燕王奉太孫朱文至進入京城後，因皇宮大火，許多宮室都被燒了，便隻草草收拾了前頭大殿的幾處房屋，以作太孫下榻之所。其餘房屋，就隻能等到日後再整修了。至於燕王本人，他在京城裏原有一處府第，雖然多年未住人了，但他長年在外征戰，本是武將性情，倒也不介意。
燕王大軍攻入皇城時，太孫還帶著隨從遠在百裏之外的後方，接到燕王急信日夜兼程趕來，身體已經頗為勞累了。但他看著自小長大的宮院，心裏也是感歎萬千。宮人中有不少仍然感念悼仁太子夫婦的舊人，聞訊趕來拜見，他一個一個認下去，說起往事，心中十分傷感，當即便留下了幾個曾經侍候過先帝元後——也就他親祖母的老宮人，至於其他內侍宮女，則全交由胡四海打發了。他雖是個仁善的性子，卻不是傻瓜，燕王再三提醒他要小心宮中還有建文餘黨，他當然不會讓自己陷入危險之中。
這撥宮人離開後，太孫才有空歇口氣，這時候，燕王來了。
燕王是請他到大殿上朝去的：“大軍入城已有兩日，但京城臣民還有些人心惶惶，尤其是當年你父親慘死，但凡是站在他那邊的人家都落難了，剩下的這些勳貴都是袖手旁觀甚至是落井下石的，除去臨國公石家在去年重又投向我們，其他人都有些心虛，又有建文提拔起來的幾家人，都擔心你會秋後算賬呢。雖說他們可惡，死不足惜，但眼下還是以大局為重，陛下且忍讓著些，等日後局勢平定下來，再慢慢收拾他們不遲。”
太孫忙道：“王叔言重了，侄兒怎會不知道事情輕重？況且侄兒本來也沒打算對他們從重發落。”說罷歎了口氣：“當年建文帝奪位，有多少世家勳貴一夕之間敗落？死的人更是不計其數，侄兒絕不會學他那樣暴虐！”
燕王微笑道：“這怎麼一樣呢？陛下宅心仁厚，卻也要賞罰分明，這不是天子一怒，伏屍千裏，而是讓罪有應得之人得到他們該得的下場。否則，人人都以為自己即使背叛君主，也能依仗君主的仁慈逃得性命，日後哪裏還會有敬畏之心？”
太孫聞言肅然：“王叔說得對，是侄兒想岔了。”
燕王擺擺手：“陛下還年輕呢，難免有些思慮不周之處，算不得什麼。臣已經命人傳召文武大臣上朝，一會兒陛下就去露個麵，宣布幾件事，安撫一下他們，就把他們打發走吧。接下來還要預備陛下登基之事，有的是事情要忙呢。”
太孫忙應了，又問：“要宣布什麼事？”
燕王答道：“第一件事，就是對朱允炆的處置。如今明麵上他下落不明，隻說他拋下生母兄弟和子嗣逃走了就是，臣已經備好了詔書，陛下盡管廢了他的帝位，重新降為越王，再命宗人府審理他逼父弑兄篡位之罪，多多數上十幾二十條罪名，廢去他的王爵，並公布天下，也叫世人知道他罪無可恕，死有餘辜。”
太孫聽出幾分不對：“明麵上下落不明？那實際上……”
燕王輕咳一聲，見殿內隻剩下自己和太孫以及胡四海三人，便壓低聲音道：“宮中起火時，翰之帶人秘密潛了進來，命臣安插在宮內的人手幫著將朱允炆誆到此處綁起來，燒死了。翰之和他身邊的人都親眼看著朱允炆被燒成黑炭，確認無誤。”
太孫吃了一驚：“弟弟怎能冒這麼大的險？！”但他對於大仇人的死還是很高興的：“好弟弟，他總算為父親母親報了仇了！隻是為何不等我一等？我也想親手殺了朱允炆！”
燕王歎道：“這事兒是他自作主張，事後還特地來向臣請罪。他說，朱允炆雖是你們兄弟弑父仇人，但他身份在那兒，論血緣又是你們親叔，若讓你進城後，再將他處死，總會有多管閑事之人跑出來說嘴，指責你不該殺叔，到時候豈不是叫你為難？倒不如象如今這般，悄悄兒把人解決了，外頭人也不知道，隻當他早已逃走，日後即便是下落不明，也沒人會再怪你。這是他做弟弟細心之處，雖有些莽撞了，但臣也不好說他什麼。”