中共甘肅省委、省政府的《決定》指出，當前甘肅省農村衛生工作的指導思想是：以“三個代表”重要思想為指導，堅持以農村為重點的衛生工作方針，深化農村衛生體製改革，加大對農村衛生事業的投入，發揮市場機製作用，加強宏觀調控，優化衛生資源配置，不斷滿足農村居民醫療衛生服務需求，整體提高甘肅省農村居民健康水平和生活質量。甘肅省農村衛生的目標是：根據加快建設小康社會進程和實現社會主義現代化建設第三步戰略目標的總體要求，到2010年，基本建立起符合甘肅實際的農村衛生服務新體係和新型農村合作醫療製度，主要包括：建立基本設施齊全的農村衛生服務網絡，建立具有較高專業素質的農村衛生服務隊伍，建立精幹高效的農村衛生管理體製，建立以大病統籌為主的新型農村合作醫療製度和醫療救助製度，實現農村衛生事業與區域經濟社會協調發展，使農民人人享有初級保健，主要健康指標達到全國平均水平。
總之，《決定》內容廣泛，意義重大，是中共甘肅省委、省政府對新時期農村衛生工作的根本要求，是新時期農村衛生改革與發展的行動綱領。各級黨委、政府要認真學習領會中央《關於進一步加強農村衛生工作的決定》和中共甘肅省委、省政府的《決定》精神，按照中央和省上的要求，采取切實有效的措施，力爭通過8年的努力，到2010年在全省農村基本建立起適應社會主義市場經濟體製要求和農村經濟社會發展水平的農村衛生服務體係和農村合作醫療製度。
三、突出重點，強化措施，推動農村衛生事業健康發展
農村衛生工作量大麵寬，各地、各部門要根據中央和省上的要求，以對黨、對人民、對事業高度負責的精神，從實際出發，認真研究製定具體措施和辦法，選準突破口和主攻方向，全麵推動農村衛生事業健康發展。當前，要重點抓好以下幾項工作。
（一）必須堅持預防為主的方針
根據甘肅省農村生產生活實際，必須把預防保健作為農村衛生工作的出發點和著力點。甘肅省農村地域遼闊，人口眾多，急烈性傳染病、地方病暴發流行的因素始終存在。近年來，一些新的傳染病如艾滋病等感染傳播加快，急性中毒事件明顯增多，地方病防治形勢仍舊很嚴峻，這些都嚴重威脅著農民的健康。最近在國內外暴發流行的非典型肺炎，對我們的疾病預防控製工作已經敲響了警鍾。我們必須堅持預防為主、防治結合，把重大疾病預防控製作為農村衛生工作的頭等大事來抓，著力提高處理農村重大疫情和公共衛生突發事件的能力，堅決遏製一些傳染病、地方病、職業病等重大疾病蔓延的勢頭。各級黨委和政府必須引起高度重視，要盡快建立公共衛生事件應急處理機製，做到一旦發現疫情，能夠及時掌握，有效防治，控製蔓延。要加強農村婦幼保健工作，采取重點幹預措施，有效降低出生缺陷發生率，提高出生人口素質。要在農村地區大力宣傳和開展愛國衛生運動，以改水、改廁為重點，加強衛生環境，加快實施“億萬農民健康促進行動”，普及疾病預防和衛生保健知識，幫助農民養成良好的衛生習慣和科學、文明、健康的生活方式。
（二）健全農村衛生服務體係，大力推進鄉村衛生服務管理一體化工作
各級黨委、政府要結合實際，加強宏觀調控，建立以公有製為主導，多種所有製形式共同發展的社會化農村衛生服務網絡。鄉（鎮）衛生院是農村衛生服務網絡的樞紐，是社會公益性事業單位。要抓住目前鄉（鎮）行政區劃調整的機遇，因地製宜，合理調整現有鄉鎮衛生院的布局。要繼續推進鄉鎮衛生院管理體製改革，鄉鎮衛生院的人員、業務、經費已由縣衛生部門管理，要總結經驗，鞏固成果；尚未改革的，各地要先搞試點，逐步推開，通過幾年時間全部理順。在改革體製、調整布局、轉變機製的基礎上，根據縣、鄉、村衛生機構的職能，製定基本設施配置標準。各地要加大投入力度，加快建設進度，確保到2010年基本完成縣級醫院、縣預防保健機構和鄉鎮衛生院房屋設備的改造和建設任務，保證開展公共衛生和基本醫療服務所需的基礎設施和條件，做到房屋、人員和醫療設備相適應、相配套。要適應社會主義市場經濟體製的需要，建立起新的管理體製和運行機製。積極推進運行機製改革，探索搞活衛生院的多種運營形式，實行全員聘任製，形成有生機活力的用人機製和分配激勵機製，促進鄉鎮衛生院服務水平的提高。對改製後的醫療服務機構，要加強指導、管理和監督。鄉村衛生服務管理一體化工作，在省衛生廳的積極推動下，已有了不同程度的進展，酒泉市、張掖市、華亭縣等地縣動手快、力度大，給全省帶了好頭，其他進展比較緩慢的地方要提高認識，明確思路，下決心把這項工作推向深入。