停下來時，拿破侖想：還有什麼沒處理？對了，床罩下還有好些東西。他說：“我快不行了，時間已經不多，得馬上布置好後事。”忽然，他看到了奧斯坦的鑽石項鏈。當初，她出入杜伊勒裏宮盛會時，總是戴著這條項鏈，讓她增色不少。拿破侖離開馬爾梅鬆宮那天，奧斯坦親手將它縫入他的腰帶。現在，拿破侖把這條項鏈送給馬爾尚。那個金製鼻煙盒，拿破侖用最後的一點力氣，蓋上刻了自己名字的首字母的圖章，然後，把煙盒送給醫生，說道：“我鄭重地提出請求，為我進行屍解，對於胃部要仔細檢查。如果我的推測沒錯，我和父親死於同一種疾病。你可以從路易那裏得到我父親的病曆，把他與你的解剖結果比較一下。我之所以這樣做，是為了避免我的孩子也患上這個可怕的疾病。請告訴我的孩子，盡量預防，以免遭受與我相同的病痛。”六年間，島上的氣候令拿破侖情緒煩躁，他的肝痛也與此有關。幾天前，他還在指責英國人，竟然讓他住在這樣的島上，無異於謀殺。可是，他現在為什麼要求解剖屍體？這不等於否認了他之前的說法？他當然不會不明白，但是，為了兒子的安全，他隻能這樣做。他不希望孩子染上家族病。
接下來，拿破侖要給島上的政府發布公告。他開始口授：“總督先生，拿破侖帝王由於病痛的折磨，將不久於人世。茲將此事稟報於您……請貴國政府商量有關運送其遺體之事，同時考慮其隨從人員的返歐事宜。”
拿破侖說：“蒙托隆伯爵，你要在上麵簽字。”也許，這是他所有口授的命令中，最為精彩的一次。有誰能想到，久經沙場，敢於笑對死亡的人，在他離開人世時，可以坦然從容地安排後事，而且心境如此平和。
4月29日，拿破侖已經發燒了整整一夜，稍微清醒時，他又口授了兩份通告。一份談到如何利用凡爾賽宮，另一份是關於重建國民自衛軍的事情。他說：“我現在感覺很好，也許可以騎馬跑三十英裏呢。”可是，第二天，他就人事不知，陷入昏迷狀態，這樣持續了五天，直到去世。
在這五天的昏迷中，拿破侖偶爾有清醒的間隙，這都不會被他放過，抓緊一切時機發表宣言：“在我昏迷時，不管出現什麼情況，也不許英國醫生進來……你們必須忠於我的命令，不許做任何有損我英名的事。隻是，我的一生，弓拉得太滿……因此，法蘭西最終沒能實現我理想中的自由體製。不過，人民會理解我的心願。我相信，你們也會這樣，最後，請不要違背我們的準則，維護我們的英名！”
第二天，拿破侖頭腦中湧現出他的少年時代，科西嘉的往事一幕幕展現在眼前。忽而，兒子天真可愛的形象衝了進來，他對兒子的思念之情更加強烈。接著，他想到科西嘉島上有他的產業，馬爾尚一字不差地記下了他的口授：“阿雅克修那裏，有我的房屋及附屬建築，不遠處的鹽坑附近，有兩幢房屋暨花園，還有其他在阿雅克修地區的所有產業，都遺留給我的兒子。這大約有五萬法郎。我留給……”
這是拿破侖最後的一次口授。昏迷中，他仿佛看到了早年的戰友，大喊道：“德賽！馬塞納！勝利就在前麵！衝！快！我們……”
第二天，神甫主動來到這裏。在他衣服裏麵，好像有什麼東西不願意讓人看見。他說要與拿破侖單獨在一起，時間不長，他走出來說：“臨終塗油禮已經完畢。隻是，由於他胃的情形，其他聖禮不能進行。”
難熬的最後一夜！淩晨，拿破侖處在昏迷之中，蒙托隆聽到他在囈語：“法蘭西！……士兵們！……將軍……約瑟芬！”這是他最後的話。突然，他不可思議地從床上跳下來，緊緊地抱住蒙托隆，兩個人滾到地板上，伯爵都沒有辦法呼救。隔壁的阿香波聽到聲音，衝了進來，這才救出蒙托隆。也許，這是拿破侖最後的戰鬥，卻沒有人知道他要對付的是誰。
此後的一整天，拿破侖呼吸平穩。他好像要喝水，但已經無法吞咽。人們把海綿蘸醋放在他嘴唇上。屋外，正下著雨。屋內，一位昔日的伯爵，一個平民，守候在帝王的行軍床邊。
五點鍾，大西洋上風暴驟起，兩棵剛剛種下不久的大樹被連根拔起。與此同時，屋內的病人正在垂死掙紮，但是，沒有痛苦的表情。拿破侖的眼睛睜得大大的，凝視空中，仿佛在尋找著什麼。太陽西沉時，一代帝王停止了呼吸。
中午，耀眼的陽光，刺得人睜不開眼睛。拿破侖的屍體被放在書桌上，他靜靜地躺著，再也不會起來口授命令。周圍，有五名英國軍醫，三名英國軍官，另外，還有三個法國人。這裏成了臨時的解剖台，由安通馬爾基進行解剖。這個科西嘉醫生從拿破侖的身體裏取出肝髒，切開後，讓大家檢查，並解釋說：“各位，請看好，胃的潰爛部附著在肝上。我們可以得出什麼結論？那就是，聖赫勒拿的氣候，加重了胃的病情，陛下因此而早逝。”