命。
為了對被謀殺的吉奧瓦尼有所補償，他的兒子胡安-鮑吉亞於1671年被封為“聖徒”———聖弗朗西斯-鮑吉亞。
15世紀的鮑吉亞家族堪稱最早的黑手黨家族。他們和如今所有黑手黨家族一樣隻顧自己的利益，用不義之財鋪路，而且殺人不眨眼。但在宗教方麵，他們卻擺出偽善的樣子，他們家的暴徒幾乎從來都沒有錯過一次彌撒。羅德裏戈-鮑吉亞當上了教皇亞曆山大六世，他的統治期以謀殺、貪婪和****聞名於天下，而他是曆史上最為聲名狼藉的教皇之一。他崛起的過程，造就了他波瀾壯闊的職業生涯中最令人毛骨悚然的一章。
羅德裏戈-鮑吉亞早就聲明自己具有成為文藝複興時期偉大教皇的素質。據說他第一次殺人時才12歲，那次他用刀子捅死了一個同齡的男孩。他的叔叔，教皇卡利斯圖斯三世在羅德裏戈25歲的時候任命他為紅衣主教，並給他謀了個教廷副大法官的職位，讓他在教廷中初步確立了地位。托他叔叔的福，羅德裏戈的腰包很快地鼓了起來。
當時有人寫道："他非常富有，而且他對各國國王和君主都具有很大的影響力。他已經在聖安傑洛橋和菲奧裏中心廣場之間的地段蓋起了一座美麗舒適的宮殿。他的巨額收入來自教廷的職位、他在意大利和西班牙擁有的修道院，以及他的3個教區瓦倫西亞、波圖斯和卡塔赫納……他的碗碟鑲著金飾，他的衣物都由繡花絲綢做成，他的藏書特別符合帝王或教皇的身份。我就不再贅述他那些豪華的床飾、馬具和其他的金銀珠寶、綾羅綢緞了，更不必說他擁有的大量金幣了。"
羅德裏戈-鮑吉亞的財產為他日後購買教皇職位的行動大開方便之門。同時，他把自己當做教廷的統治者，和情婦瓦諾紮-德-卡塔內（Vannozza de Catanei）過起了驕奢淫逸的生活。他先前的豔史已經給他留下了不少孩子，而瓦諾紮在此後的20年裏又給他添了4個私生寶貝。其中的切撒爾-鮑吉亞（Cesare Borgia）和盧克利齊婭-鮑吉亞（Lucrezia Borgia）和他們的父親一樣成為了聞名遐邇的小黑手黨。
雖然羅德裏戈對瓦諾紮情深意切，但他對一夫一妻製還是退避三舍，一如他對禁欲主義的態度。他的叔叔卡利斯圖斯三世對他的醜事睜一隻眼閉一隻眼，但在卡利斯圖斯三世1458年去世以後，下任教皇庇護二世就覺得看不過去了。雖然庇護二世本人也在床上勤為耕種，並生了兩個孩子，但他仍然為紅衣主教鮑吉亞的行為感到震驚。
庇護二世在聽說了鮑吉亞某晚的縱欲狂歡之後提筆給他寫了封信："孩子，我們聞悉4天以前有幾個錫耶納的女人聚集在喬萬尼-迪-比齊斯（Giovanni di Bichis）的花園裏。她們簡直是人間放蕩的極品，而你則忘了自己的身份與地位，和她們從下午一直廝混到晚上。像你這般年歲的神職人員應該時刻把自己的尊嚴和職責銘記在心。我還聽說那天豔舞不斷，****聲聲，而你對這一切則相當駕輕就熟。提到這些事情都讓我覺得羞恥，不但因為這種行為本身性質惡劣，而且它和你的地位極為不相稱。你為了滿足自己的****，把那些女子的丈夫、父親、兄弟和其他親戚攔在了門外……整個錫耶納城都在談論那個荒唐之夜……我的不快已經無法用語言形容……紅衣主教應該是潔白無瑕的。"