當蔣介石提出組建“青年反共救國團”後，國民黨中央改造委員會根據蔣的指令，擬訂籌組原則，送請“行政院”核準後頒發，“行政院”轉飭“國防部總政治部”負責籌組，並派蔣經國為主任，胡軌、謂f東閔為副主任，負責於最短期內籌備完成。
“反共救國團”於1952年8月1日在複興崗設立了籌備處，並擬定了各項編製與計劃。為使工作計劃切實實施，籌備會一方麵召開各界青年座談會以尋求支持，同時開始訓練幹部。9月份還設立了指導委員會，“國防部”聘請張其昀、周至柔、郭寄嶠、穀正綱、程天放、吳國楨、陳雪屏、沈昌煥、錢思亮、劉真、任陪道、蔣經國等12人為委員，並於1952年10月3日上午9時舉行第一次團務指導委員會會議，決定多項重要議案。至此，籌備工作大致完成。
1962年10月31日，正值蔣介石65歲生日之際，由國民黨中常委蔣經國主持的“青年反共救國團”成立儀式在台北舉行。在成立儀式上，蔣介石說：
“青年反共救國團”的成立，“在反共抗俄救國救民的大道上，由此更邁進了一步”。他規定：“青年反共救國團”是一個“教育性的組織”、“群眾性的組織”、“戰鬥性的組織”。
蔣在講話中，句句不離“反共抗俄”，時刻企圖“反攻”。他成立該會的中心目的就是使青年成為他“反攻大陸”的突擊隊。當然他還有密不告人的第二個目的：讓蔣經國乘機網羅人才，培養班底，為其接班護航保駕。因此，他自兼團長，讓蔣經國出任“青年反共救國團”主任一職。
蔣經國接受任命後，既有惟我獨尊的感覺，又有誠惶誠恐的想法。他在成立大會上說：
“今天青年反共救國團成立了，並且由本人負責，我自己感覺非常惶恐，過去任何責任交給我，我都沒有像這次的感受。因為這個責任的確是重大而極緊要的；過去辦不好，還可以再來，這次辦不好，便沒有機會再來了，隻許成功，不許失敗”。
蔣經國還向新聞記者展示了“救國團”的團旗，並解釋團徽的造型是以綠色為底，中為青天白日，兩邊橫貫三根紅線：青天白日代表“國家”的靈魂、三民主義精神和“救國團”的中心思想；三根紅線代表青年勇敢、大無畏與犧牲精神。紅色表示青年的熱血與熱情，綠色象征青年有活力、有生氣、永遠青春、永不衰老、永不灰心與永遠勝利。蔣還說：“今天大家團結在‘救國團’的旗幟下，要擎著這麵大旗，向大陸進軍。”
“青年反共救國團”在其組織章程中，確定以下8款為該機構遵奉的信條： (1)“信仰三民主義”； (2)“擁護領袖”； (3)“服從命令”；
(4)“嚴守紀律”；
(5)“自立自強”；
(6)“實踐力行”；
(7)“互助合作”；
(8)“服務犧牲”。
如果讀者仔細研究一下，就會發現這8條純粹是蔣介石講話的翻版而已。它的基本宗旨就是要台灣青年為蔣氏父子效命，接受“反攻複國”的思想教育，成為國民黨的預備隊。
蔣經國還為“救國團”規定了四大原則：
(1)打破“個人利害為結合要素”的自私觀念，消滅“為滿足個人政治欲望而用幹部”的卑劣作風；
(2)打破士大夫觀念與升官發財的思想，轉移青年的權利爭奪為對大自然的戰鬥；
(3)打破鄙視勞動的落伍觀念，培養青年熱愛勞動、手腦並用的習性，在勞動中創造，在創造中成功；
(4)打破盲從和依賴的苟安心理，我們反對排外和媚外，要以自立自強的精神，為“國家”開辟光明的前途。
“青年反共救國團”除團長與主任外，另設兩個副主任，由胡軌和鄧傳楷擔任。總部下設秘書室，由蔣經國的嫡係大將李煥任秘書，其權限超越兩位副主任。秘書室之外，設有5個組，分別管理組織、訓練、文化、宣傳、青年服務、青年活動及其他事務。5組之中，以一、二兩組任務最重。同時，在每一縣市，“救國團”設立一支隊部，負責處理全縣市有關事務，其下每一中學(有高中學校)設一大隊，再下為分隊、小隊，和軍隊組織差不多。
蔣經國根據過去在贛南時期和重慶時期與青年接觸、工作的經驗，結合青年特點開展各項活動。
(1)出版大量圖書、雜誌。“救國團”第二組負責文化宣傳。該機構成立有幼獅出版公司、幼獅文藝、青年寫作協會等，共出版各類圖書、雜誌幾百萬冊。