盡管王安石又重登了相位的寶座，可擺在他麵前的路並非像之前那麼好走。辭相之後朝政被呂惠卿搞得烏煙瘴氣，留下的這個爛攤子還要王安石來收拾。這次他遇到的就不僅僅是變法的問題，還有如何改善黑暗的朝政狀況。王安石的複出使得變法派重拾信心，而對反對派來說，之前的一切努力都已白費。但他們仍不甘心，因為他們明白，隻要出現類似上次的流民事件，再次罷黜王安石也不是沒有可能。的確，盡管王安石的複出使得當時朝廷的風氣好了很多，可是擺在他麵前不爭的事實是，他和神宗之間已經出現了裂痕，關係變得很微妙，無論他再怎麼努力，隻要神宗的一句話，王安石的變法就有可能付之一炬。所以這也是他所一直擔心的。
他在自己的相位上小心翼翼，生怕自己出一絲錯誤會影響到變法。盡管如此，反對派還是抓住變法帶來的不良影響不放，隻要一有機會，他們會不惜一切代價的扳倒王安石。反對派的人不停地上書給太皇太後和皇太後，訴說著百姓們的生活是如何的淒慘，鄉間田野是如何在議論變法，如何議論王安石。原本是一件很小的事情，但經過反對派的添油加醋以後就歪曲了事情的真實麵目，為了扳倒王安石，反對派無中生有，硬說王安石變法違背了列祖列宗的遺願，若繼續實行，江山最終將毀於一旦。太皇太後和皇太後在經受了反對派群臣的苦諫後，也為大宋的設計的著想，不斷地勸說神宗皇帝廢除新法，貶斥王安石。
太皇太後是仁宗皇帝的皇後，今已是七八十歲高齡的老人了。盡管是一屆女流之輩，但她無時無刻不關心著朝政。直到有一天，神宗和母親高太後，弟弟岐王趙顥一起去看望她。聊了幾句家常之後，太皇太後立即切入了正題：“聽說百姓苦於新法，確有其事嗎？”已經為此事焦頭爛額的神宗聽到這話很惱火，他隻好悻悻地說道：“行此法非害民，而是利民。”太皇太後接著道：“王安石固有才學，然百姓苦於新法已久，若不對此作出交代，何以對得起天下百姓？”在一旁的弟弟趙顥也按捺不住說道：“還請陛下三思。”
神宗忍無可忍，大發雷霆說道：“你的意思是說朕無能，敗壞了宗族法製嗎？那朕不幹了，這個皇位你來坐吧。”聽了這話，趙顥氣的失聲痛哭。場麵十分的尷尬，大家都不再說什麼了，一場家庭會見就這樣不歡而散了。
神宗雖然沒說什麼，可太皇太後的話還是給他敲響了鳴鍾。他也知道，太皇太後平常說話很有節製，不到萬不得已，她不會有此舉的。神宗亦明白，如果不對此事作一交代，他有何顏麵對得起列祖列宗，有何顏麵對的起天下百姓呢？即使再怎麼不舍，可他也不能為了一個王安石而得罪天下人。他必須做出抉擇，縱使有千般萬般理由……
第二節辭相成功，告老金陵
就在王安石罷相、複相的這段時間，王安石的兒子王雱因背疽早逝，死時才三十三歲。王雱是王安石的長子，自小聰慧過人，深得王安石的寵愛。進士及第後，他與父親同朝為官，共同修撰三經。王雱的死無疑又在王安石的傷口上撒了一把鹽，傷痛自不待言。此時的王安石對兒子王雱的死深感痛惜，這不僅使他視富貴如浮雲的觀念更加強烈，且對人生如夢，轉瞬即逝的思想有了更加深刻的認識，這更加堅定了王安石辭相歸去的決心。
王安石第一次罷相雖說是出於自願，但不免有怨恨之情，但第二次罷相卻隻有無限的遺憾與輕鬆。他是解脫了，可這代價也太大了，為了變法，他付出了一生的心血，甚至也犧牲掉了愛子，可換回的卻是無盡的傷痛和天下人的謾罵，沒有人能理解他。
其實，自從王安石登上相位的那一天，就注定了他要以悲劇收場，在這場前無古人後無來者的大變法中，皇帝是帥，他是將，按照人們傳統的思維，皇帝是天之驕子，聖明如神，是完美的化身。在這場變法中，如果取得了什麼成就，首要功勞肯定要歸功於皇帝，而如果出現了錯誤，王安石理所當然的就成了替罪羔羊。
在王安石離開京城之前，他最後一次去麵見神宗皇帝。當兩人單獨在一起的時候，兩人都心知肚明，他們再也回不到過去了，君臣叱吒風雲的時代已經結束了，而王安石作為臣子，要永遠地為大宋王朝做替罪羊，來承擔來自全社會的巨大壓力。
神宗皇帝充滿了內疚，兩人遲遲默不作聲，大殿裏的空氣都凝固了。最後還是皇帝先開了口，說道：“愛卿這次雖離職，但變法還要繼續，等到風平浪靜之時，朕還要請愛卿回來主持朝政。”
王安石強擠出了一絲苦笑：“臣真的累了，這些年來為了變法確實耗盡了心力，真的撐不下去了。如今老臣終於可以安心地休息了，說真的，臣期待這一天也很久了，唯一讓臣不放心的就是變法大業全部要靠陛下了，今後陛下一定要多多注意身體。”
神宗戀戀不舍地對王安石說道：“愛卿走後，朕就好比失去了左膀右臂，沒有了愛卿，今後誰還能與朕徹夜長談國家大事呢？”
皇帝歎了口氣：“愛卿這一走，不知何時才能相見，願愛卿回金陵後好好調養，朕也不知道該送什麼給你，就賜你黃金百兩，你就不要在推辭了。朕知道你為官清廉，積蓄不多，這點錢全當是朕的一份心意。這次回去又要不少開銷，這點錢你可以拿著用，千萬不要苦了自己。”